文献类型： 中文期刊

作者： 张栋 ¹ ; 高风英 ² ; 卢迈新 ² ; 曹建萌 ² ; 刘志刚 ² ; 可小丽 ² ; 王淼 ³ ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室;上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心

2.;中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室;上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心

3.;中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室;上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心;

关键词： 尼罗罗非鱼;β2m;SNPs;无乳链球菌;连锁不平衡;单倍型;标签SNPs

期刊名称： 水生生物学报

ISSN： 1000-3207

年卷期： 2018 年 42 卷 05 期

页码： 903-912

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： β_2-微球蛋白(β_2-microglobulin,β_2m)作为MHCⅠ类分子的亚基,在鱼类的免疫系统中发挥重要作用。实验采用直接测序法从P0代尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)的β_2m基因组序列中筛选到30个SNPs,其中1个SNP位于5?UTR,16个SNPs位于外显子区域(15个非同义突变位点,1个同义突变位点),9个SNPs位于内含子区域,4个SNPs位于3?UTR。利用snapshot分型法对F1代的102尾易感群体和102尾抗病群体进行基因分型,并通过Popgen32和PIC-CALC软件统计分析尼罗罗非鱼β_2m基因序列的SNPs的He、Ho、Ne和PIC等遗传参数,表明易感群体中7个SNPs属于中度多态水平(0.250.9),这意味着我们在β_2m基因中发现2个ht SNPs。研究筛选到的与链球菌抗性/易感性状相关的SNP位点及单倍型具有辅助尼罗罗非鱼抗链球菌病品种选育的潜力。