文献类型： 中文期刊

作者： 徐珍 ¹ ; 刘建雨 ² ; 张丹 ² ; 王瑞娟 ² ; 潘迎捷 ¹ ; 谭琦 ¹ ; 尚晓冬 ² ;

作者机构： 1.上海海洋大学食品学院

2.上海市农业科学院食用菌研究所

关键词： 菌丝;转录组;差异表达基因;GO功能分析;KEGG pathway分析

期刊名称： 食用菌学报

ISSN： 1005-9873

年卷期： 2016 年 23 卷 04 期

页码： 1-6+77

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以金针菇(Flammulinavelutipes)单核菌株DAN3的基因组为参考,完成单核体DAN3和M及其杂交双核体G1在菌丝阶段的转录组测序与数据分析,比较两个样本间的差异基因,并对差异基因进行GO功能分析和KEGG pathway分析。结果表明:两个样本中共有显著性差异表达的基因86个,其中,在G1中呈上调、下调表达的基因数分别为41、45个,有2个基因在G1中特异表达。GO功能分析结果表明,86个差异基因中有40个基因比对上了GO功能注释,其中18个基因在G1中呈上调表达;单一生物过程和催化活性为显著性富集的功能,相关基因在G1中呈上调表达。KEGG pathway分析结果表明,22个差异基因被定位到17条Pathway,其中10个基因在G1中呈上调表达,包括赖氨酸代谢途径对应基因,3_M和G1菌丝样品中赖氨酸含量分别为1.70×103 ng/mg和1.06×103 ng/mg,说明G1中上调的基因可能与之降解相关;DNA复制是显著性富集的代谢途径,相关基因在G1中呈下调表达。