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巴氏蘑菇子实体不同发育阶段的转录组分析

文献类型: 中文期刊

作者: 卢园萍 1 ; 郭仲杰 1 ; 蔡志欣 1 ; 陈美元 1 ; 廖剑华 1 ;

作者机构: 1.福建省农业科学院食用菌研究所特色食用菌繁育与栽培国家地方联合工程研究中心

关键词: 巴氏蘑菇;生长发育;子实体;转录组

期刊名称: 菌物学报

ISSN: 1672-6472

年卷期: 2019 年 12 期

页码: 2161-2173

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为探讨巴氏蘑菇子实体不同发育阶段基因的表达情况,本研究对巴氏蘑菇子实体不同发育时期(原基、采收期和开伞期)进行转录组测序,以本实验室已获得的巴氏蘑菇JA菌株的不育单孢菌株JA-15036基因组为参考基因组研究原基与采收期及开伞期样本间差异表达基因,并对差异表达基因进行了GO功能和Pathway富集分析。GO功能分析结果显示,差异表达基因主要富集在跨膜转运、碳水化合物代谢途径和膜组分,它们协同调控为子实体生长发育提供稳定的内环境。KEGG富集分析结果表明,原基期上调的差异表达基因主要富集在核糖体蛋白和DNA复制,表明原基期细胞代谢旺盛,其中核糖体蛋白基因上调为后期蛋白质合成提供重要场所;采收期和开伞期子实体时期差异表达基因主要富集在碳水化合物代谢、脂肪酸降解和氨基酸代谢等途径,为巴氏蘑菇子实体的生长发育与成熟提供营养与能量。

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