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基于SSR标记分析31份甘薯品种(系)的遗传多样性

种子 2024 北大核心 CSCD

摘要:为了解不同甘薯资源材料之间的亲缘关系,以收集保存的31份甘薯品种(系)为研究对象,采用SSR标记分析不同材料之间的遗传多样性。结果表明,基于筛选获得的多态性较好的21对SSR标记,共检测到405个多态性等位位点,平均每对引物等位位点数为19.3个。31份甘薯材料遗传相似性系数在0.282 9~0.975 8之间,平均值为0.430 419,说明遗传多样性丰富。聚类分析表明,在遗传距离为0.638时,可将31份甘薯品种(系)分为四个类群。

关键词: 甘薯 遗传多样性 SSR标记 遗传相似系数

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淹水胁迫下鸭茅根系基因差异表达及相关通路分析

草业学报 2024 北大核心 CSCD

摘要:近年来我国南方地区洪涝灾害频繁发生,严重制约草牧业的发展.鸭茅作为重要的生态草种和优质牧草,耐淹性较差的特性严重影响其在频繁遭受洪涝区域的推广应用.本研究以国审品种"安巴"鸭茅为研究对象,对淹水胁迫0、8和24 h处理后的幼苗根系生理和转录等进行分析,以探究鸭茅在淹水胁迫下的响应机制.结果显示,淹水胁迫引起鸭茅根系中可溶性糖、可溶性蛋白和丙二醛含量显著增加,相对电导率先减少后显著升高.在淹水胁迫处理8 h后(相较于0h),鸭茅根系中有5788个差异表达基因,包括上调基因2872个,下调基因2916个.胁迫处理24 h后,鸭茅根系中共有8807个差异表达基因,包括上调基因4123个,下调基因4684个.GO富集显示,这些差异表达基因功能主要涉及多糖代谢、微管结合、纤维素代谢过程、抗氧化反应等.KEGG富集显示,鸭茅根系主要通过苯丙烷生物合成、碳代谢、谷胱甘肽代谢、氨基酸生物合成、淀粉和蔗糖代谢以及糖酵解/糖异生等途径来响应淹水胁迫.进一步分析苯丙烷生物合成、碳代谢、谷胱甘肽代谢通路中的差异表达基因,推测HXK1、HXK2、ADH1、GST和APX2等关键基因在鸭茅响应胁迫中发挥重要作用.MYB、NB-ARC、WRKY、GRAS和AP2等转录因子家族基因在淹水胁迫中表达丰富,可能与鸭茅的耐淹性密切相关.本研究结果为进一步探究鸭茅耐淹的分子机理提供了基础数据,也为后续的鸭茅耐淹性状改良工作提供理论支撑.

关键词: 鸭茅 淹水胁迫 根系 转录组 差异表达基因 代谢通路

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基于SSR分子标记分析石阡茶树资源遗传多样性

西南农业学报 2024 北大核心 CSCD

摘要:【目的】探明石阡茶树种质资源的遗传多样性和亲缘关系,为开发和保护石阡茶树资源提供理论依据。【方法】利用SSR分子标记技术,对贵州石阡7个茶树群体122份资源进行SSR位点多态性、遗传多样性及亲缘关系分析,并对不同地域来源的石阡茶树资源进行遗传距离分析。【结果】21对SSR引物共扩增出72个多态性位点,每对引物平均扩增3.43个位点,多态信息含量(PIC)为0.19~0.76,平均为0.51,等位基因在群体中分布均匀且多态性较高。7个茶树群体的Nei’s基因多样性指数(H)均值为0.22,Shannon信息指数(I)均值为0.33,多态位点百分率(PPB)均值为75%,遗传距离为0.0177~0.1036。122份石阡茶树资源的遗传距离为0.10~0.67,当遗传距离为0.21时,分为3个大类群:第I类群包含113份资源,第Ⅱ类群仅有1份茶树资源(SWXD009),第Ⅲ类群包含8份茶树资源,分别是SWXD-B、SWXD-F、SWXD-H、SWXD-M、SQT3、SQT4、SWX005和SWX006;在3个大类群中均有五德镇长兴村的茶树资源。【结论】贵州石阡茶树群体间的遗传差异较小,但群体内个体单株之间具有一定的遗传差异,尤其是五德长兴茶树群体内的遗传背景较丰富,筛选优异资源的基础较好。

关键词: 茶树 种质资源 贵州 石阡 遗传多样性 SSR分子标记

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小麦种质抗条锈病鉴定与分析

种子 2024 北大核心 CSCD

摘要:为了解贵州小麦条锈病抗性水平及抗性基因本底,本试验利用条锈病流行生理小种对274份小麦种质进行条锈病抗性表型鉴定,并结合已知Yr家族基因进行分子检测。结果表明,156份小麦种质田间表现出稳定成株期抗性,分子检测出Yr9、Yr10、Yr17、Yr18、Yr26、Yr29、Yr30、Yr65、Yr67、Yr78和Yr81等基因所在材料份数依次为2份、37份、53份、4份、49份、23份、91份、40份、15份、38份、15份、106份和145份,176份种质携带2个及以上Yr家族基因。材料中含有的基因数越多,对应群体材料的感病率下降。Yr5、Yr15、Yr17、Yr65和Yr78等基因与田间抗性相关性较明显,应充分利用生产上仍保持良好抗性的基因Yr5和Yr15。抗性基因Yr81在表达上可能与其他基因存在上位效应,在考虑上位效应、基因型与环境互作影响抗性表达和抗性基因相关的生理成本等问题的基础上,积极开展抗性基因的聚合育种工作,并充分利用现代生物技术手段快速培育具有持久抗性且农艺性状优良的小麦新品种,有效控制小麦条锈病大流行。

关键词: 条锈病抗性基因 小麦成株期抗性 分子检测

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甘蓝型矮秆油菜DW871激素敏感性及矮化突变机制的初步分析

中国油料作物学报 2024 北大核心 CSCD

摘要:本研究以甘蓝型矮秆油菜DW871及同源正常高秆油菜HW871为材料,通过光暗形态分析、对激素的敏感性分析及内源激素含量测定,初步探究DW871矮化突变类型。结果表明,DW871的光暗形态表型正常,下胚轴对外源独脚金内酯、赤霉素及油菜素内酯敏感性弱于HW871,IAA对DW871下胚轴伸长影响最小,且抽薹期外施激素后DW871的矮化表型未发生变化;测定了内源激素含量,结果 DW871的生长素和赤霉素含量高于HW871,油菜素内酯与HW871无差异,独脚金内酯含量低于HW871。通过光暗形态建成与激素敏感性分析,初步推测甘蓝型矮秆油菜DW871矮化机制可能与激素缺陷关系不大。

关键词: 甘蓝型油菜 DW871 油菜素内酯 赤霉素 生长素 独脚金内酯

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百里香酚对蜂糖李采后真菌多样性的影响

食品与机械 2024 北大核心 CSCD

摘要:[目的]提高对蜂糖李果实采后病害的防控能力。[方法]采用200μL/L百里香酚浸泡蜂糖李果实60 s,贮藏于(2.0±0.5)℃,检测其腐烂率、呼吸强度、硬度、外果皮h°、果肉h°和表面真菌多样性。[结果]贵州蜂糖李果实侵染性病害的致病真菌主要为葡萄孢属(Botrytis sp.)、镰刀菌属(Fusarium sp.)、青霉属(Penicillium sp.)和链格孢属(Alternaria sp.)。百里香酚处理可改变蜂糖李果实表面真菌群落结构,降低采后贮藏阶段表面真菌群落丰度和复杂性。并通过抑制上述4种致病菌属的增殖以及果实呼吸强度的上升,延缓蜂糖李果实硬度、外果皮h°、果肉h°的下降,从而显著抑制蜂糖李果实腐烂率,保证果实品质。[结论]百里香酚处理能有效降低蜂糖李果实贮藏过程中真菌群落丰度和复杂性,并有效抑制相关致病菌增殖,从而有效维持蜂糖李果实采后品质。

关键词: 蜂糖李 百里香酚 采后贮藏 品质 生物多样性 高通量测序

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三个多倍体猕猴桃基因组Survey分析及系统进化研究

果树学报 2024 北大核心 CSCD

摘要:【目的】全面了解多倍体猕猴桃种质资源的染色体倍性和基因组特征,并分析其在猕猴桃属植物中的系统进化关系,以期为多倍体猕猴桃全基因组组装提供参考。【方法】基于流式细胞术分析中华猕猴桃AcD2301(Actinidia chinensis)、软枣猕猴桃AcD2302(Actinidia arguta)、对萼猕猴桃AcD2303(Actinidia valvata)染色体倍性,利用Illumina二代测序平台开展基因组Survey分析,并基于SNP构建15种猕猴桃属植物系统进化树。【结果】中华猕猴桃AcD2301、软枣猕猴桃AcD2302、对萼猕猴桃AcD2303的染色体倍性分别为四倍体、四倍体、六倍体,与survey分析结果一致。Kmer分析预测中华猕猴桃AcD2301、软枣猕猴桃AcD2302、对萼猕猴桃AcD2303单套基因组大小分别约为626 Mb、668 Mb、585 Mb,杂合度为3.00%、3.30%、8.06%,重复序列比例为43.70%、45.30%、40.70%。系统进化树显示软枣猕猴桃与对萼猕猴桃亲缘关系较近,且均从中华猕猴桃独立进化而来。【结论】分析了中华猕猴桃AcD2301、软枣猕猴桃AcD2302、对萼猕猴桃AcD2303的染色体倍性、基因组大小和系统进化关系,为将来开展多倍体猕猴桃全基因组测序提供了参考,也为深入研究猕猴桃多倍化和系统进化提供了理论支持。

关键词: 猕猴桃 基因组survey分析 基因组大小 系统进化

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复合改良措施对喀斯特山区退化天然草地土壤性质和植被特征的影响

草业科学 2024 北大核心 CSCD

摘要:复合改良措施对促进退化天然草地生态系统恢复至关重要。为探明不同复合改良措施对喀斯特山区退化天然草地的改良效果,本研究通过野外调查、理化分析和高通量测序等手段,分析施肥+打孔+补播、施肥+绵羊宿营+补播、施肥+切根+补播、无改良对照(CK)处理下喀斯特山区退化天然草地土壤性质和植被特征差异。结果表明:1)相较CK,3种改良处理的土壤全氮、全钾、速效钾均显著提高(P <0.05),铵态氮和硝态氮显著降低(P <0.05),土壤脲酶活性均显著提高(P <0.05);土壤微生物生物量碳、微生物生物量氮、微生物生物量磷含量有一定提升,但差异不显著(P> 0.05)。2)相较CK,3种改良处理的真菌丰富度Chao指数显著提高(P <0.05),而细菌Simpson指数显著降低(P <0.05)。3)相较CK,3种改良处理的物种丰富度、产草量(青)和豆科牧草比例均显著提高(P <0.05),杂类草牧草比例极显著降低(P <0.01)。综上可知,3种改良处理均能在一定程度上改善退化天然草地的土壤肥力、草群结构和产草量,但在今后推广实践中还需综合考虑最佳施肥量、补播量和人工投入成本等因素。

关键词: 施肥 补播 打孔 绵羊宿营 切根 微生物 植被群落

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石漠化地区生态经济树种马桑的萌条生长特性研究

西北林学院学报 2024 北大核心 CSCD

摘要:为探究西南喀斯特石漠化地区生态经济树种马桑萌条生长特性和内部竞争作用,促进石漠化治理和生态重建,在西南喀斯特轻度石漠化环境下开展马桑扦插苗造林试验,自然生长2 a后对马桑幼林进行典型木调查,结果表明:1)单木水平上,幼木径向结构和垂直结构均符合同龄林特征的正态分布;萌条水平上,萌条径向结构和垂直结构均符合异龄林特征的不规则山状分布;2个水平上,径向生长与垂直生长间均存在极显著相关,且具有较高精度的线性关系;2)2年生萌条数量是1年生萌条数量的1.6倍,萌条角度比1年生萌条小10.3°,年龄对萌条生长特征存在极显著性效应;3)萌条健康状况与萌条特征有极显著关系,健康萌条表现出萌条角度大、基径粗、萌条高和次级分枝数多等特征,顶枯或死亡萌条的生长特征则相反;4)萌条间密度效应较为明显,2年生萌条多、细、矮,萌条形态呈平展型,而1年生萌条少、粗、高,萌条形态呈紧凑型。研究表明,在轻度石漠化背景下,随着生长年限增加,马桑植株和萌条生长呈较大分异,采用先r后k的生长策略,应根据马桑生长特性,采用人工稀疏、伐条等措施加强定向培育,提升马桑生态经济性能。

关键词: 马桑 萌条 生长 生态经济 石漠化

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高粱重要性状分子基础研究进展与展望

生物工程学报 2024 北大核心 CSCD

摘要:高粱是一种重要的粮食、能源、饲料和工业原料作物,具有广泛的生长适应性和多样的利用价值。在过去的几十年,传统育种方法在高粱育种中虽然取得了一定的成果,但如今仍然面临着一系列挑战,如育种周期长、育种效率低以及遗传背景复杂等。随着分子生物学、遗传学和生物信息学等技术的快速发展,分子育种技术开辟了提高高粱产量与品质的新途径。本文综述了包括高粱农艺性状和适应性性状等重要性状方面的分子基础研究进展,包括籽粒产量、籽粒品质、开花期和株高、分蘖特性、胁迫抗逆特性和雄性不育特性等,并对未来的重点研究方向进行了讨论,为高粱育种提供了新的思路和方法。

关键词: 高粱 农艺性状 适应性性状 分子育种 基因

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