文献类型: 中文期刊
作者: 崔筱 1 ; 胡素娟 1 ; 徐柯 2 ; 孔维丽 1 ; 刘芹 1 ; 康源春 1 ; 孔维威 1 ; 张玉亭 1 ;
作者机构: 1.河南省农业科学院植物营养与资源环境研究所
2.三门峡市陕州区农业农村局
关键词: 平菇;IAA;转录组分析;色氨酸代谢通路;MAPK信号通路
期刊名称: 河南大学学报(自然科学版)
ISSN:
年卷期: 2021 年 004 期
页码: 437-448
收录情况: 北大核心
摘要: 采用添加不同浓度(10-3、0和10-8 mol/L)IAA的PDA培养基分别培养P99平菇(Pleurotus ostreatus)菌丝7 d和15 d.收集菌丝体,提取总RNA并进行转录组测序.对测序信息进行生物信息学分析,包括差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)的筛选、聚类分析、gene onotology(GO)和kyoto encyclopedia of genes and genomes(KEGG)富集分析.最后采用实时荧光定量PCR验证色氨酸代谢通路中关键基因的表达.结果显示:与对照相比,高浓度(10-3 mol/L)和低浓度(10-8mol/L)IAA处理后,在菌丝生长的第7 d,分别获得806个和412个DEGs;在菌丝生长后期,即第15 d,分别获得145个和26个DEGs.GO富集分析表明,两种浓度IAA处理条件下,DEGs主要富集在次生代谢、木质素代谢、几丁质代谢和氧化还原酶代谢等生物学过程中.KEGG富集分析结果表明,两种浓度IAA处理后,生长前期和后期的DEGs富集通路均包括了色氨酸代谢通路和MAPK代谢通路.实时荧光定量PCR结果显示,色氨酸代谢通路中关键基因DN3209和DN3495的表达水平和测序数据一致.以上结果表明,几丁质代谢、色氨酸代谢和MAPK信号通路可能参与了不同浓度的IAA对平菇菌丝生长的促进和抑制作用.
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