文献类型: 中文期刊
作者: 吴育鹏 1 ; 余乃通 1 ; 周启林 2 ; 王健华 1 ; 刘志昕 3 ;
作者机构: 1.中国热带农业科学院热带生物技术研究所
2.文昌市农产品质量安全检验检测站中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室
3.中国热带农业科学院热带作物生物技术国家重点实验室
关键词: 仙人掌;matK基因;克隆;序列分析
期刊名称: 基因组学与应用生物学
ISSN: 1674-568X
年卷期: 2016 年 35 卷 11 期
页码: 3135-3140
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 2015年12月,为了分析采自海南海口城西仙人掌mat K基因的序列及同源关系,利用RNA plant Reagent试剂盒提取仙人掌叶总RNA,反转录成第一链c DNA。同时设计仙人掌成熟酶K基因(mat K)的1对保守引物,利用RT-PCR的方法扩增仙人掌成熟酶K基因,所得序列经Blastn进行比对,发现与已报道的22个仙人掌mat K基因核苷酸序列一致;利用Blastn的Distance tree of results构建系统进化树,结果显示海南仙人掌mat K基因与其它报道的30个仙人掌mat K基因同源性最高,同源性在99%以上,属于同一组,而与Opuntia basilaris(Gen Bank accession No.JF786750.1)同源性最低,为96.6%。本研究利用RT-PCR方法获得了仙人掌成熟酶K基因序列,同时构建的系统进化树确定了该仙人掌成熟酶K基因的同源关系。本结果将为海南仙人掌的进化研究提供科学线索。
- 相关文献
[1]粉蕉ACC氧化酶cDNA的克隆及其序列分析. 黄永红,易干军,周碧容,曾继吾,吴元立. 2006
[2]三个广东品种鹅Myostatin基因编码区的克隆及结构特征分析. 刘颖,Ali Halidou,徐陵,施振旦,王贵平. 2005
[3]番鸭细小病毒和鹅细小病毒广东株VP1基因的克隆与序列分析. 季芳,张毓金,杨增岐,宋长绪. 2004
[4]猪Ⅱ型圆环病毒ORF2基因的克隆及其序列分析. 蒋智勇,宋长绪,王贵平,高向阳,赵亚华. 2005
[5]粉蕉ACC氧化酶cDNA的克隆及其序列分析. 黄永红,易干军,周碧容,曾继吾,吴元立. 2006
[6]猪Ⅱ型圆环病毒广东分离株的全基因组克隆及序列分析. 王贵平,蒋智勇,宋长绪,高向阳,赵亚华,林志雄,朱道中. 2004
[7]禽流感病毒A/goose/China/24/96(H7N3)分离株NP基因片段的克隆及其序列同源性分析. 黄庚明,辛朝安. 2002
[8]瓠瓜Ty1-copia型逆转座子RT基因的分离与序列分析. 赵芹,谢大森,何晓明,江彪,罗少波,彭庆务,李明珠. 2014
[9]中国柑橘黄龙病病原16S rDNA序列研究. 丁芳,洪霓,钟云,易干军,王国平. 2008
[10]香蕉束顶病毒DNA组分的克隆及其重要特征序列分析(英文). 黄永红,梅眉,曾继吾,周碧容,吴元立,夏瑞,易干军. 2008
[11]副猪嗜血杆菌分离株hhdA和hhdB基因的克隆及同源性分析. 臧莹安,陈国开,庞木生,宋帅,李淼,李春玲. 2012
[12]鸡白细胞介素-17基因的克隆和序列分析. 覃宗华,蔡建平,叶秀华,王佩瑶,陈闻,吕敏娜,温列娜,谢明权. 2005
[13]猫杯状病毒全基因组的克隆及序列分析. 郑翠玲,向华,宣华,王延树,严悌昆. 2010
[14]H_3N_2亚型猪源流感病毒NS基因的克隆与序列分析. 李敏,向华. 2009
[15]纳豆芽胞杆菌KX株纳豆激酶基因的克隆及序列分析. 王星,覃宗华,李国清,余劲术,吕敏娜,吴彩艳,蔡建平,谢明权. 2007
[16]两株不同来源的猪圆环病毒1型ORF2基因的克隆与序列分析. 张福良,孙丽华,宋长绪,杨鸣琦,郝永清,刘燕玲,武占银. 2006
[17]鸡源九次跨膜蛋白TM9SF2基因克隆及其蛋白特征分析. 张敏霞,池周颖,瞿孝云,刘杨,曾庆航,李昌,廖明. 2023
[18]仙人掌总RNA提取方法的改进与分析. 周启林,罗志文,胡福初,张治礼,刘志昕. 2017
[19]广东地区猪群新发塞内卡病毒流行株的分离鉴定及遗传进化分析. 林秀银,温肖会,吕殿红,翟少伦,霍玮,翟颀,魏文康,杨彩娟. 2019
[20]广东省番茄黄化曲叶病毒的分子鉴定及序列分析. 汤亚飞,佘小漫,李正刚,于琳,蓝国兵,邓铭光,何自福. 2019
作者其他论文 更多>>
-
基于CRISPR/Cas9系统的拟南芥双链结合蛋白AtHyl1基因编辑
作者:吴坤鑫;张春微;刘志昕;余乃通;王健华;张秀春
关键词:CRISPR/Cas9;基因编辑;AtHyl1;拟南芥三突变体hyl1dcl2drb4
-
香蕉条斑病毒ORF Ⅰ基因克隆及编码蛋白和同源物的生物信息学分析
作者:黎维丽;余乃通;李俊成;王健华;李宾宾;刘志昕
关键词:香蕉条斑病毒;ORFⅠ;同源蛋白;生物信息学分析
-
利用CRISPR/Cas9系统编辑拟南芥2个双链结合蛋白
作者:武亚丹;张春微;刘志昕;王健华;余乃通;张秀春
关键词:CRISPR/Cas9;基因编辑;拟南芥;双链结合蛋白
-
仙人掌总RNA提取方法的改进与分析
作者:周启林;罗志文;胡福初;张治礼;刘志昕
关键词:仙人掌;RNA提取;RT-PCR;灵敏度检测
-
本生烟瞬时表达系统快速检测RNAi载体沉默效果
作者:武亚丹;张秀春;冼淑丽;余乃通;王健华;刘志昕
关键词:本生烟;瞬时表达;干扰载体;半定量RT-PCR;沉默效果检测
-
人工合成靶序列快速构建多靶标RNAi表达载体
作者:张秀春;吴坤鑫;赵平娟;刘志昕
关键词:人工合成靶序列;番木瓜环斑病毒;番木瓜叶扭曲花叶病毒;RNAi表达载体
-
黄灯笼辣椒eIF4Es基因克隆及其酵母双杂交激活域载体构建
作者:张真;余乃通;王健华;张秀春;武亚丹
关键词:eIF4E家族;酵母双杂交;载体构建;自激活