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双孢蘑菇6个菌株不同发育阶段的转录组分析

文献类型： 中文期刊

作者： 施肖堃 1 ; 卢园萍 1 ; 蔡志欣 1 ; 郭仲杰 1 ; 陈美元 1 ; 廖剑华 1 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院食用菌研究所/特色食用菌繁育与栽培国家地方联合工程研究中心

关键词： 双孢蘑菇;子实体发育;转录组测序;差异表达基因

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2019 年 007 期

页码： 775-781

收录情况： CSCD

摘要： [目的]通过多个双孢蘑菇菌株不同发育阶段的差异转录组分析,为进一步验证双孢蘑菇发育相关基因及探讨其分子机理奠定基础.[方法]对双孢蘑菇主栽品种As2796及其亲本02、8213,其回交子代W192,以及国外野生菌株ARP159、国内野生菌株AgLH830共6个具有重要代表性的菌株子实体原基期、幼菇期、采摘期、开伞期等4个不同发育阶段共24个样品进行转录组测序,并与双孢蘑菇参考基因组序列进行比对,根据比对结果进行各基因在不同样品中的表达量分析及差异表达基因识别,发掘新基因与共同基因的差异表达,并进行各数据库的基因功能注释.[结果]结果共鉴定到10 660个转录本,发掘新基因677个,其中237个得到功能注释.与原基期相比,6个菌株在幼菇期、采摘期和开伞期分别有49、82、73个共同差异表达基因,其中有13个是相同的基因.[结论]发现了一批在双孢蘑菇子实体不同发育阶段具有显著差异表达的基因,筛选出不同菌株不同阶段的共有差异基因,对双孢蘑菇子实体发育中重要的差异基因进行了注释与探讨.

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