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粉蕉ACC氧化酶cDNA的克隆及其序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 黄永红 1 ; 易干军 1 ; 周碧容 1 ; 曾继吾 1 ; 吴元立 1 ;

作者机构: 1.广东省农业科学院果树所

关键词: 香蕉;ACO基因克隆;序列分析;克隆

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2006 年 4 卷 05 期

页码: 41-47

收录情况: CSCD

摘要: 本研究根据GeneBank公布的ACC氧化酶(ACO)基因的保守序列设计一对引物,通过RT-PCR方法从成熟粉蕉果实(ABBgroup)中克隆到一条新的香蕉ACO基因全序列。该氧化酶cDNA全长1172bp,基因编码区共957bp,推测其编码318个氨基酸。分析发现,该基因除了与登录号为X95599的香蕉ACO基因核苷酸序列一致性为84%外,与其它基因库上公布的香蕉ACO基因核苷酸序列一致性为94% ̄98%,而且,这些香蕉ACO基因核苷酸推导出的氨基酸序列总体一致性为95.81%。聚类分析结果表明,相同基因型的果实克隆出的香蕉ACO氨基酸具有更多的同源性。另外,将该香蕉ACO氨基酸与其它12种重要的果实的ACO氨基酸相比较,其序列一致性也很高。其与芒果一致性高达98%,与菠萝、番木瓜、葡萄、苹果,桃、梨、柑、橙等一致性也在68% ̄76%之间。同时发现这13种ACO氨基酸有9个较长的保守结构域。系统树分析结果表明,具有相似的生长环境和相似的生理特性的果实ACO基因具有更多的同源性。

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