文献类型： 中文期刊
作者： 戴建清 1 ; 陈文智 1 ; 曾志恒 1 ; 蔡志欣 1 ; 陈美元 1 ;
作者机构： 1.福建省农业科学院食用菌研究所/特色食用菌繁育与栽培国家地方联合工程研究中心
关键词： 双孢蘑菇;As2796;贴生菌丝;气生菌丝;转录组测序;差异表达基因
期刊名称： 福建农业学报
ISSN： 1008-0384
年卷期： 2024 年 39 卷 009 期
页码： 1023-1034
收录情况： CSCD
摘要： 【目的】挖掘双孢蘑菌落形态变化可能涉及的重要基因，为双孢蘑菇种质资源评价、新品种选育提供科学依据。【方法】以双孢蘑菇主栽品种As2796为试验菌株，收集同一平板上生长的贴生与气生菌丝，提取样品的RNA进行转录组测序分析。【结果】通过转录组分析，A601(As2796气生组)与A602(As2796贴生组)共鉴定出965个差异表达基因（DEGs）。GO富集分析结果表明，在真菌细胞壁组成方面有疏水蛋白相关的DEGs富集，其中AGABI2DRAFT＿13655、AGABI2DRAFT＿136569、AGABI2DRAFT＿193057属于ABH3蛋白基因家族，在气生菌丝的表达水平显著高于贴生菌丝，可能与气生菌丝的产生有关。研究还发现了疏水表面结合蛋白A(HsbA)相关基因AGABI2DRAFT＿194662在气生菌丝中FPKM表达水平为0，在贴生菌丝中为10.24。通过对DEGs进一步分析，富集到8个可能与脂酶同工酶相关的DEGs，气生菌丝中这些基因的表达水平显著高于贴生菌丝。SNP/InDel分析结果表明，As2796气生组SNP数为110 601，贴生组SNP数为111 188，单核苷酸变异中，C:G>T:A的变异次数较多，共筛选出2 374个共同InDel。【结论】成功获得双孢蘑菇不同形态菌丝的转录组数据，并从中挖掘出潜在的相关基因和SNP位点，为双孢蘑菇相关分子标记开发及辅助育种提供参考。
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