科研产出
两株CRISPR工程大肠埃希菌在小鼠体内的定植实验研究
《实验动物与比较医学 》 2022
摘要:目的 利用小鼠对2株大肠埃希菌工程菌Nissle1917和BW25113在肠道的定植能力与定植效率进行评价,以筛选出肠道定植效率高的菌株,为后续利用成簇的规律性间隔的短回文重复序列(clustered regularly interspersed short palindromic repeats,CRISPR)及其相关蛋白(CRISPR associated protein,Cas)系统的工程菌消减体内耐药菌的研究奠定基础。方法 每株工程菌的实验共取70只18~20 g的ICR小鼠,雌雄各半,操作时小鼠区分性别并随机分为7个处理组,每组10只(6只实验,4只对照)。实验组灌胃2×1010个工程菌共200μL,对照组灌胃等体积的PBS。灌胃后1、3、6、12、24、48、72 h分别取小鼠的肠系膜淋巴结、胃、回盲部、结肠组织及内容物,分别采用平板划线、荧光镜检和PCR法检测工程菌,比较Nissle1917和BW25113这2菌株在小鼠体内的定植能力与效率。结果 灌胃后前6个时段(1、3、6、12、24、48 h)中,3种方法检测到2株菌在胃、回盲部、结肠组织有定植,淋巴结未检到目标菌株;而72 h有且仅有Nissle1917菌定植于回盲部和结肠组织,Nissle1917和BW25113两株菌的定植效率分别为100%和0。结论 Nissle1917菌定植效率高于BW25113菌,且能较长时间定植于回盲部和结肠组织,提示其可作为防控耐药基因传播用CRISPR系统的备选载体菌。
关键词: CRISPR工程大肠埃希菌 肠道定植能力 定植效率 ICR小鼠


基于重测序的长豇豆基因组InDel标记开发及应用
《园艺学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要:选取3份长豇豆种质资源进行全基因组重测序,利用重测序数据挖掘InDel位点,根据这些位点开发分子标记,并验证这些标记的有效性和应用价值.经过严格筛选,获得981个易于凝胶电泳检测的长度大于30 bp且多态性高的InDel位点,挑选其中在基因组上均匀分布的165个设计引物并进行验证.用6份长豇豆材料对165对引物进行初筛,其中162对可获得PCR扩增产物,共扩增出673条条带;85对引物表现出多态性,多态性带333条(占总带数的49.48%).利用85个多态性高的标记对173份长豇豆资源进行基因分型和遗传多样性分析,共检测到333个等位位点;多态性信息含量(PIC)为0.01~0.37,平均值为0.29;基因多样性指数变异范围为0.01~0.50,平均值为0.36,表明现有长豇豆资源遗传背景相对狭窄.通过聚类分析,173份长豇豆被分为2个类群,成功将不同类型长豇豆划分到不同亚群.另外,选用亲本间多态性标记用于6个杂交组合的F1代真实性鉴定,鉴定出5个真实杂交种.本研究所开发的多态性InDel标记在长豇豆遗传多样性分析、杂交种纯度鉴定、遗传连锁图谱构建、基因定位和分子标记辅助选择育种等方面具有很好的应用前景.
关键词: 长豇豆 InDel标记 遗传多样性 F1代真实性鉴定


几种杀菌剂对温州蜜柑黑点病的田间防治效果
《浙江柑橘 》 2022
摘要:柑橘黑点病(citrus melanose)因发病部位和时期不同又叫树脂病、流胶病、沙皮病和蒂腐病,柑橘黑点病一直是柑橘生产中的主要病害之一。其病原为Diaprthe citri (Fawcett)Wolf,可以感染导致果实、叶片、幼苗黑点病,果实褐色蒂腐病和成年枝干流胶病~([1])。浙江种植的柑橘以鲜食为主,果实感染黑点病严重影响精品果的外观品质,降低柑橘生产效益。


绵羊皮肤成纤维细胞的分离培养和鉴定
《中国细胞生物学学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要:绵羊成纤维细胞的分离培养是羊毛发育相关基因功能研究及分子育种研究的重要基础技术和手段,但是现有贴壁法和胰蛋白酶消化法分离培养所需时间长、效率低,双酶消化法与差速贴壁筛选法对绵羊皮肤成纤维细胞的分离培养效果尚不清楚.该实验目的在于通过优化绵羊皮肤成纤维细胞分离培养过程,提高培养效率和细胞纯度.采集新生羔羊的耳皮肤组织,采用胰蛋白酶和I型胶原酶联合消化法进行绵羊皮肤成纤维细胞的原代分离培养,培养2~3天后进行传代分离,直至获得高纯度的成纤维细胞,该过程用时约7天.免疫荧光鉴定结果表明,获得的绵羊皮肤成纤维细胞纯度达100%.该实验采用优化的双酶消化法与差速贴壁筛选分离成纤维细胞,提高了绵羊皮肤成纤维细胞分离培养效率,大大缩短了培养周期,提高了细胞纯度.


掌叶覆盆子染色体计数及基因组大小测定
《分子植物育种 》 2022 北大核心 CSCD
摘要:掌叶覆盆子(Rubus chingii Hu)是重要的药用植物,由于基因组数据缺乏,导致其分子生物学研究进展相对缓慢.本研究采用根尖染色体制片技术来确定其倍性;利用流式细胞术和K-mer分析方法对其基因组大小进行了测定.结果如下,掌叶覆盆子根尖染色体数目为2n=2x=14;采用流式细胞术,以萝卜'Saxa'为内标测定的掌叶覆盆子基因组大小为(255.39±7.58)Mb;K-mer分析估测的掌叶覆盆子基因组大小为262.2 Mb,杂合率为0.91%,重复序列比例为42.54%;根据各分析指标,推测该掌叶覆盆子基因组为一般复杂基因组.本研究结果将为掌叶覆盆子的全基因组测序研究提供重要参考.
关键词: 掌叶覆盆子 染色体数目 基因组大小 流式细胞术 K-mer分析

