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工厂化和网箱养殖大黄鱼幼鱼消化道微生物群结构与功能分析

文献类型: 中文期刊

作者: 姜燕 1 ; 徐永江 1 ; 柳学周 1 ; 郑炜强 1 ; 陈佳 1 ; 史宝 1 ; 王滨 1 ;

作者机构: 1.农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所;大黄鱼育种国家重点实验室宁德市富发水产有限公司

关键词: 大黄鱼;消化道菌群;工厂化养殖;网箱养殖;高通量测序

期刊名称: 饲料工业

ISSN: 1001-991X

年卷期: 2019 年 06 期

页码: 35-43

收录情况: 北大核心

摘要: 运用高通量测序方式,对两种模式养殖大黄鱼(Larimichthys crocea)幼鱼消化道菌群的结构与功能特征及其与环境菌群的相关性进行分析,结果发现:大黄鱼幼鱼消化道主要由变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)组成。工厂化养殖大黄鱼消化道优势菌属组成比较稳定,包括乳杆菌属(Lactobacillus)、芽孢杆菌属(Bacillus)等。优势菌属中,发光杆菌属(Photobacterium)、乳杆菌属、弧菌属(Vibrio)等18个物种为两种模式养殖大黄鱼消化道的共有优势菌属;而假单胞菌属(Pseudomonas)、气单胞菌属(Aeromonas)和Escherich-ia_Shigella为主要差异菌属(P<0.05)。通过相关性分析得出,饵料中菌群对消化道菌群影响较大。并且,在菌群基因参与功能方面,两种模式下幼鱼消化道菌群基因参与的主要功能相似,但工厂化养殖幼鱼消化道菌群基因参与这些功能的基因丰度高于网箱养殖的,这可能是对幼鱼的生长代谢在环境胁迫中的一种补偿作用。研究结果将为大黄鱼幼鱼消化道功能菌群的筛选与菌群调控提供理论参考。

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