您好，欢迎访问福建省农业科学院 机构知识库！
福建省农业科学院机构知识库

全部

  • 全部
  • 标题
  • 学者
  • 机构
  • 关键词

8个双孢蘑菇核心种质的重测序初步分析

文献类型： 会议论文

第一作者： 陈美元

作者： 陈美元 1 ; 廖剑华 2 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院食用菌研究所,福建福州350014

2.特色食用菌繁育与栽培国家地方联合工程研究中心,福建福州350014

关键词： 双孢蘑菇;菌株类型;基因组测序;结构变异

会议名称： 福建省科协第十四届学术年会分会暨2014年福建省食用菌学会学术年会

主办单位： 福建省科协`福建省食用菌学会

页码： 00000030-00000038

摘要： 为探讨双孢蘑菇不同类型菌株间基因组存在的差异及开发SNP、SV等分子标记,对8个不同类型的核心种质开展基因组重测序工作.共获得9,840,696,438数据量,48,716,319对reads,Q30达到80％以上.样品的reads与参考基因组H97的比对效率均在70％以上,对参考基因组H97的覆盖率均达到95％以上,平均深度分别在32X左右.基于测序数据与参考基因组的比对结果,共检测获得约3,190,387个SNP,239,874个Indel,8,070个SV.对双孢蘑菇及其两个退化突变体的SNP和Indel变异位点进行了注释.

分类号： S646.11:S603.7

  • 相关文献

[1]利用ISSR标记鉴定双孢蘑菇的传统菌株类型. 施肖堃,郭仲杰,蔡志欣,卢园萍,陈美元,廖剑华. 2019

[2]20个双孢蘑菇核心种质的重测序初步分析. 陈美元,廖剑华. 2015

[3]18个双孢蘑菇核心种质的重测序初步分析. 施肖堃,蔡志欣,郭仲杰,卢园萍,陈美元,廖剑华. 2019

[4]双孢蘑菇SCAR标记的建立及在菌株群鉴定中的应用. 张静,陈文炳,邵碧英,王泽生,廖剑华,江树勋,李寿崧. 2011

[5]双孢蘑菇W192菌株液体发酵培养的研究. 曾志恒,程翊,曾辉,丁中文,戴建清. 2013

[6]双孢蘑菇栽培菌株遗传多样性的DNA指纹分析. 陈美元,廖剑华,李洪荣,郭仲杰,卢政辉,蔡丹凤,王泽生. 2009

[7]双孢蘑菇SRAP、ISSR、RAPD标记遗传多样性和菌群分类研究. 张静,陈文炳,邵碧英,王泽生,廖剑华,李寿崧,江树勋. 2010

[8]姬松茸与双孢蘑菇不同菌株的RAPD扩增研究. 李三暑,林新坚,陈惠成,雷锦桂,林勇,江枝和. 2002

[9]双孢蘑菇三次发酵高效优质栽培技术研究. 蔡开地,黄梅卿,郑羡清,江枝和. 2014

[10]添加茭白鞘叶栽培双孢蘑菇初探. 蔡志英,卢政辉,丁中文,曾辉. 2012

[11]双孢蘑菇As2796子实体发育转录组测序分析. 施肖堃,蔡志欣,郭仲杰,卢园萍,陈美元,廖剑华,王泽生. 2018

[12]菌渣培养料对双孢蘑菇子实体蛋白质营养价值的影响. 柯斌榕,兰清秀,卢政辉,廖剑华. 2017

[13]双孢蘑菇6个菌株不同发育阶段的转录组分析. 施肖堃,卢园萍,蔡志欣,郭仲杰,陈美元,廖剑华. 2019

[14]有害疣孢霉厚垣孢子萌发特性研究. 杜宜新,石妞妞,阮宏椿,甘林,时春喜,陈福如. 2020

[15]双孢蘑菇发酵液氨基氮含量测定方法的研究. 曾志恒,曾辉,程翊,施肖堃,谢神斌,戴建清. 2019

[16]蘑菇培养料发酵中微生物群落变化及其与温室气体排放的关系. 李艳春,叶菁,王义祥. 2019

[17]双孢蘑菇发酵液还原糖和总糖的含量测定. 曾志恒,曾辉,程翊,杨雷,施肖堃,戴建清. 2018

[18]双孢蘑菇新型颗粒原种配方的优化. 曾志恒,曾辉,蔡志欣,郭仲杰,卢园萍,陈美元,廖剑华,戴建清. 2021

[19]双孢蘑菇W192液体菌种摇瓶培养过程中的生理生化分析. 戴建清. 2021

[20]双孢蘑菇‘福蘑58’的选育报告. 陈美元,廖剑华,郭仲杰,蔡志欣,卢园萍,吴少聪,王泽生. 2021

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：福建省农业科学院

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台