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利用InDel标记分析中国香菇菌株的遗传多样性与群体结构

文献类型： 中文期刊

作者： 沈秀芬 1 ; 章炉军 2 ; 张美彦 2 ; 张丹 2 ; 于海龙 1 ; 李玉 1 ;

作者机构： 1.吉林农业大学食药用菌教育部工程研究中心

2.上海市农业科学院食用菌研究所国家食用菌工程技术研究中心

关键词： 香菇;重测序;InDel标记;遗传多样性;群体结构

期刊名称： 菌物学报

ISSN：

年卷期： 2021 年 009 期

页码： 2266-2281

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 通过对5个香菇菌株重测序,以香菇L808-1菌株的全基因组序列为参考基因组,分析了这些菌株中插入/缺失（In Del）标记位点在香菇基因组10条染色体上的分布,并筛选了插入/缺失碱基数≥15的位点,合成了449对In Del标记引物。经过PCR和电泳检测,其中237对引物条带清晰。最终筛选出107个PIC≥0.3的标记作为核心In Del标记对来自国内的44份香菇菌株进行遗传多样性分析。聚类分析显示栽培菌株和野生菌株各自聚为一支,所选香菇菌株间存在明显的群体分层。群体结构分析显示香菇种质资源可分为4个亚群,主成分分析显示香菇菌株之间的位置及距离与聚类分析和群体结构分析结果相符。香菇In Del分子标记的开发与应用,为香菇核心种质的构建和种质资源育种引用提供了基础。

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