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番茄多胺氧化酶(PAO)基因家族鉴定及表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 李会 1 ; 王超 1 ; 黄思杰 1 ; 陈健 1 ; 杨立飞 1 ;

作者机构： 1.南京农业大学园艺学院;环境保护部南京环境科学研究所;江苏省农业科学院农产品质量安全与营养研究所

关键词： 番茄;多胺氧化酶;基因进化分析;组织表达分析

期刊名称： 西北植物学报

ISSN： 1000-4025

年卷期： 2018 年 04 期

页码： 607-614

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 该研究通过生物信息学手段,从番茄基因组中鉴定出11个编码多胺氧化酶(polyamine oxidase,PAO)的家族基因(命名为SlPAO1~11),分为3个亚家族(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ);基因结构分析、蛋白质二级结构预测、亚细胞定位预测结果均显示,SlPAOs基因家族具有明显的亚家族分类特征。序列和进化分析结果显示,亚家族Ⅰ和Ⅱ中的SlPAO1~8属于典型的PAO基因,而亚家族Ⅲ中的SlPAO9~11编码蛋白还含有特异性的SWIRM结构域,SlPAO9~11属于组蛋白赖氨酸特异性脱甲基化酶,而非真正的PAO。选取上述鉴定的8个典型SlPAO基因(SlPAO1-8),采用qRT-PCR技术对SlPAO1-8基因在不同组织中(干燥种子,新鲜的真叶、子叶、茎、根)的相对表达分析显示,SlPAO1-8在不同组织中的表达水平差异显著,推测SlPAOs基因家族的组织表达多样性与功能多样性之间可能具有一定的相关性。

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