文献类型： 中文期刊

作者： 王丽 ¹ ; 王万兴 ¹ ; 索海翠 ¹ ; 胡新喜 ¹ ; 秦玉芝 ¹ ; 李小波 ¹ ; 熊兴耀 ¹ ;

作者机构： 1.湖南农业大学园艺园林学院;广东省农业科学院作物研究所;广东省农作物遗传改良重点实验室;中国农业科学院蔬菜花卉研究所;农业部薯类作物生物学与遗传育种重点实验室

关键词： 马铃薯;PPO基因家族;生物信息学;基因表达

期刊名称： 湖南农业大学学报(自然科学版)

ISSN： 1007-1032

年卷期： 2019 年 06 期

页码： 601-610

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 通过搜索马铃薯全基因组,获得马铃薯多酚氧化酶(PPO)基因家族序列,并对其进行生物信息学及表达分析。结果显示:共获得12个马铃薯PPO基因,即StuPPO1、StuPPO2、StuPPO3、…、StuPPO12;除StuPPO9位于2号染色体外,其余11个基因串联于8号染色体的276kb范围内;对具有3个典型结构域(Tyrosinase、PPO1_DWL、PPO1_KFDV)的基因蛋白序列进行进一步分析,结果显示StuPPO1、StuPPO2、StuPPO3、StuPPO4、StuPPO6蛋白序列相似性大于80%,且大部分StuPPO蛋白位于叶绿体;启动子顺式作用元件分析显示,StuPPO1、StuPPO2、StuPPO3、StuPPO6、StuPPO8、StuPPO9具有MeJA响应元件,StuPPO1、StuPPO3、StuPPO4、StuPPO6、StuPPO7、StuPPO8、StuPPO9具有ABA响应元件,StuPPO2、StuPPO4、StuPPO8、StuPPO9具有IAA响应元件;少数PPO基因具有对SA、GA及低温等胁迫响应相关元件;基因表达分析结果表明,不同的PPO基因其表达模式有较大的差异,StuPPO1、StuPPO2、StuPPO3在马铃薯块茎、根、匍匐茎、茎、叶柄、顶部幼叶、中部叶片、底部老叶组织中均有表达,StuPPO4仅在块茎、根、匍匐茎、茎中表达,而StuPPO6、StuPPO7、StuPPO8、StuPPO9在8个部位都没有检测到表达。此外,同一基因在不同组织中的表达也有着较大的差异。