科研产出
茶树橙花叔醇和芳樟醇樱草糖苷含量全基因组关联分析及候选基因预测
《作物学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：橙花叔醇与芳樟醇是广泛分布于植物中的挥发性萜烯醇类化合物,在茶树新梢中主要以樱草糖苷形式存在,提高其含量对茶叶香气品质改良具有重要意义。为揭示茶树橙花叔醇和芳樟醇樱草糖苷的遗传机制,本研究以169个茶树自然杂交后代单株为关联群体,利用均匀分布在茶树染色体上的675,245个SNP标记,对3个年份下茶树新梢中橙花叔醇与芳樟醇樱草糖苷含量进行全基因组关联分析（genome-wide association study, GWAS）。结果表明,橙花叔醇与芳樟醇樱草糖苷含量的表型变异系数为60.83%～80.08%,广义遗传力分别为51.29%与61.87%,基本符合正态分布,具有典型的数量性状遗传特征。全基因组关联分析共检测到50个显著关联位点,各位点分别对橙花叔醇和芳樟醇樱草糖苷含量变化的贡献率均超过20%,其中橙花叔醇樱草糖苷含量（nerolidol primeveroside content, NPC）变化位点最大贡献率为38.73%,芳樟醇樱草糖苷含量（linalool primeveroside content, LPC）变化位点最大贡献率为39.07%。通过等位变异效应分析,鉴定出4个主效SNP位点及其优异等位变异,并发现1个可同时调控NPC和LPC的一因多效位点。结合已有的文献报道和基因的功能注释,筛选出每个显著位点置信区间内最有可能的候选基因共59个,主要涉及茶树的糖类代谢、转录调控、萜烯类生物合成等多个生物学过程,其中26个基因在适制绿茶品种和适制乌龙茶品种单芽中的表达水平存在显著差异。本研究为深入解析茶树橙花叔醇和芳樟醇樱草糖苷含量的遗传机制提供了新的信息,为加速培育高香型优异茶树新品种提供了重要的基因资源。
关键词： 茶树 橙花叔醇樱草糖苷 芳樟醇樱草糖苷 全基因组关联分析 候选基因
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饲粮中葛藤不同添加量对肉兔养分表观消化率、胃肠道发育及消化酶活性的影响
《草业学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为探讨葛藤在肉兔饲粮中的应用效果,开展葛藤的常规营养成分分析,选取35±2 日龄体重(0.88±0.13 kg)相近的断奶伊拉兔肉兔200只,随机分成4组,每组5个重复,每个重复10只,分别饲喂添加0(对照组)、15%、25%、35%葛藤的试验饲粮.预试期7 d,正试期42 d.于正试期第36天开始进行为期7 d的消化代谢试验,分析肉兔养分表观消化率,试验结束后测定分析肉兔盲肠消化酶活性及胃肠道的变化.结果显示,饲粮中添加不同量的葛藤:1)提高了各处理组肉兔对饲粮中干物质、粗蛋白、粗纤维、中性洗涤纤维、酸性洗涤纤维、酸性木质素、粗脂肪和半乳糖醛酸的表观消化率,35%葛藤组表观消化率最高,显著高于15%葛藤组与对照组(P<0.05).2)提高了肉兔盲肠中纤维素酶、半纤维素酶与果胶酶活性,15%葛藤组酶活性最高,显著高于对照组(P<0.05).3)对肉兔胃及小肠的相对长度无显著影响(P>0.05),但显著提高了盲肠相对长度和重量、胃相对重量与小肠相对重量,25%与35%葛藤组显著高于对照组(P<0.05).4)提高了肉兔空肠、回肠与十二指肠的绒毛长度、绒毛长度/隐窝深度比值(V/C)和黏膜层厚度,降低了隐窝深度值,35%葛藤组肉兔回肠、十二指肠的绒毛长度显著高于对照组(P<0.05),空肠、回肠的隐窝深度低于对照组,空肠、回肠的V/C显著高于对照组(P<0.05).因此,生长肉兔饲粮中最适宜的葛藤添加量为35%.
关键词： 伊拉兔 葛藤 养分表观消化率 胃肠道发育 消化酶活性
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甜玉米自交系重金属Pb、Cd积累差异及分子检测
《福建农业学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：【目的】筛选获得在重金属Pb、Cd单一污染及复合污染下Pb、Cd低积累的优良甜玉米自交系，以及可用于甜玉米重金属Pb、Cd积累早代鉴定的分子技术。【方法】以10个甜玉米自交系为供试材料，通过盆栽试验研究重金属Pb、Cd单一污染及Pb、Cd复合污染下，玉米根系、茎叶和籽粒中Pb、Cd含量的积累差异；同时对供试材料Zm HMA2 In Del位点进行Pb、Cd积累差异分子检测，综合分子标记检测与重金属Pb、Cd在不同材料间的积累结果，筛选甜玉米重金属低积累自交系。【结果】无论是单一污染还是复合污染，重金属Pb、Cd的积累规律均表现为根系＞茎叶＞籽粒；在复合污染下，玉米不同组织对重金属Pb、Cd的积累无明显竞争与协同效应，表明玉米Pb、Cd的积累机制存在一定差异。通过鉴定，获得籽粒Pb低积累玉米自交系2份，籽粒Cd低积累玉米自交系3份，仅有一份材料闽甜系X901表现出籽粒Pb、Cd均低积累。利用In Del位点（In Del2307）对供试材料进行分子检测，结果发现供试材料中有4份存在该位点，含有该位点的材料中根系、茎叶和籽粒Cd含量平均值较其他材料平均值分别低1.801、0.64、0.131 mg·kg-1。【结论】In Del2307位点能将不同玉米自交系按Cd累积量进行区分，对甜玉米Cd含量的区分具有特异性标记。综合分子标记检测与Pb、Cd含量积累结果，筛选出自交系闽甜系X901为Pb、Cd低积累材料。
关键词： 重金属 Pb污染 Cd污染 甜玉米 积累特征 分子检测
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饲粮发酵啤酒糟水平对闽东山羊生长性能、消化代谢、血清生化指标及瘤胃发酵的影响
《动物营养学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：本试验旨在研究饲粮发酵啤酒糟水平对闽东山羊生长性能、消化代谢、血清生化指标及瘤胃发酵的影响,为发酵啤酒糟在舍饲闽东山羊的科学利用提供参考.选择体重[(20.89±1.21)kg]相近的8月龄闽东山羊公羊24只,随机分为4组,每组6个重复,每个重复1只羊.对照组、试验Ⅰ组、试验Ⅱ组和试验Ⅲ组饲粮中发酵啤酒糟水平分别为0、12%、24%和36%,各组饲粮营养水平一致.预试期10 d,正试期7 d.结果表明:1)试验Ⅰ组和试验Ⅱ组的干物质采食量显著高于对照组(P<0.05).对照组和试验Ⅰ组的总能表观消化率显著高于试验Ⅱ组和试验Ⅲ组(P<0.05).试验Ⅱ组和试验Ⅲ组的酸性洗涤纤维表观消化率显著高于对照组和试验Ⅰ组(P<0.05).对照组的进食氮显著低于试验Ⅰ组、试验Ⅱ组和试验Ⅲ组(P<0.05).2)试验Ⅱ组和试验Ⅲ组的血清总蛋白含量显著高于对照组和试验Ⅰ组(P<0.05).3)试验Ⅱ组和试验Ⅲ组的瘤胃pH显著高于对照组和试验Ⅰ组(P<0.05),试验Ⅰ组、试验Ⅱ组和试验Ⅲ组的瘤胃丁酸含量显著低于对照组(P<0.05).4)在门水平上,试验Ⅱ组的瘤胃厚壁菌门(Firmicutes)相对丰度显著高于对照组和试验Ⅲ组(P<0.05),试验Ⅲ组的瘤胃拟杆菌门(Bacteroidetes)相对丰度显著高于试验Ⅰ组和试验Ⅱ组(P<0.05).在属水平上,试验Ⅲ组的瘤胃普雷沃氏菌属(Prevotella)相对丰度显著高于试验Ⅰ组和试验Ⅱ组(P<0.05),试验Ⅲ组的瘤胃琥珀酸菌属(Succiniclasticum)相对丰度显著高于对照组、试验Ⅰ组和试验Ⅱ组(P<0.05),试验Ⅰ组和试验Ⅱ组的瘤胃肠单胞菌属(Intestinimonas)相对丰度显著高于对照组(P<0.05).由此可见,饲粮中添加发酵啤酒糟可提高闽东山羊的干物质采食量和ADF表观消化率,在一定程度上提升瘤胃纤维素降解微生物的相对丰度,改善瘤胃发酵环境,且对闽东山羊的生长和机体代谢无负面影响.从本试验结果来看,饲粮发酵啤酒糟水平在12%~24%时饲喂效果最佳.
关键词： 发酵啤酒糟 闽东山羊 营养物质表观消化率 血清生化指标 瘤胃发酵
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基于高密度基因芯片的福恢2165重要农艺性状分子基础解析
《四川农业大学学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：[目的]福恢2165作为一种表现优良的恢复系,具有株叶形态好、配合力高、抗稻瘟病和米质优等特点.因此,明确福恢2165重要农艺性状的分子基础,可以为材料改良和杂交稻育种提供参考,促进福恢2165在水稻生产中的安全应用.[方法]评价福恢2165对稻瘟病的抗性表现,并通过水稻全基因组芯片技术分析材料的纯合度及基因组片段来源.检测与产量、抗非生物和生物逆境、品质、生育期、育性和株型等重要农艺性状相关的功能基因.对福恢2165及其亲本进行抗病相关基因的单倍型分析.[结果]福恢2165显示出稳定的稻瘟病抗性,其基因型纯合度高,遗传背景单一.基因组片段来源分析表明,福恢2165的基因组片段更多来自于华航丝苗和蜀恢527.功能基因检测结果表明,福恢2165聚合了多个与重要农艺性状相关的调控基因.此外,单倍型分析进一步揭示了福恢2165含有丰富的抗稻瘟病相关基因资源.[结论]通过深入分析福恢2165的基因型特征和重要农艺性状相关基因,揭示了其遗传特性和抗病性的分子基础.这些结果为福恢2165的遗传改良和育种利用提供了新的理论支持和实践指导.
关键词： 福恢2165 基因组片段 功能基因 稻瘟病 基因芯片
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籼型三系不育系'福农A'的选育及其综合农艺性状分析
《农业生物技术学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：杂交水稻(Oryza sativa)不育系是选育优良品种的重要前提之一,因此培育优异的不育系对杂交稻育种具有重要意义.本研究以高抗稻瘟病且优质的水稻品种'华航丝苗'作为供体亲本,与综合农艺性状优良但米质和稻瘟病抗性不佳的籼稻三系保持系'福稻B'进行杂交,在F3代中,选择优异单株做父本,用不育系'谷丰A'做母本进行测交;测交后代不断在三亚和沙县基地进行穿梭育种选择.经过多个世代的淘汰和选择,最终选育出了育性稳定的三系不育系'福农A',其对应的保持系定名为'福农B'.综合农艺性状分析发现,'福农A'株叶形态好,茎秆粗壮,剑叶挺直,其午前开花率达85%,茎秆的直径和厚度明显大于亲本.田间测试及显微观察结果显示,其不育株率为100%,花粉不育度为99.99%,柱头外露率为57.12%.'福农A'的茎秆倒三节直径明显较大,茎秆壁也明显较厚,且茎秆中半纤维素和硅含量较高.高密度芯片分析表明,'福农A'含有半矮秆基因Sd-1(semi dwarfing gene 1)和Sdt97(semi dwarfing mutant gene 97)、直穗基因qNGR9及粒重基因OsSPL16(squamosa promoter-binding-like gene 16).同时,'福农A'成功聚合了3个稻瘟病菌抗性基因Pi5(Pyricularia oryzae resistance-5)、Pid2和Pid3,室内鉴定其抗病株率达81.82%.此外,利用'福农A'所育成的7个水稻品种均表现出产量高、米质好、中抗稻瘟病等特征.由此可见,'福农A'具有较强的开发潜力,能为配组和选育抗性好、产量高、米质优的杂交稻提供种质资源.
关键词： 籼型三系不育系 ’福农A’ 稻瘟病抗性 综合农艺性状
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基于CRISPR/Cas系统的生物传感器在动物疫病诊断中的应用
《畜牧兽医学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：动物疫病不仅严重危害动物健康，阻碍养殖业良性发展，而且对人类健康构成潜在威胁。开发灵敏、特异、快速的诊断方法对于疫病防控尤为重要。PCR是目前检测病原体核酸的金标准，但是它存在检测周期较长，需要精密仪器和专业技术人员，无法应用于现场即时检测等局限性。成簇规律间隔短回文重复序列及其相关蛋白(clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated protein, CRISPR/Cas)具有敏感性高、特异性强和操作简便等优点，可为动物疫病诊断提供新的方法和契机。CRISPR-Cas9靶向核酸的特异性和CRISPR-Cas12/Cas13“附属切割”活性使其在核酸检测中显示出巨大的应用前景。本文简述了CRISPR/Cas系统的分类，对3种常用的CRISPR/Cas系统的核酸检测策略进行系统阐述，并对其在动物疫病诊断中应用的最新研究进展进行综述，最后讨论了它的优势、面临的挑战及未来发展方向，以期为动物疫病诊断新方法的开发提供参考。
关键词： CRISPR/Cas 生物传感器 动物疫病 检测
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基于黄花菜产量与品质特征的优异种质筛选及评价
《热带亚热带植物学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为筛选黄花菜(Hemerocallis citrina)优异种质资源,采用相关分析、逐步回归、通径分析和基于逼近理想解排序(TOPSIS)分析等方法,对 20 份菜用黄花菜种质的产量形成与品质进行了综合评价.结果表明,不同黄花菜种质的农艺、产量和品质性状变异丰富,变异系数为 1.9%~75.6%,其中以花蕾色度a*值的变异系数最大,总黄酮含量、花蕾质量次之,花蕾含水量最低.花蕾质量、花蕾粗和花薹数与产量均呈显著或极显著相关,相关系数分别为 0.737、0.583 和 0.517.营养品质间的相关性较弱,而外观颜色指标间及其与部分营养品质存在极显著相关性.影响黄花菜产量的主要决定因子为花蕾质量和花薹数,其决策系数分别为 0.534 和 0.239.营养品质和外观颜色的权重分别为 0.523 和 0.477,结合TOPSIS法可以对不同种质的品质进行有效区分.根据综合得分与产量绘制二维散点分布图可以快速筛选到产量与品质均佳的优异资源.
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外源钙离子对高温胁迫下草莓幼苗影响的转录组分析
《分子植物育种 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为探究添加外源钙离子后高温胁迫下草莓幼苗叶片的基因表达变化情况,本试验以'红颜'草莓幼苗为材料,设置4个试验处理,分别为对照(昼/夜25 ℃/17 ℃ 16 h/8 h)每株喷施20 mL蒸馏水、对照每株喷施20 mL的8 mmol/L CaCl2溶液、高温(昼/夜42 ℃/34 ℃ 16 h/8 h)每株喷施20 mL蒸馏水、高温每株喷施20 mL的8 mmol/L CaCl2溶液,在高温胁迫第3天时取叶片进行转录组测序和生物信息学分析.结果表明:与高温喷施蒸馏水处理组相比,高温喷施外源钙离子处理组发生差异表达的基因共有2 452个,其中1 504个上调表达,948个下调表达;GO富集分析显示在细胞组成中,差异基因显著富集在细胞、细胞部分和细胞器;在分子功能中显著富集的条目是结合、催化活性、结构分子活性;显著富集的生物过程为代谢过程、细胞过程、刺激应答等;KEGG富集分析表明显著富集的代谢通路有植物与病原体的相互作用和MAPK植物信号传导途径-植物和植物激素信号转导等,进一步分析发现添加外源钙离子会使一些编码钙离子感受蛋白、WRKY转录因子、MYB转录因子、热激转录因子和热激转录蛋白的基因响应高温胁迫而发生差异表达,这为探究Ca2+信号在草莓幼苗应对高温胁迫机制中发挥的作用提供有价值的数据信息.
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纳微化笋膳食纤维改善酸乳货架期乳清析出的作用机制
《食品科学 》 2024 EI 北大核心 CSCD
摘要：为明确纳微化笋膳食纤维(nanosized bamboo dietary fiber,NBDF)对凝固型酸乳货架期乳清析出的影响,采用多元复合纳微化改性对笋膳食纤维进行降解,研究不同粒径NBDF的乳润湿性,解析乳润湿性最优的NBDF对酸乳货架期乳清析出的抑制机制.结果表明:笋膳食纤维经超声-压热-酶解改性后形貌由块状转变为丝状,经高能机械球磨后微纤丝断裂形成纳米团簇状;NBDF的乳润湿性随粒径减小呈先升高后下降的趋势,其中粒径10~30μm的微纤丝与乳体系间润湿性最强;进一步研究发现,添加9 g/L NBDF(粒径10~30μm)可提高凝固型酸乳凝胶的振荡稳定性,且经28 d货架期后的凝固型酸乳乳清析出率为5.84%,仅为未添加NBDF组的57.87%,这与NBDF能有效提高乳体系的束缚水比例(提高41.4%)、改善酪蛋白凝胶网络结构,并提高其涂布性使发酵酸乳形成细小、均匀的乳清孔隙通道有关.
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