文献类型: 中文期刊
作者: 潘成麟 1 ; 宋彤星 1 ; 章啸君 2 ; 楼芳芳 2 ; 胡旭进 2 ; 屠平光 2 ; 肖英平 3 ; 吕文涛 3 ;
作者机构: 1.华中农业大学动物科学技术学院
2.金华市农业科学研究院畜牧兽医研究所
3.浙江省农业科学院农产品质量安全与营养研究所
关键词: 断奶仔猪;腹泻;16S rRNA;古菌
期刊名称: 中国畜牧兽医
ISSN: 1671-7236
年卷期: 2024 年 51 卷 011 期
页码: 4755-4764
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 【目的】研究断奶仔猪肠道古菌菌群结构功能,分析古菌与断奶仔猪腹泻的相关性,为防治断奶仔猪腹泻提供理论依据。【方法】选取同批次24日龄健康断奶仔猪(H组)和腹泻断奶仔猪(D组)各32头,采集粪便后通过16S rRNA基因测序分析两组粪便样本古菌菌群结构,使用PICRUSt2软件预测肠道古菌功能,分析差异古菌与断奶仔猪腹泻的相关性。【结果】健康和腹泻断奶仔猪腹泻评分差异显著(P<0.05)。广古菌门(Euryarchaeota)、泉古菌门(Crenarchaeota)和奇古菌门(Thaumarchaeota)为健康和腹泻仔猪优势古菌菌门;健康仔猪优势菌属为甲烷八叠球菌属(Methanosarcina)、Euryarchaeota_norank和甲烷短杆菌属(Methanobrevibacter)。腹泻仔猪优势菌属为Euryarchaeota_norank、甲烷八叠球菌属和甲烷短杆菌属。腹泻仔猪菌群多样性和丰富度高于健康仔猪,且健康和腹泻断奶仔猪的古菌菌群结构和功能差异显著(P<0.05),古菌菌群结构差异主要体现在甲烷八叠球菌属、Euryarchaeota_norank、恐硫球菌属(Sulfophobococcus)、Nitrosarchaeum、热网菌属(Pyrodictium)等菌属上;古菌菌群功能差异主要体现在脂多糖的生物合成、氨基酸生物合成、抗原处理和表达等通路上。相关性分析发现,甲烷八叠球菌属、恐硫球菌属、Euryarchaeota_norank、甲烷暖球菌属(Methanocaldococcus)、火球菌属、甲烷卵圆形菌属(Methanocalculus)和Nitrosarchaeum的相对丰度与断奶仔猪腹泻均显著相关(P<0.05)。【结论】健康和腹泻断奶仔猪肠道古菌菌群结构和功能存在显著差异,腹泻断奶仔猪Euryarchaeota_norank相对丰度较高,而甲烷八叠球菌属相对丰度较低,Euryarchaeota_norank、甲烷八叠球菌属和恐硫球菌属与断奶仔猪腹泻存在相关性。
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