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抑制差减杂交分离赤霉病菌诱导的小麦特异表达基因

文献类型： 中文期刊

作者： 林凡云 1 ; 陆琼娴 1 ; 徐剑宏 1 ; 杨慧勇 1 ; 祭芳 1 ; 史建荣 1 ;

作者机构： 1.江苏省农业科学院食品质量安全与检测研究所

关键词： 小麦;赤霉病菌;抑制差减杂交

期刊名称： 西北植物学报

ISSN： 1000-4025

年卷期： 2008 年 28 卷 03 期

页码： 7-13

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了全面探索小麦赤霉病抗性机理,以抗赤霉病小麦品种‘苏麦3号’及其感病的近等基因系(Hwo4)为实验材料,构建了一个‘苏麦3号’受赤霉病菌诱导表达的正向差减杂交文库。随机选取了141个阳性克隆测序,共获得133条通读EST。将获得的EST去除载体及接头序列后,利用CAP3软件进行聚类分析,133条EST被聚成90个序列重叠群(contigs),片段大小介于106~643 bp间,平均长度为274 bp。利用NCBI的Blastx软件对序列进行蛋白序列同源性比对,结果显示76条序列在蛋白数据库中可以找到同源序列,功能涉及能量代谢、物质代谢、疾病/防御、转录及细胞结构等。其中以能量及物质代谢相关的基因数量最多,分别占总EST的21.1%及17.1%;其次是与抗病及防御反应有关的EST,数量占总EST的15.8%。进一步的分析表明与抗病及防御相关的EST功能主要涉及抗氧化、细胞解毒及相关物质的代谢。

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