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2株猪繁殖与呼吸综合征病毒海南株的ORF5基因分析

文献类型: 中文期刊

作者: 马佳镁 1 ; 钟植文 1 ; 范悦轩 1 ; 黄春媛 1 ; 郑佳馨 1 ; 曹芳芳 1 ; 王金泉 1 ; 刘光亮 1 ; 曹宗喜 1 ;

作者机构: 1.新疆农业大学动物医学学院;海南省农业科学院畜牧兽医研究所/海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验室/国家动物疫病数据中心海口观测实验点;广东永顺生物制药股份有限公司;海南省农业科学院畜牧兽医研究所海南省院士团队创新中心

关键词: 猪繁殖与呼吸综合征病毒;ORF5 基因;多重序列比对;同源性

期刊名称: 新疆农业科学

ISSN: 1001-4330

年卷期: 2023 年 60 卷 012 期

页码: 3049-3056

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: [目的]鉴定我国海南省新发现的 2 株猪繁殖与呼吸综合征病毒株HNHK1-2021 和HNLG1-2021的进化关系.[方法]采用PCR方法对ORF5 基因进行扩增和序列测定,利用MegAlign软件进行多重序列比对,利用MEGA X软件邻接法构建进化树.[结果]PRRSV HNHK1-2021 和HNLG1-2021 毒株核苷酸相似性为82.9%,推导氨基酸相似性为 82.6%.HNHK1-2021 毒株和NADC30 类 PRRSV、QYYZ类 PRRSV、VR-2332 类 PRRSV 以及 JXA1 类 PRRSV 序列比对,80.8%~82.8%、90.2%~92.0%、82.1%~83.4%、81.9%~84.4%,推导氨基酸相似性分别为 82.1%~84.6%、91.5%~94.5%、80.1%~83.1%、82.6%~84.6%;HNLG1-2021 毒株和 NADC30 类 PRRSV、QYYZ 类 PRRSV、VR2332 类 PRRSV 以及 JXA1 类PRRSV序列比对,核苷酸相似性分别为 83.7%~84.6%、81.8%~83.6%、97.7%~99.5%、85.6%~90.4%,推导氨基酸相似性为83.6%~85.1%、81.1%~82.6%、96.0%~98.5%,86.1%~90.5%.[结论]2 株病毒株均属于北美型PRRSV,HNHK1-2021 毒株属于QYYZ类PRRSV(谱系 3).HNLG1-2021 毒株属于VR-2332 类PRRSV(谱系5).

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