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鉴别紫芝菌株的PCR引物筛选及其序列比对验证

文献类型： 中文期刊

作者： 钟礼义 1 ; 陈体强 2 ; 刘新锐 3 ; 应正河 2 ; 杨驰 2 ;

作者机构： 1. 福建武平县食用菌技术推广服务站

2. 福建省农业科学院食用菌研究所

3. 福建农林大学菌物研究中心

关键词： 紫芝;栽培菌株;分子标记;PCR引物;序列比对

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2020 年 007 期

页码： 725-730

收录情况： CSCD

摘要： [目的]紫芝S2(品种名:武芝2号)是近年来在福建及周边省份推广应用的紫芝栽培新品种,为了避免与遗传背景不同的栽培菌株混杂而建立有效的分子标记.[方法]采用PCR扩增筛选条带清晰稳定、呈现多态性的引物,根据菌株间UPMGA聚类构建系统发生树,通过遗传距离确定主要栽培菌株间的亲缘关系,并与菌株间的拮抗反应结果相映证,进而与'紫芝S2'基因组序列进行比对验证.[结果]筛选得到能清晰且稳定地扩增出特异性或多态性条带的2个RAPD-PCR引物和3个ISSR-PCR引物,比对发现这5个引物短序列与'紫芝S2'基因组序列完全匹配上的位点与数目不同.[结论]基于紫芝S2基因组序列比对,确认其中3个引物(ISSR13、 S1326和S1506)可以有效地用于紫芝栽培菌株鉴定.

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