猪繁殖与呼吸综合征病毒GS株非编码区分子克隆及其一二级结构的分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 马友记

作者： 马友记;柳纪省;张利

作者机构：

关键词： 猪繁殖与呼吸综合征病毒;非编码区;分子克隆;序列分析

期刊名称： 甘肃农业大学学报

ISSN： 1003-4315

年卷期： 2008 年 03 期

页码： 19-23

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 参照GenBank中PRRSV VR-2332株全序列对非编码区(non-coding region,NCR)设计特异性引物,经过基因的扩增、连接、转化、筛选阳性克隆以及核苷酸测序.结果表明PRRSV GS株5′NCR长190 bp,与VR-2332和LV株核苷酸序列的同源性分别为93.2%和61.1%,紧接ORF1起始密码子上游有一个保守基序:5-′UUU-AACC-3′,其作用是连接5′前导序列与各亚基因组mRNAs;3′NCR长151 nt,其后有一个长14个碱基的poly(A)尾,通过序列比较分析,发现该区核苷酸序列较为保守,与VR-2332及LV 3'NCR的核苷酸同源性分别为95.4%和78.2%,在poly(A)尾巴的上游具有一个高度保守的8核酸序列:5-′CCGAAATT-3',在病毒的复制过程中,该保守基序可能起着重要作用.非编码区的二级结构分析发现其有复杂的二级结构.

分类号： S852.65

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