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光照胁迫下广叶绣球菌菌丝基因差异表达的初步分析

文献类型: 中文期刊

作者: 肖冬来 1 ; 张迪 1 ; 马璐 1 ; 王宏雨 1 ; 林衍铨 1 ;

作者机构: 1.福建省农业科学院食用菌研究所

关键词: 广叶绣球菌;转录组;GO功能分析;差异表达基因

期刊名称: 中国食用菌

ISSN: 1003-8310

年卷期: 2017 年 36 卷 05 期

页码: 60-63

摘要: 利用高通量测序技术对黑暗和光照下广叶绣球菌(Sparassis latifolia)菌丝进行RNA-Seq分析,比较光照胁迫下的差异表达基因,并对差异基因进行GO功能分析和KEGG pathway分析。结果表明,光照胁迫下显著性差异表达的基因328个,其中,上调、下调表达的基因数分别为157个和171个。差异表达基因的GO注释表明,生物学过程主要为细胞过程、代谢过程、单一生物过程,而分子功能主要为催化、结合和转运子活性。KEGG pathway功能分析结果表明,差异基因主要集中在次级代谢产物合成、淀粉和蔗糖代谢和谷胱甘肽代谢通路中。

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