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鸭圆环病毒ORF-C1基因的扩增及遗传进化分析

文献类型: 中文期刊

作者: 吕振环 1 ; 赵莎 2 ; 卢凤英 2 ; 杨婧 2 ; 韩凯凯 2 ; 黄欣梅 2 ; 赵冬敏 2 ; 章丽娇 2 ; 吴凤瑶 2 ; 刘宇卓 2 ; 李银 2 ; 刘青涛 2 ; 张小飞 2 ;

作者机构: 1.南京农业大学动物医学院

2.江苏省农业科学院兽医研究所

关键词: 鸭圆环病毒;ORF-C1基因;遗传进化分析

期刊名称: 畜牧与兽医

ISSN: 0529-5130

年卷期: 2023 年 55 卷 005 期

页码: 63-69

收录情况: 北大核心

摘要: 鸭圆环病毒(DuCV)感染能够引起鸭的免疫抑制,引起多种病原的继发性感染,在我国鸭群中广泛流行.为了解DuCV的遗传变异情况,对采自山东、江苏和贵州3个省份的19个鸭场的样品进行了 PCR测定,并对DuCV的ORF-C1基因进行测序和遗传进化分析.PCR测定结果显示,19个鸭场中有9个鸭场的样品为DuCV阳性,总体阳性率为47.4%;ORF-C1基因序列测定结果显示,9株DuCV之间的核苷酸序列和氨基酸序列同源性分别为93.4%~100%和82.2%~100%,与NCBI中已公布的DuCV毒株的核苷酸序列和氨基酸序列同源性分别为77.8%~99.5%和71.5%~-99.6%;遗传进化分析显示,9株DuCV全部属于DuCV-1b亚型,其中有7株在同一分支上,与D11-JW-001等韩国毒株遗传距离较近,另外2株则与山东、广西的毒株遗传距离较近;此外,与已公布的毒株相比,9株DuCV都在158位发生了氨基酸突变,由E/D变为L/P.上述结果表明,DuCV-1仍然为我国鸭群中的优势流行基因型,但病毒的基因也在不断地发生变异,应该对其进行持续监测.

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[2]牛星状病毒ORF2基因遗传进化分析及原核表达. 武琦,周金柱,钟纯燕,李基棕,李科茫,索朗斯珠,贡嘎,李彬. 2022

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