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广叶绣球菌淀粉酶基因生物信息学分析

文献类型： 会议论文

第一作者： 马璐

作者： 马璐 1 ; 杨驰 2 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院食用菌研究所,福建福州 350014

2.特色食用菌繁育与栽培国家地方联合工程研究中心,福建福州350014

关键词： 广叶绣球菌;淀粉酶基因;理化性质;基因结构;信号肽;亚细胞定位;生物信息学

会议名称： 福建省科协第十七届学术年会分会暨2017年福建省食用菌学会学术年会

主办单位： 福建省科协`福建省食用菌学会

页码： 00000065-00000073

摘要： 基于广叶绣球菌(Sparassis latifolia)的基因组和转录组数据,通过生物信息学方法对广叶绣球菌的淀粉酶家族基因进行基本理化性质、基因结构、信号肽、亚细胞定位和功能位点的预测和分析,并构建系统发育树.结构表明:编码绣球菌淀粉酶的基因有6个,5个属于α-淀粉酶,1个属于γ-淀粉酶,编码蛋白的相对分子量在47～263kD之间,以丝氨酸磷酸化位点为主,4个蛋白存在信号肽.

分类号： S646:S601

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