科研产出
基于转录组学的不同色系蝴蝶兰花色苷差异积累分析
《分子植物育种 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：蝴蝶兰花色丰富且极具变化,是研究花着色机制的理想材料。本研究利用RNA Sequencing(RNA-Seq)技术比较三种不同色系蝴蝶兰花器官转录组,鉴定蝴蝶兰花色苷合成的相关基因,从转录组水平揭示蝴蝶兰花色苷生物合成的分子调控机制。选取白花蝴蝶兰(PAPW)、红花蝴蝶兰(PAPR)和黄花蝴蝶兰(PAPY)为试验材料,对其花苞及盛开花朵分别釆样,分别提取三个样品的总RNA,利用Illumina Hiseq 2 000进行测序分析,过滤处理后分别得到总Clean reads片段为60 031 912、57 685 822和55 765 402个,GC含量分别为47.78%、47.36%和49.48%,平均长度约为575 bp,N50长度为940 bp,对获得的All-unigenes进行功能注释,注释到Swiss-Prot、Nt、KO、Nr、GO和KOG数据库的Unigenes分别是22 321、19 199、8 671、28 952、20 152和10 380个;PAPR和PAPW相比差异基因共有642个,上调基因有354个,下调基因有288个;PAPY和PAPW相比差异基因共有2 459个,上调基因有132个,下调基因2 327个;KEGG代谢分析表明,2个对比组中的差异基因富集在不同代谢通路中。PAPR和PAPW差异基因主要富集在类黄酮生物合成,苯丙氨酸代谢和钙信号通路等代谢通路,其中类黄酮生物合成中差异基因为8个(7个上调,1个下调)。PAPY和PAPW差异表达基因主要富集在DNA复制,烷、哌啶和吡啶生物碱和细胞凋亡等代谢通路,其中,参与到淀粉与蔗糖代谢中的差异基因最多,有34条(1个上调,33个下调)。这些信息为蝴蝶兰不同花色苷形成相关关键基因的研究提供了重要依据。
关键词： 蝴蝶兰 不同色系 花色苷 转录组测序 差异表达基因
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大豆NIP类水孔蛋白基因的鉴定及表达特性分析
《浙江农业学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：NIPs(nodulin 26-like intrinsic proteins)是类根瘤菌26膜内在蛋白,属于水孔蛋白的一个亚类,在植物逆境胁迫应答过程中发挥重要作用。利用大豆基因组数据库,在全基因组水平共鉴定得到13个GmNIPs。染色体定位分析显示,这些GmNIPs基因分布在大豆11条染色体上。理化性质分析显示,GmNIPs蛋白氨基酸数目为261~296,蛋白分子量为27~32 ku,蛋白等电点为6~10。蛋白多序列比对分析发现,所有GmNIPs均含有水通道蛋白的典型结构,6个保守的跨膜螺旋(TM1-TM6)和2个保守的氨基酸元件NPA盒(Asp-ProAla box)。进化树分析发现,大豆GmNIPs与拟南芥和水稻NIPs分类完全一致。基因结构分析显示,所有GmNIPs基因均由5个外显子和4个内含子组成。启动子分析表明,多数GmNIPs基因的上游启动子区含有逆境和激素应答元件。组织表达分析发现,5个GmNIPs的基因表达量相对较高。进一步,利用荧光定量PCR对Gm NIP1;5的干旱胁迫表达特性进行了分析。
关键词： 大豆 NIP 水孔蛋白 全基因组鉴定 组织表达 干旱应答
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杨梅污染肺炎克雷伯氏菌的分离及其耐药特征和毒力基因
《浙江农业学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：杨梅在生产与运输过程中易受到病原菌的污染,为分析杨梅中肺炎克雷伯氏菌的携带情况及肺炎克雷伯氏菌的耐药特征和毒力基因,分别从杭州市场和杨梅生产基地采集90份杨梅样品,测定大肠菌群污染状况,使用梅里埃VITEK 2 Compact全自动微生物鉴定仪和16S r RNA测序方法鉴定肺炎克雷伯氏菌,采用VITEK 2阴性菌药敏卡对所获得的肺炎克雷伯氏菌进行耐药表型分析,PCR扩增检测耐药基因和毒力基因。结果表明:90份样品中共有51份样品存在大肠菌群污染,污染率为56.7%,有9株肺炎克雷伯氏菌,检出率为10%,其中8株肺炎克雷伯氏菌聚为一簇。9株肺炎克雷伯氏菌对氨苄西林、头孢唑林和呋喃咀啶均呈不同程度的耐药,尤其是氨苄西林耐药率达88.89%。9株菌株均携带tet A基因,检出bla TEM、gyr A、aad A1和aac(6')-1b耐药基因的阳性率均为88.89%,bla CTX-M、flo R、ere A、erm B和mec A等耐药基因未检出,毒力基因wca G、mag A、rmp A和菌素未检出。综上,杨梅中存在一定的肺炎克雷伯氏菌污染,但这些菌株未携带wca G、mag A、rmp A等毒力基因和菌素。
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卵泡中卵磷脂提取技术的研究
《浙江农业学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：为提高淘汰蛋鸡副产物的利用率及附加值,本实验以卵泡为原料,通过单因素和正交试验探讨了溶剂萃取技术对卵磷脂提取效果的影响。结果表明,卵泡中卵磷脂提取的最佳工艺条件为选择95%乙醇为提取溶剂,提取温度25℃,提取时间25 min,料液比1∶12。在此条件下,卵磷脂的得率和提取率可达到45.35%和90.14%。
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不同大豆品种中6种矿物质元素的波长色散型X射线荧光光谱法测定
《中国油脂 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：主要研究了波长色散型X射线荧光光谱法(WDXRF)在测定大豆中矿物质元素的应用。实验采用硼酸垫底压片制样,利用基本参数法(FP)建立标准曲线,测定样品中的矿物素元素含量。同时利用电感耦合等离子体发射光谱法(ICP-AES)进行验证。结果表明:WDXRF对大豆中的Mg、K、Ca、Mn、Cu、Zn 6种矿物质元素含量的检测是快速有效的。建立了大豆中这6种矿物质元素ICP-AES测量值与WDXRF测量值的经验线性模型y=ax+b,且Ca、Mn、Cu、Zn元素模型的相关度较好。
关键词： 波长色散型X射线荧光光谱分析法(WDXRF) 大豆 矿物质元素 电感耦合等离子体原子发射光谱(ICP-AES)
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家禽定点屠宰场不同屠宰区域空气的微生物结构
《食品科学 》 2018 EI 北大核心 CSCD
摘要：为了解家禽屠宰场空气中微生物分布情况及其结构特点,在浙江选择一家禽定点屠宰场,以菌落总数为指标,比较分析屠宰前和屠宰后各屠宰区域空气沉降微生物的数量,并提取微生物DNA作为模板,经聚合酶链式反应扩增细菌16S rRNA基因的V3～V4区,利用高通量测序技术分析其菌群结构。结果发现家禽屠宰场的不同屠宰区域空气沉降微生物数量有所差异,同时屠宰后微生物数量比屠宰前有所增加,特别是在屠宰后挂禽间菌落总数比屠宰前高出71%。高通量测序显示屠宰前和屠宰后不同屠宰区域空气沉降菌多样性、菌群结构、相对丰度等方面均无显著性差异(P>0.05),主要分布于6个门,优势菌门为厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)和放线菌门(Actinobacteria),总的相对丰度在84%以上。在属的水平上,葡萄球菌属(Staphylococcus)和不动细菌属(Acinetobacter)为优势菌属,分别占36.90%和13%(在前10个属中),此外,在前35个属中,葡萄球菌属(Staphylococcus)、寡养单胞菌属(Stenotrophomonas)和埃希菌属(Escherichia)等条件致病菌属分别占33.75%、4.65%和0.90%。由此说明屠宰场不同屠宰区域沉降菌数量存在一定差异,各屠宰区域均分布有一定数量的条件致病菌,研究为鸡肉微生物污染的溯源和完善家禽屠宰场卫生管理提供科学依据。
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超高效液相色谱-串联质谱法测定蜂蜜中抗生素和农药浓度
《浙江大学学报(理学版) 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：基于快速有效的基质净化方法,结合超高效液相色谱-串联质谱技术,建立了测定蜂蜜中39种抗生素及25种农药的检测方法.蜂蜜样品经乙腈+水(v/v=8:2)提取,用PRiME HLB净化,超高效液相色谱-串联质谱(ultraperformance liquid chromatography tandem mass spectrometry,UPLC-MS/MS)分析测定,通过多反应监测模式(MRM)分析目标化合物,并进行基质标准曲线定量.在测定浓度范围内呈良好线性关系,相关系数大于0.99;农兽药的检出限为0.02~3.8μg·kg~(-1),定量限为0.1~11.5μg·kg~(-1);在3档浓度的添加回收实验中,39种抗生素的回收率在72%~119%内,25种农药的回收率在72%~115%内,相对标准偏差均小于15%.随机抽取浙江市场上在售的52份蜂蜜样进行检测分析和膳食暴露评估,共检出罗红霉素、诺氟沙星和环丙沙星3种抗生素,检出率分别为2.6%,8.6%和3.9%,浓度分别为59.6~214.4,4.7~1 486.3和5.9~215.1μg·kg~(-1).膳食暴露评估结果表明,蜂蜜中抗生素残留对10岁以下组群的风险高于其他组群、女性消费者高于男性消费者;%ADI<100,说明膳食暴露评估风险水平尚可接受.因在计算中存在诸多不确定性因素,对组群的风险评估尚需进一步分析.
关键词： 抗生素 农药 蜂蜜 UPLC-MS/MS 风险评估
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适宜亚热带地区甜樱桃新品种'江南红' 被引量:1
《园艺学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：'江南红'是从'红灯'*'拉宾斯'杂交后代中筛选出的在亚热带地区有经济产量、耐受其气候条件的甜樱桃新品种.果实红色到紫红色,扁球形,平均单果质量7.7g,最大单果质量13.0g.果肉红色、致密,可食率92.8%,总酸9.84 g·kg-1,维生素C 68.7 mg·kg-1,可溶性固形物17.5%.果实成熟早,甜味浓,风味佳,成年树单株产量15~30 kg.
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