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草菇乙酰木聚糖酯酶的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 赵妍 1 ; 陈明杰 1 ; 王孟兰 1 ;

作者机构： 1.上海市农业科学院食用菌研究所

关键词： 草菇;乙酰木聚糖酯酶;生物信息学

期刊名称： 微生物学杂志

ISSN： 1005-7021

年卷期： 2015 年 02 期

页码： 53-58

收录情况： CSCD

摘要： 以草菇(Volvariella volvacea)乙酰木聚糖酯酶AXE、AXEII为研究对象,采用生物信息学方法对其核苷酸及编码的蛋白氨基酸序列、组成成分、信号肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、蛋白质三级结构等进行预测和分析,并构建了乙酰木聚糖酯酶蛋白家族的系统进化树。结果表明,草菇的AXE蛋白由349个氨基酸残基组成,编码蛋白质的分子量为37.55 ku,等电点为8.58,属稳定性蛋白质。AXEII由253个氨基酸残基组成,编码蛋白质的分子量为27.70 ku,等电点为5.82,属稳定性蛋白质。两者均为亲水性蛋白,存在信号肽,AXE与AXEII的潜在磷酸化位点总数分别为15个和11个。草菇的AXE与灰盖鬼伞(Coprinopsis cinerea)亲缘关系较近,AXEII与裂褶菌(Schizophyllum commune)亲缘关系较近。

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