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东方蜜蜂微孢子虫RCDP 42基因的分子克隆与生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 郭睿 1 ; 张凯遥 2 ; 张佳欣 2 ; 郭思佳 2 ; 张浩宇 2 ; 何旭江 1 ; 赵红霞 3 ; 付中民 2 ; 陈大福 2 ;

作者机构: 1.江西省蜜蜂生物学与饲养重点实验室

2.福建农林大学动物科学学院(蜂学学院)

3.广东省农业科学院动物研究所

关键词: 东方蜜蜂微孢子虫;ras相关细胞分裂蛋白42样蛋白;分子克隆;分子特性;系统进化

期刊名称: 福建农林大学学报(自然科学版)

ISSN: 1671-5470

年卷期: 2023 年 52 卷 004 期

页码: 527-532

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 对东方蜜蜂微孢子虫RCDP 42 基因进行分子克隆,并通过生物信息学解析RCDP 42 蛋白的分子特性,进而对东方蜜蜂微孢子虫和其他物种的RCDP 42 蛋白进行保守基序和结构域预测及分析.结果表明,成功克隆到东方蜜蜂微孢子虫RCDP 42 基因的CDS区,RCDP 42 基因在孢子中真实表达,含有 540 个核苷酸,可编码 179 个氨基酸;RCDP 42 蛋白的分子质量约为20.3 ku,分子式为C915H1416N230 O274S10,脂溶系数为86.03,等电点为6.57;包含的亲水氨基酸数量多于疏水氨基酸,但不含信号肽与跨膜结构域,说明RCDP 42 可能为亲水性蛋白、胞内蛋白和非跨膜蛋白,可能包含 16 个磷酸化位点、63 个α-螺旋、43 条延长链、11 个β-转角及 62 个无规则卷曲.在东方蜜蜂微孢子虫、蚱蜢脑炎微孢子虫和肠脑炎微孢子虫的RCDP 42 蛋白中均鉴定到 3 个保守基序(motif 1、motif 2 和motif 3)与 1 个结构域(Rho).

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