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猪骨和皮脂性状相关ESTs的SNPs筛查与关联分析

文献类型： 中文期刊

作者： 覃立立 1 ; 蔡更元 2 ; 张豪 1 ; 陈瑶生 3 ; 李加琪 1 ; 王翀 1 ;

作者机构： 1.华南农业大学动物科学学院/广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室

2.广东省农业科学院畜牧研究所

3.中山大学有害生物控制与资源利用国家重点实验室

关键词： ESTs;SNPs;骨性状;皮脂性状

期刊名称： 中国农业科学

ISSN： 0578-1752

年卷期： 2011 年 44 卷 16 期

页码： 3403-3412

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】性状的QTL位于多条染色体上,寻找猪骨和皮脂性状的新候选基因,为育种工作提供参考。【方法】本研究从NCBI搜索到可能与骨和皮脂性状相关的ESTs 177条,通过cDNA池法测序筛选到其中9条ESTs上有21个SNPs,在长-蓝家系F2代进行关联分析,并用辐射杂交细胞系技术对其中的4条ESTs进行定位。【结果】发现其中6个SNPs与猪的骨和皮脂性状相关。E53不同基因型在后躯骨重上的差异达到了极显著水平(P<0.01),在骨率、前躯骨重和皮脂率上的差异均达到了显著水平(P<0.05)。E82不同基因型在中躯骨重、中躯皮脂重上的差异均达到了极显著水平(P<0.01),在骨率、皮脂率、前躯皮脂重上的差异达到显著水平(P<0.05)。E36在前躯骨重、后躯皮脂重,E42在中躯皮脂重、后躯皮脂重,E54在中躯骨重,E87在前躯骨重、皮脂率上不同基因型差异均达到了显著水平(P<0.05)。E36定位在猪10q13处;E53定位在4q21-23处;E54定位在10号染色体SWC19处;E87定位在9p21处。【结论】E53和E82所在的基因有可能作为影响骨和皮脂性状的新候选基因进行而深入研究。

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