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海洋低温脂肪酶MLP的同源模建及分子动力学模拟

文献类型： 中文期刊

作者： 纪晓峰 1 ; 盛军 2 ; 郑媛 2 ; 郝建华 2 ; 孙谧 2 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院黄海水产研究所农业部海洋渔业可持续发展重点实验室

2.中国水产科学研究院黄海水产研究所农业部海洋渔业可持续发展重点实验室;华中科技大学物理学院生物物理模建小组

关键词： 海洋低温脂肪酶;同源模建;分子动力学模拟

期刊名称： 生物物理学报

ISSN： 1000-6737

年卷期： 2013 年 29 卷 08 期

页码： 594-602

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 海洋低温脂肪酶(marine low-temperature lipase,MLP,登录号:ADM47601)是一株海洋细菌来源的新型脂肪酶,其具有耐碱性pH的优点,在生物能源、食品加工等行业具有良好的应用前景。作者从MLP的氨基酸序列入手,利用同源模建方法构建其三级结构,并通过Ramachandran图和Profile_3D图对模型的可靠性进行了验证。同时,通过"界面激活"实验和分子动力学模拟,对覆盖在活性位点区的"盖子域"进行了预测和分析。该研究结果将为今后更高性能突变株的获得及该酶空间折叠方式的研究等提供理论指导。

  • 相关文献

[1]低温碱性蛋白酶QDAPr的生物信息学分析及同源模建. 郝建华,袁翠,王跃军,孙谧. 2006

[2]石墨烯与抑癌基因p53 DNA片段相互作用的分子模拟与光谱学验证. 吴惠丰,张明兴,李斐,曹天贵,李雪花,赵建民. 2017

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