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香蕉TCP全基因家族的鉴定及表达模式分析

文献类型: 中文期刊

作者: 刘京 1 ; 吕前前 2 ; 盛鸥 2 ; 彭淼 1 ; 钟晓红 1 ; 邓贵明 2 ;

作者机构: 1.湖南农业大学园艺学院

2.广东省农业科学院果树研究所

关键词: 香蕉;TCP基因;基因家族;表达分析

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2023 年 21 卷 005 期

页码: 1427-1437

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: TCP(Teosinte branched I,Cycloidea,Proliferating Cell Factors 1 和 2)基因家族是植物特有的转录因子.在植物生长发育过程中具有重要的调控作用.本研究基于香蕉基因组数据,利用生物信息学方法从香蕉基因组中鉴定出了 48个TCP家族基因,基于生物信息学进行分析,并利用RT-qPCR分析该基因家族在巴西蕉不同营养器官、生殖器官和果实发育的不同阶段及果实采后催熟过程中的表达情况.结果表明,香蕉MaTCP家族蛋白分子量在4.86~5.11 kD之间,48个TCP基因可以分为Class Ⅰ和Class Ⅱ两类,香蕉MaTCP基因结构较为简单,内含子数目较少,大部分基因含有相同的motif 1.顺式元件分析发现,香蕉TCP家族基因的启动子序列中含多个非生物胁迫响应元件.qPCR结果表明,MaTCP22和MaTCP35在香蕉叶片高表达,MaTCP32在香蕉雌性器中高表达,MaTCP4、MaTCP6和MaTCP7在香蕉发育过程的果实中高表达.本研究结果为进一步研究该类基因的功能提供了重要线索和依据,并为了解香蕉生长发育和果实采后催熟过程中的分子机制提供了提供数据参考.

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