科研产出
山羊环状RNA circ_0008219 SNPs位点与生产性能的关联分析
《中国畜牧杂志 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：实验旨在分析山羊环状RNA circ_0008219 序列中单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)位点与产羔、生长性状之间的关联性,为山羊分子育种提供新的遗传标记.选取波尔山羊、黑头羊和麻城黑山羊作为实验对象,利用SNaPshot分型技术分析候选SNPs位点的遗传多样性,并对circ_0008219 的SNPs位点与 3 个品种山羊的产羔性状和黑头羊的周岁生长性状进行关联分析.结果表明山羊circ_0008219 中存在 3 个SNPs位点均具有多态性.卡方适应性检测结果表明,g.1082G>T、g.1310A>G在 3 个山羊群体中均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),g.651G>A在波尔山羊和麻城黑山羊群体均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05).黑头羊群体中,g.651G>A位点与山羊周岁体高存在相关;g.1082G>T与周岁体重、周岁体斜长、周岁胸围和管围性状存在相关.关联分析结果显示,g.651G>A位点与黑头羊总体产羔数显著关联,g.1082G>T位点与波尔山羊头胎产羔数极显著关联.连锁不平衡分析表明,在波尔山羊群体中,g.1082G>T和g.1310A>G位点之间处于强连锁平衡状态(D'=1,r2=1);在黑头羊群体中,g.651G>A和g.1310A>G位点之间处于强连锁平衡状态(D'=1,r2=1);在麻城黑山羊群体中,g.651G>A和g.1310A>G位点之间处于强连锁平衡状态(D'=0.917,r2=1).本研究筛选出 3 个SNPs位点即g.651G>A、g.1082G>T和g.1310A>G,可以作为山羊育种的潜在遗传标记,该研究结果为山羊品种培育提供了理论依据.
关键词： circ_0008219 SNPs 山羊 繁殖性能 关联分析
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半纤维素分解菌群HMC的微生物群落结构及功能
《农业工程学报 》 2024 EI 北大核心 CSCD
摘要：为明确半纤维素分解菌群HMC(hemicellulolytic microbial consortium)的微生物群落结构及其在半纤维素降解中的潜在功能；该研究测定了其在降解半纤维素主链木聚糖及玉米芯的典型理化指标，并利用16S rDNA测序技术及生物信息学手段对其微生物群落结构及功能注释进行了宏基因组学分析。结果表明，HMC在7 d内能高效降解木聚糖和玉米芯，降解率达80%，木聚糖降解产生的高值产物包括还原糖、甲酸、乳酸及乙酸，最高浓度分别为1.30、0.50、1.19与1.23 mg/mL,HMC降解玉米芯时可累积挥发性脂肪酸浓度高达3.54 mg/mL。HMC是由厚壁菌门Firmicutes的多个属的微生物组成的复合微生物菌群，宏基因组分析揭示了HMC在木聚糖降解过程中的关键碳水化合物活性酶系；HMC的半纤维素降解酶系完整，包括19个木聚糖分解及下游产物代谢相关的酶；同时涵盖了乙酸、乳酸等半纤维素关键分解产物代谢相关的通路。HMC蕴含半纤维素及玉米芯高值生物转化的潜力，该研究为深入探究半纤维素在生物降解应用中的分子机制提供了重要线索，有助于推动天然半纤维素生物降解技术的发展。
关键词： 半纤维素 微生物群 降解 微生物群落结构 宏基因组学 还原糖 挥发性脂肪酸
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硒都黑猪NT5C1A基因核心启动子区鉴定及转录因子预测
《中国畜牧杂志 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：本研究旨在探究猪胞质5'核苷酸酶1A基因（Cytosolic 5'-Nucleotidase1A,NT5C1A）启动子区序列的结构特性，确定其核心启动子区并分析其关键转录因子结合位点，为探究其表达调控机制提供理论依据。对NT5C1A互作蛋白进行预测，在线生物信息学分析软件预测猪NT5C1A基因核心启动子区，根据预测结果设计7对启动子缺失片段引物，以硒都黑猪血液基因组DNA为模板，通过PCR扩增和Sanger测序方法获得NT5C1A基因5'端7个启动子缺失片段并克隆至pGL3-Basic载体，以双荧光素酶报告基因检测试验对缺失片段进行荧光素酶活性检测，并通过转录因子在线预测软件预测核心启动子区潜在的转录因子。结果表明，NT5C1A基因核心启动子位于转录起始位点-290～+109bp的位置（ATG作为+1），该区域含有MYOD1、MYOG、MYF5和SP1等肌肉发育相关的转录因子结合位点。本试验为研究NT5C1A基因调控猪肌肉发育的分子机制提供了理论依据。
关键词： 硒都黑猪 NT5C1A 核心启动子区 转录因子 生物信息学
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普通小麦Arableu#1白粉病成株抗性遗传解析
《中国农业科学 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：【目的】中国是世界上最重要的小麦生产国和消费国之一，确保小麦产量稳定对我国粮食安全具有重要意义。小麦白粉病是限制小麦产量的重要因素之一。选育抗病品种是控制该病害最经济、有效环保的途径，挖掘新成株抗性基因/位点为选育持久抗病小麦品种提供依据。【方法】由国际玉米小麦改良中心（CIMMYT）培育的普通小麦品系Arableu#1在苗期对白粉病表现为感病，而成株期呈现高水平抗性。为深入解析其抗病遗传机制，利用Arableu#1与高感品系Apav#1杂交，构建一个含有142个家系的F5重组自交系群体，采用基因分型测序（genotyping-by-sequencing,GBS）平台测序，获得4 298个在亲本间具有多态性的分子标记，并进行群体检测，所获基因型用于构建整个群体的遗传连锁图。【结果】结合白粉病连续2年田间表型和基因型数据，使用IciMapping 4.1对田间病害严重度、病程曲线下面积（AUDPC）和病害多年平均严重度（MFDS）等性状进行QTL定位分析，在该群体中定位了4个来自Arableu#1的白粉病成株抗性位点，分别位于染色体1BL、5BL、6BS和7BL上，以及2个来自Apav#1的抗性位点，分别位于染色体2DS和4BL上，可解释白粉病表型变异介于3.1%—28.5%。6个位点聚合时的群体平均病害严重度达到各位点组合中的最低水平，QPm.hzau-1BL、QPm.hzau-4BL、QPm.hzau-5BL和QPm.hzau-7BL 4个位点聚合后的效应仅次于6个位点同时存在。【结论】将2个新位点QPm.hzau-5BL和QPm.hzau-7BL的两翼分子标记开发成KASP标记，经对570份世界各地育成品种或地方品种检测，2个位点单独存在或聚合在一起时均表现出不同程度的白粉病抗性，且这两个位点在我国小麦材料中的分布频率较CIMMYT的小麦种质中低。获得1个可能同时聚合6个白粉病抗性位点家系，其田间白粉病抗性可达近免疫水平。
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鄂东大别山区野生豆科牧草资源调查与评价
《草业学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为开发利用野生豆科牧草资源，2017-2021年对分布于鄂东大别山区的野生豆科牧草资源现状、属种、植物区系、生活型及饲用价值进行了调查统计与分析。结果表明：鄂东大别山区豆科牧草资源分属于34属77种，以少种属和单种属为主体，占资源总数的91%。资源中包括6个中国特有种，2个中国珍稀濒危种，23个栽培牧草野生种及野生近缘种。区系地理成分以温带和热带为主要分布型，分别占总属种的47%和38%。生活型以多年生草本和灌木为主，占资源总数的70%。资源中饲用品质优良的占79%，其余均在中等以上。
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绿壳蛋鸡群体SLCO1B3基因分型及其蛋壳颜色分析
《中国畜牧杂志 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：本文旨在探究周龄和绿壳基因型对蛋壳颜色的影响。对585只产绿壳蛋母鸡进行绿壳基因分型，结果表明O/O型个体比例为48.5%,O/o型个体比例为51.5%；使用色差仪对实验群体30周龄与40周龄的蛋壳颜色进行测量，分析结果表明：无论是对整体，还是对O/O型与O/o型的蛋壳颜色进行分析，40周龄L值较30周龄均极显著升高，可将L值的极显著升高作为绿壳颜色随产蛋周龄递增的变化规律；在同一产蛋时期，本实验群体O/O型蛋壳颜色a值极显著低于O/o型，感观呈现为蛋壳颜色更深更绿，且不同绿壳基因型的5种亲本组合方式的子代母鸡（即本实验群体）a值在同周龄的组间比较中存在极显著差异，这暗示可将a值作为衡量绿壳颜色深浅程度的重要指标，利用a值可能对后续蛋壳颜色分级的研究及绿壳蛋鸡的选育提供一定的参考借鉴。
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高低产蛋鸡产蛋后期卵巢组织差异表达基因筛选及其功能分析
《中国畜牧杂志 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：本文采用转录组测序技术和生物信息学分析的方法对高低产蛋鸡卵巢组织差异表达基因进行筛选,得到了调控产蛋量的潜在候选基因并对其生物学功能进行分析,探究其在卵巢及卵泡发育过程中的作用.本研究共以 3 只高产蛋鸡和 3 只低产蛋鸡卵巢组织为试验对象,以转录组测序技术分析 2 种蛋鸡卵巢组织中的基因表达情况,采用GO Term和KEGG Pathway方法对筛选得到的差异表达基因进行功能分析.结果发现,在高低产蛋鸡卵巢组织样本中平均获得 1.07×108 个Clean Reads,其中比对到参考基因组上的Clean Reads约占 93%.与低产蛋鸡卵巢组织相比,高产蛋鸡卵巢组织共有 125 个显著差异表达基因,其中 101 个基因显著上调和 24 个基因显著下调.GO Term分析发现,差异表达基因主要富集在生长、细胞组织成分、细胞组成部分或生物合成以及细胞外基质结构成分等过程;KEGG通路主要富集在焦点粘着、细胞外基质受体相互作用、转化生长因子-β信号通路等途径.对基因表达水平进行综合分析发现,高产蛋鸡卵巢组织中上调基因VCAN、VIPR2、DCN、COL6A2、COL6A1、RELN、FN1、ADAMTS1、COL3A1在卵泡细胞的细胞外基质形成和细胞连接过程中发挥作用,推测这些基因可能在蛋鸡卵巢发育及卵泡选择方面具有调控作用.本研究为分析产蛋后期高低产蛋鸡卵巢组织功能差异及卵泡发育机制提供了新的理论参考.
关键词： RNA-seq 高低产蛋鸡 卵巢组织 差异表达基因
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响应面法优化链霉菌产支链蒽醌发酵培养基
《中国畜牧兽医 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：[目的]通过响应面法优化链霉菌(Streptomyces sp.)WS-13394株发酵培养条件及培养基成分,以提高菌株产支链蒽醌的水平,为该化合物在畜牧业领域的应用提供技术支撑.[方法]采用单因素试验确定链霉菌WS-13394株产支链蒽醌的最佳摇瓶发酵条件及最适碳氮源和无机盐组合,利用Plackett-Burman试验筛选出影响摇瓶发酵产量的显著因子;结合最陡爬坡试验、响应面设计分析,拟合显著因子与支链蒽醌产量的非线性方程,从而获得优化的菌株发酵培养基配方.[结果]优化后的最佳配方为可溶性淀粉28.12 g/L、鱼粉10.00 g/L、酵母膏6.34 g/L、碳酸钙0.71 g/L、硫酸镁0.50 g/L、磷酸氢二钾0.50 g/L,此模型预测发酵液支链蒽醌产量为408.35 mg/L.应用此优化组合进行摇瓶发酵试验,支链蒽醌产量为411.73 mg/L,产量较优化前(89.70 mg/L)提高了3.59倍.[结论]通过响应面优化获得了显著提高链霉菌WS-13394株产支链蒽醌的摇瓶发酵培养基配方,试验结果为该类化合物的抗菌活性机制研究及其在动物模型中的效果评估提供了技术支撑.
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棉隆土壤消毒联合种植密度防除油菜田杂草及对作物产量和田间光照的影响
《植物保护 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：在农田杂草的治理中,结合农艺措施来治理草害的发生,可有效减少化学除草剂的使用,实现草害的综合治理.本文采用田间试验研究了棉隆土壤消毒联合油菜不同种植密度对油菜田主要杂草野燕麦Avena fatua、苦苣菜Sonchus oleraceus的防除效果,及杂草对氮、磷、钾及水分消耗的影响.结果表明,土壤消毒联合种植密度对油菜田杂草防除效果显著,对野燕麦、苦苣菜均有良好防效,总鲜重防效达到89.8%~100.0%.采取防除措施后,杂草对田间氮、磷、钾和水分的消耗量减少85%以上,有效改善了田间的水肥和光照条件.土壤消毒联合种植密度不同处理的油菜籽产量达到3 155.0~4 920.5 kg/hm2,增产效果显著,产量较未消毒土壤区增加13.3%~76.8%,增收1 857.3~10 684.8元/hm2.研究表明采用土壤消毒结合种植密度对油菜田杂草具有很好的控制效果,适度增加油菜种植密度既能保证对杂草防效,同时也能保证产量.
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金属卤化物CH_3NH_3PbBr_3钙钛矿量子点快速检测新烟碱类农药
《发光学报 》 2024 EI 北大核心 CSCD
摘要：以新烟碱类农药为靶标物，结合荧光传感策略构建了基于金属卤化物钙钛矿量子点CH_3NH_3PbBr_3(Perovskite quantum dots,PQDs)荧光探针快速检测新烟碱类农药的新方法。该方法的线性检测范围为0.0～20 mg/L，相关系数为0.993 9，检出限和定量限分别为0.17 mg/kg和0.56 mg/kg。对萝卜和香蕉样品中噻虫胺的加标回收率在79.3%～115.4%之间，日内日间相对标准偏差在3.8%～9.4%之间。该方法具有高灵敏度、高选择性和适用性，为农产品中新烟碱类农药残留的风险防控提供了一种有效的检测技术。对噻虫胺与钙钛矿量子点之间的相互作用进行了研究，结果表明，钙钛矿量子点与噻虫胺之间的相互作用是一个动态过程，噻虫胺对钙钛矿量子点的荧光猝灭方式为通过氢键或范德华力形成了新的复合物的静态猝灭。其内容可作为其他光谱分析手段的技术基础，其分析检测结果可为果蔬安全监管提供有价值的建议。
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