科研产出
鸭坦布苏病毒贵州株分离鉴定及其E基因生物信息学分析
《扬州大学学报(农业与生命科学版) 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：从贵州三穗县某鸭场的病鸭病料中分离出1株坦布苏病毒（tembusu virus, TMUV）,经鉴定将其命名为TMUV-GZ。为了解该分离株的生物学特性及其E基因的分子特点，测定TMUV-GZ株的半数胚致死量(ELD50),将病毒接种至不同宿主细胞，观察其适应性与增殖能力；对E基因克隆测序并进行序列分析，对其编码的蛋白质进行生物信息学分析。结果表明：TMUV-GZ株能导致鸡胚和鸭胚死亡，该分离株无血凝性，在鸭胚上的ELD50为10-2.63·（0.2 mL）-1;该分离株能在Vero细胞、BHK-21细胞和DF-1细胞上增殖，对BHK-21细胞适应性最好。该分离株的E基因与泰国分离株DK/TH/CU-99核苷酸同源性最高，为98.3%;一级结构预测E蛋白的理论等电点为5.01,不稳定系数为39.5,为稳定蛋白质；二级结构预测该蛋白质以α-螺旋、β-折叠、β-转角较多，为亲水性蛋白质，可能存在10个优势抗原表位、2个跨膜区、3个结构域，无信号肽；三级结构预测该蛋白质模型结构与其他黄病毒E蛋白实验结构之间具有良好的一致性。综上，这一研究为TMUV亚单位疫苗和基因工程疫苗的研制提供了理论依据。
关键词： 坦布苏病毒 培养特性 E基因 克隆 生物信息学分析
全文链接
请求原文
猪链球菌1/2型的分离鉴定与致病性研究
《中国兽医科学 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为精准鉴定从贵州临床发病死亡猪分离到的疑似致病菌，通过形态学观察、革兰染色镜检、生化鉴定、种特异性PCR鉴定、血清型分型鉴定及毒力基因、小鼠致病性、耐药性检测，确定分离菌株为血清型1/2型猪链球菌，携带fbps+、mrp+、orf2+毒力基因，不具有gapdh、sly毒力基因，小鼠LD50为2.0×10~9CFU/m L，致病小鼠肺和肝可见明显病变，对氨基糖苷类、喹诺酮类、氯霉素类和大环内酯类等多种抗生素敏感。结果表明，贵州省猪群存在致病性猪链球菌1/2型感染。
全文链接
请求原文
叶菜型甘薯品种的品质综合评价分析
《分子植物育种 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：本研究通过对18种叶菜用甘薯品种叶片中的蛋白质、总酚、氨基酸、抗坏血酸、纤维素、维生素E含量等指标进行测定，结果表明：不同品种间的物质含量差异显著，蛋白质、VB1含量最高的是‘鄂菜薯1号’；总酚含量最高的是‘福薯23’；氨基酸含量最高的是‘福薯7-6’；维生素C含量最高的是‘湛菜台71’；类黄酮含量最高的是‘黔菜薯1号’；维生素E含量最高的是‘湘薯18’;VB6含量最高的是‘湘菜薯2号’；纤维素含量和亚硝酸盐含量最低的是‘广菜薯5号’。经隶属函数综合分析，品质最佳的品种为‘鄂菜薯1号’，排名前5的依次为‘鄂菜薯1号’、‘黔菜薯2号’、‘黄叶菜薯’、‘福薯23’、‘黔菜薯1号’。经相关性分析，总酚含量与氨基酸含量、总酚含量与类黄酮含量、氨基酸含量与纤维素含量之间存在相关性。本研究通过对不同品种进行品质分析，为品种资源的进一步利用研究提供理论依据。
全文链接
请求原文
不同有机肥施用模式下黄壤稻田根际和非根际土壤有机碳的矿化特征
《植物营养与肥料学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：【目的】研究长期施用有机肥对土壤有机碳矿化特征的影响，为提高土壤碳库稳定性和培肥土壤提供理论依据。【方法】贵阳黄壤肥力与肥效长期定位试验始于1994年，种植制度为单季水稻。2021年水稻收获后，选取不施肥（CK），平衡施用化肥（NPK）,25%和50%有机肥氮替代化肥氮（0.25MNPK、0.5MNPK）和单施有机肥（M） 5个处理的水稻植株，用抖根法采集根际和非根际土壤样品，分析活性碳组分含量，以采集的土样进行室内培养试验，研究有机碳矿化特征。【结果】1)与NPK相比，3个有机肥处理的根际土壤有机碳（SOC）含量提升了26%～43%，非根际土壤SOC含量提高了24%～32%；根际土壤微生物量碳（MBC）含量提升了16%～31%，且比非根际土壤高148%；非根际土壤易氧化有机碳（LOC）含量显著提升了36%～75%;0.5MNPK处理非根际土壤可溶性有机碳（DOC）含量显著提升了54%，且根际土壤的DOC含量平均高于非根际土壤10%。2)有机肥施用可明显增加黄壤稻田根际及非根际土壤有机碳矿化量，非根际土壤有机碳矿化量和矿化率分别高于根际土壤30%和33%；较CK和NPK处理，有机肥施用明显增加了根际土壤有机碳矿化量；与NPK处理相比，各有机肥处理有机碳矿化量增加了36%～63%，其与有机肥施用量成正比；NPK处理有机碳矿化量较CK降低，且在非根际土中更明显；非根际土壤中有机碳累计矿化率以CK最高，各有机肥处理较CK降低了19%～28%。3)土壤有机碳累积矿化量随培养天数的动态变化过程符合一级动力学方程。根际土壤中，M处理提升了有机碳累积矿化量（Ct），各施肥处理的潜在可矿化有机碳量（C0）提升了1.44～3.23倍；0.25MNPK和0.5MNPK处理明显降低了有机碳库日周转速率常数k。与NPK处理相比，其他处理均明显提升了非根际土壤Ct,0.25MNPK增加了C0,0.25MNPK和0.5MNPK明显降低了k值。4)根际和非根际土壤中，Ct与SOC、LOC、DOC含量均呈显著正相关关系，但与qMB （SMB/SOC）显著负相关。【结论】25%～50%有机肥氮替代化肥氮能显著提升土壤有机碳稳定性，增加土壤碳储量并减少碳损失，是黄壤稻田碳库管理及土壤培肥的优选施肥模式。
关键词： 长期施肥 有机肥 黄壤稻田 根际 非根际 有机碳矿化
全文链接
请求原文
氮肥及有机物料配施对黄壤冬油菜-玉米轮作田土壤微生物群落的影响
《河南农业科学 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：探讨氮肥及有机物料配施对黄壤冬油菜-玉米轮作田土壤微生物群落的影响，为贵州黄壤地力改善以及冬油菜和玉米丰产提质提供科学依据。2018—2021年连续4 a在贵州省贵阳市开展氮肥配施不同有机物料长期定位试验，设置5个处理[不施氮肥+磷钾肥（T1,CK）；氮肥+磷钾肥（T2）；氮肥+磷钾肥+秸秆（T3）；氮肥+磷钾肥+生物炭（T4）；氮肥+磷钾肥+商品有机肥（T5）]，于2021年5月油菜收获后采集不同处理土壤样品，研究不同处理对土壤微生物群落的影响。结果表明，T1—T5处理的细菌OTU数量分别为3 557、3 413、3 315、3 452、3 468个，真菌OTU数量分别为1 530、1 196、1 488、1 428、1 579个。氮肥及有机物配施后的T2—T5处理，土壤细菌群落Chaol指数、Shannon指数较T1分别增长0.67%～7.79%、0.30%～1.36%,Simpson指数降低2.94%～11.76%；土壤真菌群落Chaol指数、Shannon指数较T1分别增长9.64%～20.66%、29.55%～61.86%,Simpson指数降低55.83%～89.52%。群落相对丰度以及线性判别分析（LEfSe）结果显示，与T1处理相比，氮肥及有机物料配施改变土壤中细菌优势菌种的丰度，变形菌门（Proteobacteria）、绿弯菌门（Chloroflexi）、放线菌门（Actinobacteria）的相对丰度分别提高1.74%～24.05%、9.03%～29.06%、2.13%～12.12%，酸杆菌门（Acidobacteria）、拟杆菌门（Bacteroidetes）的相对丰度分别下降17.78%～42.79%、12.61%～14.68%；土壤真菌子囊菌门（Ascomycota）、被孢霉门（Mortierellomycota）、Unclassified＿k＿Fungi、罗兹菌门（Rozellomycota）的相对丰度分别下降2.79%～41.84%、33.14%～54.85%、4.13%～69.97%、37.64%～79.47%，担子菌门（Basidiomycota）的相对丰度提升29.78%～249.21%，镰刀菌属（Fusarium）的相对丰度下降4.95%～55.77%。综上，氮肥及有机物料配施均能改善黄壤冬油菜-玉米轮作田土壤中微生物环境，改变土壤微生物群落组成和多样性；配施有机物料有提升土壤有益菌群、降低或抑制有害菌群的作用，可改善黄壤地力。
关键词： 氮肥 有机物料 黄壤 冬油菜-玉米轮作 微生物群落结构 微生物群落多样性
全文链接
请求原文
贵州特异稻种香禾糯种质资源保护利用研究概述
《种子 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：香禾糯是分布于贵州省黔东南州少数民族聚居区原生环境的一种特殊稻类生态型,以米质优、香味浓、耐冷抗旱、耐瘠耐阴等诸多优良特性而备受关注.现收集保存本土样本850余份,陆续编目并送国家中、长期种质库保存1 000余份(次),是水稻优质抗逆育种与种质创新的重要基因源.本文系统全面回顾了近40年来香禾糯种质资源收集保存、鉴定评价和遗传改良与种质创新利用研究等,尤其是遗传演化的主要进展,并就继续抢救性收集香禾糯种质资源,深化精准鉴定评价技术,提高优异基因发掘与利用进行了讨论.
全文链接
请求原文
基于高密度遗传图谱对高粱穗部性状的QTL定位
《植物遗传资源学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：利用高密度遗传图谱进行高粱穗部相关性状的QTL分析，为酒用高粱标记辅助育种和重要基因遗传机制解析提供理论依据。以美国籽粒高粱品种BTx623和酱香型白酒用高粱品种红缨子构建的包含205个家系的RIL群体为试验材料，2020-2021年在贵州贵阳、安顺和海南乐东的5个环境下，开展了5个穗型性状（穗长、穗柄长、穗轴节数、一级枝梗数和最长一级枝梗长）的调查。利用高密度连锁图谱，采用完备区间作图法（ICIM）开展QTL定位。在高粱的基因组上一共检测到61个QTL涉及45个不同QTL遗传位点，其中与穗长、穗柄长、穗轴节数、一级枝梗数和最长一级枝梗长相关QTL分别为14、10、8、11和18个。在多个性状或多个环境中被重复检测到的19个重要QTL位点分别位于1（3个）、3（4个）、4（2个）、5（1个）、6（4个）、7（1个）、8（3个）和9（1个）号染色体上，并在其中12个QTL位点置信区间内或附近确定了13个候选基因，它们与控制水稻穗型的基因同源（DEP1、RGN1、OsPID、OsSPL7和WTG1等），为进一步克隆和功能验证这些候选基因提供依据。
关键词： 高粱 穗型性状 数量性状位点（QTL） 遗传定位 候选基因
全文链接
请求原文
菜-菌轮作模式下土壤微生物群落结构及多样性的变化
《中国土壤与肥料 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为明确菜-菌轮作模式对土壤微生物的影响，基于高通量测序技术，对4种轮作模式下的土壤微生物群落结构与多样性进行了研究，结果显示：不同轮作模式下土壤样品中真菌和细菌OUT总数分别是2298和15840条，相较于常规轮作模式A，菜-菌轮作模式B、C、D下真菌的OUT总数、ACE指数、Chao1指数、Shannon指数降低显著，Simpson指数增加明显，但细菌的各参数没有显著的差异；其土壤全氮、碱解氮、速效钾、有机质含量显著高于常规轮作模式A；真菌的优势群落是子囊菌门，相对丰度在66%以上，枝孢属、镰刀菌属两类致病菌群的丰度在菜-菌轮作模式B、C、D中降低明显；细菌的优势群落是变形菌门、放线菌门、绿弯菌门以及酸杆菌门，鞘氨醇单胞菌属、伯克霍尔德氏菌属丰度在菜-菌轮作模式B、C、D中显著提高；聚类分析表明菜-菌轮作模式C、D下微生物群落结构相似度最高，常规轮作模式A可划分为区别于菜-菌轮作模式B、C、D的单独类群。综上所述，菜-菌轮作可降低真菌群落丰度，改变土壤微生物群落的结构组成，同时提高土壤中有益菌群的丰度，降低有害菌群的丰度。
全文链接
请求原文
基于IRAP标记的沙子空心李遗传多样性评价及指纹图谱构建
《华中农业大学学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：通过走访调查,选取92株具有优良性状的沙子空心李种质,根据李反转录转座子的RT序列开发IRAP标记引物,设计L16(43)的正交试验优化10μL IRAP-PCR主要影响因素的含量;利用18条IRAP引物对92份沙子空心李进行遗传多样性分析,构建供试种质的指纹图谱.结果显示:最优的10μL IRAP-PCR反应体系为10-5 mol/L IRAP引物l.3μL,PCR Mix 5.0μL、模板DNA(30 ng/μL)l.0μL,PCR循环40次.18条IRAP引物共扩增出189个位点,多态性位点180个,等位基因数、有效等位基因数、Nei's基因多样性指数和Shannon指数均值分别为1.930、1.426、0.261及0.405.采用邻接法将92份沙子空心李聚类为4个类群.确定IRAP引物Ty3-2及Ty3-6为核心引物,可高效构建92份供试种质的指纹图谱.
关键词： 沙子空心李 种质资源 分子标记 IRAP 指纹图谱 遗传多样性 种质创新
全文链接
请求原文
