科研产出
基于高通量测序的梨果实常用内参基因表达稳定性分析
《分子植物育种 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：合适的内参基因对基因表达分析结果准确性至关重要。通过同源搜索在梨中获取了102个常用内参基因同源基因,其中的89个基因以基因家族形式存在。高通量数据分析揭示,各基因在不同发育时段或家族成员间均检测到不同水平的表达水平差异和表达稳定性差异。而相同基因在不同材料间的表达水平相对保守。这些基因在不同发育时段梨果实中的表达存在明显分化而聚成不同类型,部分基因在不同材料间表现出所有发育时段或部分发育时段表达变化趋势的保守性。本研究全面收集了相关内参基因家族成员,又有效区分出不同成员的表达特征,结果清晰、直观,为梨果实内参基因选择提供了可靠的实验依据。
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油菜分枝拓扑结构随机模拟
《中国科学:生命科学 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：油菜(Brassica napus L.)具有复杂的分枝结构,其分枝为向顶式发生(出现)、向基式扩展,这种独特的生长模式使得油菜个体植株间的构型存在很大的差异.本研究利用与位置有关的生长延迟函数,计算各分枝从发生到扩展的时间间隔,来模拟油菜分枝这种独特的生长模式.此外,利用随机概率模型来模拟油菜植株间分枝数、主干和分枝的叶元数等.通过实际测量的四个油菜品种(ZY18, ZY50, ZS72和ZS11)的数据,采用最小二乘法对该模型的参数进行校准.结果表明,该随机模型能够模拟油菜植株拓扑结构,并根据参数估计的结果分析不同品种的拓扑结构差异性.本研究提出了新的简化方法模拟油菜分枝的生长模式,该模型可与油菜生长模型相结合,从而模拟油菜的动态生长过程.
关键词： 油菜 花序发育 拓扑结构随机模拟 生长延迟函数 参数估计 概率分布
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冷应激对兔波氏杆菌感染传播的影响
《农业生物技术学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：波氏杆菌(Bordetella bronchiseptica,Bb)是家兔(Oryctolagus cuniculus)呼吸道传染病的主要病原。本研究以新西兰实验兔为研究对象,以波氏杆菌作为致病原,冷应激为应激原,旨在明确冷应激对兔波氏杆菌感染传播的影响。90只健康的波氏杆菌阴性实验兔随机分为5组,Bb/RT组与PBS/RT组在常温(room temperature, RT)(20±2℃)同室分笼饲养,Bb/cold组与PBS/cold组在6±2℃同室分笼饲养,control/RT组常温隔离饲养。Bb/RT组与Bb/cold组的每只兔鼻腔滴注0.5 mL 4×10~9CFU/mL波氏杆菌菌液(CFU:菌落形成单位(colony forming unit));其余各组的兔鼻腔滴注0.5 mL PBS。在冷暴露开始后的第7h、12 h、24 h、3 d、7 d、12 d 6个时间采样,采用TaqMan荧光定量PCR检测兔鼻腔、气管、肺、肝脏、心脏细菌浓度,采用SYBR-Green逆转录PCR(reverse transcription, RT-PCR)检测细胞因子免疫应答水平变化。结果显示,波氏杆菌通过空气进行传播,7 h时PBS/RT组与PBS/cold组受试兔鼻腔内均检测到波氏杆菌。冷应激对在感染兔鼻腔内细菌增殖影响不显著:在各个采样时间点,Bb/RT组与Bb/cold组实验兔鼻腔内Bb浓度差异不显著,PBS/RT、PBS/cold两组差异也不显著。短期冷应激(3 d内),冷应激组气管内波氏杆菌感染繁殖速度快;冷暴露12 h时,Bb/RT组、Bb/cold组实验兔气管内Bb浓度显著高于PBS/RT组、PBS/cold组(P<0.01);1 d和3 d时,4组试组两两比较仅Bb/RT组与PBS/RT组兔气管内细菌浓度差异显著(P<0.05)。7 d后4组实验组兔气管内Bb浓度差异不显著。所有实验兔肺脏、肝脏、肾脏、心脏均未检测到波氏杆菌。在感染后的各检测时间点,感染兔的血液中IL-10表达均上调,但无明显趋势变化;干扰素基因(interferon-gamma, IFN-γ)和肿瘤抑制因子基因(tumor necrosis factor-alpha, TNF-α)表达上调,并在感染后3 d出现峰值。在同一时间点不同感染组IL-10、IFN-γ和TNF-α表达水平变化差别不显著。研究表明波氏杆菌通过空气进行有效传播感染,短期冷应激对感染兔气管内细菌感染繁殖有促进作用,鼻腔与气管为波氏杆菌感染主要入侵与定植器官,冷应激对波氏杆菌感染兔细胞因子表达并没有产生显著影响。本研究为波氏杆菌防控提供了技术依据。
关键词： 波氏杆菌感染 冷应激 兔 qRT-PCR 细胞因子
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枇杷WRKY转录因子鉴定与表达分析
《园艺学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：以枇杷(Eriobotrya japonica)转录组数据为材料,利用生物信息学手段对枇杷WRKY转录因子进行鉴定与特征分析.分离鉴定出33条具典型WRKY结构域的序列,CDS长度分布在492~2 040bp,命名为EjWRKY01~EjWRKY33.分组鉴定和进化树分析结果显示,枇杷WRKY转录因子可分为3大类,其中Ⅰ类数量为6个,Ⅱ类和Ⅲ类的数量分别为22和5个,其中Ⅱ类又进一步分为a~e等5个亚类.WRKY结构域分析显示,WRKY结构域高度保守,绝大多数都含有WRKYGQK七肽和锌指结构.枇杷WRKY转录因子基因组DNA全长895~3 873 bp,编码的蛋白在163~679个氨基酸范围内,具有1~5个内含子.WRKY启动子顺式作用元件预测结果表明,大部分WRKY启动子序列具有典型的TATA和CAAT元件.将获得的所有WRKY基因与已报道的拟南芥WRKY进行进化比对分析发现,所有EjWRKY转录因子并没有位于独立的分支上,表明枇杷的基因序列虽与拟南芥物种有差别,但枇杷WRKY蛋白在调控植物生物和非生物逆境反应、信号传导、生长发育等方面的功能相似.此外,荧光定量PCR结果显示,大部分EjWRKY均在枇杷的根、茎、叶、花和果实中表达,但相对表达水平不同,说明WRKY家族基因在枇杷的生长发育中可能具有不同的功能.
关键词： 枇杷 WRKY转录因子 特征分析 系统进化 组织表达
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草莓新品种‘越珠’的选育
《果树学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：‘越珠’是由‘章姬’ב枥乙女’杂交选育出的早熟新品种。果实圆锥形或楔形,果面红色,富有光泽。果肉浅红色,细糯味浓,风味酸甜,富有浓郁的蜜桃香味;一级顶果平均单果质量46.23 g,各级序果平均单果质量17.86 g。可溶性固形物含量(w,后同)为11.80%,蔗糖含量20.04 mg·g~(-1),葡萄糖含量20.56 mg·g~(-1),果糖含量23.12 mg·g~(-1),有机酸含量5.31 mg·g~(-1),糖酸比12.02,果实硬度0.36 kg·cm-2;品质中上。在浙江省嘉兴市海宁市许村镇杨渡村(30.439 867 N,120.411 558 E)设施栽培,9月上中旬定植,12月下旬成熟,顶果发育期31 d;花序平均花数17.2。抗病性与红颜相似,易感炭疽病。该品种为设施栽培专用品种,不适合露地栽培。
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化肥减施对紫云英还田土壤活性有机碳和碳转化酶活性的影响
《植物营养与肥料学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：[目的]评价紫云英绿肥还田配施化肥对稻田土壤活性有机碳含量以及与碳转化相关酶活性的影响.[方法]田间试验在浙江省金华市红壤黄筋泥土发育而成的水稻土上进行.供试紫云英(Astragalus sinicus L.)品种为‘宁波大桥’,每年4月在紫云英盛花期异地翻压.试验连续进行了6年,处理包括空白对照(CK)、单施常规量化肥(CF),单施紫云英(MV),紫云英配合20%、40%、60%和80%的常规化肥量共7个处理.除空白和单施化肥处理外,其它处理均翻压45 t/hm2紫云英鲜草.N、P2O5、K2O化肥常规用量分别为210、56.3、112.5 kg/hm2.水稻收获后,采集0-20 cm表层土样,测定了土壤活性有机碳(可溶性有机碳(DOC)、热水提取态有机碳(HEOC)、微生物生物量碳(MBC)、颗粒有机碳(POC)、易氧化有机碳(ROC))和总有机碳(TOC)含量,以及碳转化酶(纤维素酶、蔗糖酶、β-葡萄糖苷酶、酚氧化酶和过氧化物酶)活性.[结果]与CF相比,MV处理能够显著增加DOC、HEOC和ROC含量,对MBC和TOC含量无显著影响;显著增加纤维素酶、蔗糖酶和β-葡萄糖苷酶活性,对酚氧化酶和过氧化物酶活性无显著影响.四个紫云英配施化肥处理中,DOC和POC含量以MV+ 60%CF处理最高,显著高于MV处理.随着配施化肥量的增加,土壤碳库管理指数随之增加.MV处理的纤维素酶、蔗糖酶、β-葡萄糖苷酶、酚氧化酶和过氧化物酶活性均显著低于其与化肥配合处理,上述五种酶活性均以MV+ 60%CF处理最高.几何平均酶活性和总体酶活性均表现为MV< MV+ 20%CF 关键词：
紫云英
土壤活性有机碳
碳转化酶
碳库管理指数
通径分析
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高质量推进乡村振兴的浙江典型模式与路径创新
《浙江农业学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：结合浙江实施乡村振兴战略的实践,从城郊、平原、海岛、山区4个维度,提出可复制、可推广的4种乡村振兴典型模式,总结了高质量推进浙江乡村振兴"全域秀美""融合精美""生态富美""要素活美"的创新路径,提出了浙江省进一步高质量推进乡村振兴战略的政策与措施建议。
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利用酵母双杂系统筛选与春兰CgSEP1相互作用的蛋白
《基因组学与应用生物学 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：兰花形态优雅,花香馥郁,花形奇特,具有高度特化的花器官,观赏价值较高。有关兰花花器官形成分子机理以及基因组测序正在不断研究中。为了探讨兰花基因间相互作用情况,本研究以春兰为材料进行基因克隆,获得了18个花发育相关基因的编码序列,经测序鉴定分别属于ABCDE类MADS-box家族基因。再以其中春兰AP/AGL9组的CgSEP1为诱饵蛋白,亚克隆至pGBKT7质粒,构建诱饵载体,将18个蛋白编码亚克隆至pGADT7质粒。通过酵母双杂系统筛选到了3个与其互作的蛋白:pGADT7-AG1、p GADT7-SEP2、pGADT7-AGL6-3。结果表明,C类AG-like和E类SEP-like、AGL-like家族基因参与SEP1基因春兰花发育过程,并形成多种蛋白混合物,共同调控花瓣和萼片的形成,进一步揭示了春兰的成花机理。
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观赏凤梨种质资源及遗传育种研究进展
《植物遗传资源学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：观赏凤梨原产于美洲热带及亚热带地区,是目前国内外花卉市场上的主要类群之一.本文分别从观赏凤梨的种质资源系统分类、保存与评价利用、遗传与育种研究,以及育种技术等方面进行了综述.目前,观赏凤梨的新品种选育仍以杂交为主.育种目标是苞片色彩丰富、花型多样、叶缘无刺、株型适中、生长期短、抗寒性好等.观赏凤梨杂交障碍主要表现为受精前障碍,受精后障碍则较少发生,切割柱头和花柱嫁接法可以有效克服杂交受精前障碍.由于大多数现行品种的遗传背景十分复杂,难以预见杂交结果,建议今后应加强多倍体育种和分子育种工作.
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一次性施肥稻田田面水氮素变化特征和流失风险评估
《农业环境科学学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：为评估单季稻一次性施肥模式中氮素径流损失风险,通过田间试验研究了一次性施肥模式中缓释氮肥类型、施用比例和氮肥施用量对田面水氮素含量的影响。结果表明:与尿素分次施肥处理(225 kg N·hm-2)相比,不同缓释氮肥(180 kg N·hm-2)一次性施肥后田面水铵态氮浓度为稳定性肥料(NIU)>常规分次施肥(Urea)>树脂包膜尿素(RCU)>聚氨酯包膜尿素(PCU);氮肥施用量为180 kg N·hm-2时田面水铵态氮浓度随缓释氮肥施用比例增加而下降,但180 kg N·hm-2和144 kg N·hm-2处理间田面水铵态氮含量没有明显差异。尿素分次施肥和一次性施肥处理的稻田氮素径流损失风险都在施基肥后5 d。研究表明,一次性施肥模式通过缓释氮肥的应用和氮肥减量等措施,虽然基肥用量大于尿素分次施肥处理,但没有增加稻田氮素径流损失风险。
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