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茯苓菌落褐变的转录组测序分析

文献类型： 会议论文

第一作者： 蔡丹凤

作者： 蔡丹凤 1 ; 蔡志欣 1 ; 林衍铨 1 ; 陈美元 1 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院食用菌研究所,特色食用菌繁育与栽培国家地方联合工程研究中心,福州350014

关键词： 茯苓;菌落褐变;转录组测序;差异表达基因

会议名称： 福建省科协第十六届学术年会分会暨2016年福建省食用菌学会学术年会

主办单位： 福建省科协`福建省食用菌学会

页码： 00000044-00000050

摘要： 完成茯苓正常与褐变菌丝体共4个样品的转录组测序,共获得25.61Gb Clean Data,各样品Clean Data均达到5.84Gb,Q30碱基百分比在89.81％及以上.分别将各样品的Clean Reads与指定的参考基因组进行序列比对,比对效率从38.09％到68.04％不等,共鉴定到12383个基因.基于比对结果,进行可变剪接预测分析、基因结构优化分析以及新基因的发掘,发掘新基因1,017个,其中260个得到功能注释.基于比对结果进行基因表达量分析,根据基因在不同样品中的表达量识别差异表达基因,发现正常菌落与三个不同程度褐变菌落有336个共同差异基因,并对其进行功能注释和富集分析.

分类号： Q949.329.7

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