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利用OneMap软件构建鲤遗传连锁图谱

文献类型: 中文期刊

作者: 高国强 1 ; 常玉梅 1 ; 匡友谊 1 ; 梁利群 1 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院黑龙江水产研究所

关键词: 鲤;遗传连锁图谱;荧光扩增片段长度多态性;OneMap

期刊名称: 水产学报

ISSN: 1000-0615

年卷期: 2010 年 34 卷 05 期

页码: 4-10

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 首次使用R环境中的OneMap软件包,以荷包红鲤抗寒品系(♂)和云南大头鲤(♀)为祖父母本所培育的110个F2个体为作图群体,以荧光扩增片段长度多态性(fluorescent amplification fragment length polymorphism,fAFLP)为主要分子标记,采用远交全同胞家系模型构建鲤的遗传连锁图谱。结果显示,110个F2个体中共产生1513个清晰的fAFLP标记,其中多态性标记911个;另开发多态性的EST标记12个,最后总计923个标记用于构建遗传连锁图谱;采用OneMap软件包构建的遗传图谱含有238个fAFLP标记和8个EST标记分布在50个连锁群上,总图距为2876.64cM,标记间平均间距为14.68cM,图谱覆盖率为66.56%。

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