科研产出
分子动力学模拟研究直链淀粉与α-亚油酸的包合行为
《中国粮油学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：α-亚油酸和直链淀粉可以形成热力学稳定复合物。为了研究α-亚油酸影响直链淀粉构象的机理、复合物的构象趋势及复合作用过程中氢键的变化情况,在373 K条件下进行了长时间(500 ns)的全原子分子动力学模拟。模拟发现在有/无α-亚油酸存在的情况下,在500 ns内都可以观察到大量有序到无序的构象转变,这表明直链淀粉和α-亚油酸之间结合作用微弱。原子均方根偏差(RMSD)、α-亚油酸与直链淀粉轴心间距、氢键增加都证明直链淀粉-α-亚油酸复合物的形成是热力学自发行为。
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糯玉米‘沪五彩花糯1号’品系特异性2b-RAD分子标记的开发及应用
《植物生理学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：应用基于IIB型限制性内切酶的RAD(2b-RAD)技术,对‘沪五彩花糯1号’及其亲本材料进行了简并基因组测序。利用RADtyping分型策略,通过与‘B73’参考基因组比对,我们在3个玉米样品的共同测序标签内筛选获得了9 726个单核苷酸多态性(SNP)位点。在此基础上,利用9 707个位于玉米染色体上的SNP位点对‘沪五彩花糯1号’及其亲本进行了基因型分析,开发出可用于‘沪五彩花糯1号’品系特异性鉴定的9个SNP分子标记。这些研究结果为‘沪五彩花糯1号’品系特异性鉴定和优质性状遗传组成的分子机理研究奠定了基础。
关键词： ‘沪五彩花糯1号’ 基因型 2b-RAD 品系特异性 SNP
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4种芽前除草剂防除直播小白菜田杂草的效果及其安全性
《植物保护 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：采用田间试验方法研究了33%二甲戊灵乳油、96%精异丙甲草胺乳油、50%敌草胺水分散粒剂和90%禾草丹乳油4种芽前除草剂防除直播小白菜田杂草效果及其安全性,筛选出了适于直播小白菜田的芽前除草剂。结果表明,药后35d,33%二甲戊灵乳油有效用量371.25~742.5g/hm2、96%精异丙甲草胺乳油864~1 080g/hm2和90%禾草丹乳油1 687.5~2 025g/hm2处理无论是总草株防效还是鲜重防效均在94.27%以上,其次是50%敌草胺水分散粒剂750~1 500g/hm2处理,防效为85.62%~90.54%。33%二甲戊灵乳油各供试剂量虽对小白菜的出苗没有影响,但对小白菜的生长有一定影响,表现为地上部株高和鲜重受抑制;其他3个供试除草剂各剂量处理对小白菜出苗和生长安全。从除草效果和安全性两方面综合考虑,推荐96%精异丙甲草胺乳油864~1 080g/hm2和90%禾草丹乳油1 687.5~2 025g/hm2用于小白菜田芽前防除杂草。
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毕赤酵母表达罗氏耶尔森氏菌(Yersinia rohdei)植酸酶和酶学特性研究
《上海农业学报 》 2016 CSCD
摘要：按毕赤酵母偏爱密码子,将来自Yersinia rohdei的植酸酶基因(YrAPPA)进行了化学合成,并成功在毕赤酵母GS-115中异源分泌表达,重组植酸酶分泌量能达到72μg/mL。酶学特性研究结果表明:酶比活达到1 500 U/mg,重组植酸酶的最适反应温度和pH分别为55℃和4.5;纯化的重组植酸酶能耐受60℃高温,且pH 3—7.5范围内重组植酸酶有良好的稳定性;Cu~(2+)、Zn~(2+)、Fe~(3+)对植酸酶活性有抑制作用;重组植酸酶有抗胃蛋白酶和胰蛋白酶水解特性。
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草菇漆酶基因在子实体形成过程中的表达分析
《食用菌学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：为了探明草菇(Volvariella volvacea)漆酶基因的功能,采用实时荧光定量PCR方法对11个漆酶编码基因(lac1-11)在子实体不同发育阶段的表达水平进行研究,结果表明:草菇漆酶在针头期、纽扣期、蛋形期、伸长期和成熟期均发生转录;表达趋势分为三类:lac1、lac5、lac7和lac8表达量针头期最高;lac3、lac6和lac11从针头期至蛋形期逐渐升高,自伸长期表达量有明显下降;lac2、lac4、lac9和lac10在纽扣期最高,随后表达量逐渐降低,其中lac9与lac10在成熟期又有了小幅度的提高。这些结果说明草菇不同的漆酶在子实体发育中可能起到不同的作用。
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沪农灵芝1号全基因组分析和演化比较
《食用菌学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：对"沪灵芝"(Ganoderma lucidum SH)等23个真菌物种进行全基因组系统发生分析,进一步选取其中具有代表性的物种进行比较基因组学分析。全基因组系统发生分析和分子钟估计结果显示,沪灵芝分化时间(8.75百万年前)明显晚于灵芝属分化时间(180百万年前);基因家族尺寸和直系同源基因数目分析显示,与另外参试灵芝菌种相比沪灵芝基因家族具有一定的收缩趋势;进一步对基因家族数目进行比较的结果显示,沪灵芝逆转录酶家族发生了显著扩增。GO功能分析提示沪灵芝逆转录酶家族的功能富集主要为核酸结合功能和酶的催化活性。
关键词： 灵芝 全基因组分析 分子钟 基因扩增 GO功能分析
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长三角区域花椰菜遗传多样性及与其近缘种亲缘关系的SRAP分析
《上海农业学报 》 2016 CSCD
摘要：为深入研究长三角区域主要花椰菜资源的遗传变异及与其近缘种的亲缘关系,为花椰菜种质资源利用和杂交新品种选育奠定基础,对区域内的36份花椰菜及其近缘种材料进行了亲缘关系的SRAP分析。结果表明:20对SRAP引物共产生稳定清晰的扩增条带105条,其中多态性条带52条,多态性带的比例为49.52%,36份花椰菜及其近缘品种资源遗传相似系数为0.553—0.990,26份花椰菜之间的相似系数为0.693—0.990,花椰菜及其近缘种间的相似系数高、变幅小、遗传基础比较狭窄。聚类分析表明:花椰菜和宝塔花菜亲缘关系最近,青花菜次之,芥蓝最远,熟性是影响长三角区域花椰菜品种资源类群的主要因素。
关键词： 花椰菜 SRAP分子标记 聚类分析 遗传多样性 亲缘关系
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三种食用菌菌渣部分替代废棉栽培草菇
《食用菌学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：以工厂化生产刺芹侧耳(Pleurotus eryngii)菌渣(SP)、真姬菇(Hypsizygus marmoreus)菌渣(SH)和双孢蘑菇(Agaricus bisporus)菌渣(SA)替代部分废棉(CW)栽培草菇(Volvariella volvacea)9715菌株,结果与对照培养料(97CW+3%石灰)相比,用60%的SP和SA分别替代CW可使草菇生产周期缩短1.6d、产量分别提高15%和17%;30%的SP和SA分别替代CW生产周期与对照没有显著差异,产量皆提高7%;30%的SH替代CW进行草菇栽培时生产周期与产量和对照基本相同。
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太湖缓冲带林下草坪的生长趋势研究
《湖泊科学 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：为提升太湖缓冲带林带的生态功能,减少入湖污染负荷,采用人工草坪替代林下杂草的方式,建立林草复合带.选取白三叶(Trifolium repens)、红花酢浆草(Oxalis corymbosa)、麦冬(Ophiopogon japonicus)、马蹄金(Dichondra erpens)和狗牙根(Cynodon dactylon)5种草坪,在典型缓冲带林地按间距25 cm统一移栽种植.采用定位监测的方法分析草坪的生长特征与发展趋势.结果表明:2011-2014年期间,除狗牙根无法形成稳定的种群被杂草取代外,其他4种草坪均能正常生长,并形成优势种群;4种草坪中,以麦冬和马蹄金生长状况最好,生物量、盖度、均一性和青绿期综合指标等级较高,其次是白三叶;红花酢浆草种群不稳定,受水热的影响大.
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