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香蕉束顶病毒DNA组分的克隆及其重要特征序列分析(英文)

文献类型: 中文期刊

作者: 黄永红 1 ; 梅眉 2 ; 曾继吾 2 ; 周碧容 2 ; 吴元立 2 ; 夏瑞 2 ; 易干军 2 ;

作者机构: 1.广东省农业科学院果树研究所

2.广东省农业科学院果树研究所;山东省胶州市农业局

关键词: 香蕉束顶病毒;克隆;序列分析;特征序列

期刊名称: 果树学报

ISSN: 1009-9980

年卷期: 2008 年 25 卷 06 期

页码: 101-106

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 克隆得到1条新的香蕉束顶病毒(BBTV)6核苷酸全序列,对其进行序列分析发现,该序列含有2个主要的特征序列CR-SL(Stem-loop common regions)和CR-M(Major common regions)。BBTV6氨基酸进化树结果显示其分成2大类。将6种BBTV组分的序列进行比较发现,6种组分内核苷酸和氨基酸的最高相似性分别为96.10%和98.27%,6种组分间核苷酸和氨基酸最高相似性分别为70.78%和56.24%。6种BBTV组分的核苷酸及其氨基酸进化树将所有分离物按照组分类别分成6组,而6种BBTV组分的CR-M核苷酸序列进化树将所有的分离物按照地域分成2大类。对BBTV的6种组分的蛋白质进行分析,结果表明,各种组分蛋白质的二级结构和理化性质有明显的差异。

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