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生物基因组串联重复序列的整体评估和挖掘方法

专利类型： 中国发明申请

专利权人： 江苏省农业科学院

发明人： 许莹修;杜建厂

专利号： CN201410246867.5

摘要： 本发明提供了一种生物基因组串联重复序列的整体评估和挖掘方法，包括以下步骤：利用枚举法的计算机程序构建重复序列的核心序列库，作为重复序列扫描的基础；用核心序列库在整个基因组进行串联重复序列信息扫描，确定核心序列产生的串联重复序列在基因组中的数量；扫描结果的评估，从整体和细节描述解读基因组序列中串联重复序列的特征；将扫描到的重复序列依据其核心序列编排为不同类型，将每种类型的数量及各成员在染色体上的分布位置信息构建串联重复序列数据库；串联重复序列的提取分析；以及串联重复序列的挖掘应用。本申请针对生物全基因组序列的，并依据需求分析和挖掘部分种类或全部序列进行后期的应用。

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