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基于转录组测序分析葡萄籽原花青素对HepG2细胞基因及其相关功能的影响

文献类型: 中文期刊

作者: 郑万财 1 ; 党斌 1 ; 张迹 2 ; 罗巧玉 3 ; 冯作山 4 ;

作者机构: 1.青海大学农林科学院青藏高原种质资源研究与利用实验室

2.淮阴师范学院生命科学学院

3.青海师范大学生命科学学院

4.新疆农业大学食品科学与药学学院

关键词: 葡萄籽;原花青素;转录组测序;HepG2细胞;基因功能

期刊名称: 食品与机械

ISSN: 1003-5788

年卷期: 2024 年 003 期

页码: 188-195

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 目的:基于转录组测序分析葡萄籽原花青素对HepG2细胞基因及相关功能的影响,明确原花青素处理HepG2细胞的关键基因及代谢通路。方法:通过转录组测序,筛选差异基因,基因功能注释和KEGG通路的富集分析,进行葡萄籽原花青素处理细胞后的转录组学研究。结果:葡萄籽花青素处理HepG2细胞后主要富集到的生物学过程为细胞过程、代谢过程、生物调控过程、免疫系统过程、繁殖调节、生长调节。细胞凋亡的12个关键差异基因与TNF、p53、MAPK、PI3K-Akt、NF-κB信号通路密切相关。结论:细胞凋亡与TNF信号通路、p53信号传导途径、PI3K/Akt信号通路、NF-κB信号通路、MAPK信号通路密切相关。

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