您好，欢迎访问贵州省农业科学院 机构知识库！
贵州省农业科学院机构知识库

全部

  • 全部
  • 标题
  • 学者
  • 机构
  • 关键词

镉胁迫下桑树幼苗的转录组分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王晓红 1 ; 韩世玉 1 ; 孙运朋 1 ; 张芳 1 ; 罗泽虎 1 ; 陈彪 1 ;

作者机构： 1.贵州省农业科学院蚕业研究所

关键词： 桑树;镉胁迫;转录组;生物信息;基因表达

期刊名称： 中国农学通报

ISSN： 1000-6850

年卷期： 2023 年 39 卷 013 期

页码： 25-34

收录情况： CSCD

摘要： 为研究桑树幼苗对重金属镉胁迫应答的分子机制,挖掘与镉胁迫相关的功能基因,利用Illumina HiSeq测序方法对正常和CdCl2胁迫条件下的桑树幼苗进行转录组学研究.基于从头转录组组装,从镉胁迫下的桑树幼苗中分离到39758个非冗余转录本.这些转录本的平均长度和N50分别为1135、1968bp,平均GC含量为41.72%.从不同的镉胁迫时期鉴定得到15882个差异表达基因.KEGG途径富集分析表明,这些差异表达基因分别主要参与光合作用、次生代谢和能量代谢相关途径.此外,36个转录因子家族的148个转录因子在不同镉胁迫时期存在差异表达,包括bHLH、MYB、B3、NAC、MYB-related等.qRT-PCR显示差异表达基因的表达谱与RNA-Seq分析结果一致.研究结果可为了解桑树对镉的耐受机制提供依据.

  • 相关文献

[1]不同桑树品种幼苗对镉的耐受性. 陈露,张芳,罗泽虎,孙运鹏,韩世玉,吴康云,王晓红. 2021

[2]镉胁迫对10个桑树品种种子萌发的影响. 陈露,王晓红,张芳,邢丹,张明生. 2019

[3]薏苡Waxy基因的克隆与生物信息学分析. 王健,罗凯,杨成龙,胡贤锋,周明强. 2017

[4]镉胁迫下3种改良剂及其浸提物对水稻生长发育的影响. 魏进,戴长庚,周玮,张盈,陈湘燕. 2016

[5]镉胁迫对海菜花种子萌发及幼苗初期生理生化的影响. 陈祖拥,范菲菲,官小云,彭艳,朱健. 2016

[6]外源硫对镉胁迫下马齿苋光合性状和矿质元素吸收的影响. 王竹承,刘辉,李荣华. 2020

[7]外源硫对镉胁迫下苹果幼苗光合特性的影响. 梁魁景,高小宽,于占晶,王芳芳,刘辉,侯晓杰. 2020

[8]外源硫诱导苦荞镉胁迫响应的比较转录组学分析. 刘辉,卢扬,叶夕苗,周帅,李俊,唐健波,陈恩发. 2023

[9]钙离子对不同水稻品种苗期镉吸收转运的影响. 滕浪,付天岭,郑锋,普天赟,高珍冉,秦松,罗德强,何腾兵. 2022

[10]不同酸碱条件下钙对辣椒亚细胞组分镉吸附特征和解毒机制影响. 颜秋晓,林绍霞,魏福晓,杨莹,邓廷飞,王道平,张珍明,黄冬福. 2025

[11]桑树的栽培技术及其利用. 杨李娟. 2016

[12]桑树多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白基因MaPGIP1的克隆及功能分析. 王晓红,朱攀攀,梁燕梅,韩淑梅,赵爱春,王传宏,鲁成,余茂德. 2015

[13]桑树在贵州环境治理中的生态价值及综合利用. 罗朝斌,韩世玉,王晓红,代方银. 2012

[14]桑树夏伐及夏伐后的管理技术. 王芳,李建华,何静. 2011

[15]隔年伐条桑园冬季不同剪梢程度与春产叶量的关系. 李开林,杨胜特,胡仕叶,万昌荣,罗朝斌. 2009

[16]桑树病虫害农业防治措施. 黄礼萍,何静. 2012

[17]桑树资源概况及其多元化利用. 韩世玉. 2006

[18]干旱条件下不同桑树品种的生长反应. 韩世玉. 2007

[19]桑树的生态价值及其在贵州“东桑西移”中的生态栽培. 韩世玉. 2007

[20]桑树春季产叶量与主要性状的灰色关联度分析. 韩世玉,姜虹,罗朝斌,岳宣,杨胜特. 2010

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：贵州省农业科学院

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台