基于微流控芯片的鲑科鱼类单核苷酸多态性分型系统构建

赵紫霞; 许建; 吴碧银; 曹顶臣; 白庆利; 徐鹏; 马卓君; 《水生生物学报 》 2022 北大核心 CSCD

摘要：为开发针对大规模样本、低通量位点的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)分型技术,研究依据虹鳟高通量SNP芯片检测鲑科4个属不同物种群体样本的结果,筛选获得了96个高质量共享多态性位点,应用Fluidigm 96.96微流控动态芯片平台,构建了用于鲑科物种增殖放流个体识别的SNP分型系统.以细鳞鲑为例评估芯片分型结果可靠性,分型成功率为98.63%,与Affymetrix高通量芯片分型一致性达到97.92%.基于该芯片分型结果,使用CERVUS 3.0.7软件对96尾细鳞鲑子代样本及其候选亲本和干扰亲本进行亲权鉴定,结果能够准确重现复杂家系的真实系谱,在用于单亲本亲权鉴定时,第一亲本非排除率(Non-exclusion probability for first parent,NE-1P)为4.362×10–4,用于双亲本亲权鉴定时,双亲非排除率(Non-exclusion probability for parent pair,NE-PP)为6.538×10–12,完全满足增殖放流回捕个体分子鉴定的需求.基于该芯片分型数据进行STRUCTURE遗传结构分析,可以明确区分不同来源野生群体的遗传组分,并对待测个体的遗传组分进行初步判别,能够满足种群遗传结构初步评估的需求.研究构建的包含96个位点的SNP分型系统,适合应用于鲑科鱼类增殖放流个体识别、种群遗传结构动态评估,以及在此基础上开展的增殖放流效果评估.

关键词： 鲑科鱼类 单核苷酸多态性 微流控芯片 增殖放流 亲权鉴定

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养殖水体及水产品中土臭素、二甲基异莰醇的变化特征及原因初步分析

邹剑敏; 卢奇; 桂源; 钟立强; 宋超; 陈家长; 《江苏农业学报 》 2022 北大核心 CSCD

摘要：为了探究水产品的种类和养殖时间对养殖水体及水产品中土臭素(GSM)和二甲基异莰醇(2-MIB)的影响,本研究以无锡地区不同种类水产品和养殖水体为研究对象,在5-10月份对养殖水体中GSM和2-MIB的质量浓度以及收获时水产品中GSM和2-MIB的含量进行检测.结果表明,水产品种类和养殖时间的变化会在一定程度上影响养殖水体中GSM和2-MIB的质量浓度,在不同水产品的养殖水体中,GSM、2-MIB质量浓度随养殖时间推移呈现出不同的变化趋势.在水产品中仅检出GSM,其在虾蟹类、四大家鱼和罗非鱼中的含量分别为0.45μg/kg、0.62μg/kg和0.94μg/kg,生物浓缩系数分别为40.10、71.68、27.07,四大家鱼富集GSM能力最强,说明水产品的种类会影响水产品中GSM的含量.

关键词： 养殖水体;土臭素;二甲基异莰醇;水产品

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一株湖北源大口黑鲈蛙病毒的分离鉴定

罗晓雯; 沈锦玉; 阳涛; 曾令兵; 周勇; 范玉顶; 刘文枝; 李逸群; 薛明洋; 孟彦; 江南; 《中国水产科学 》 2022 北大核心 CSCD

摘要：采用电子显微镜观察和细胞培养等技术,从湖北黄陂某养殖场患病大口黑鲈（Micropterus salmoides）体内发现并分离到一株蛙病毒。患病大口黑鲈的临床症状主要表现为体表出血、溃疡,肝脏发白。将病鱼内脏组织匀浆超微滤液接种鳜脑细胞系（mandarin fish brain,MFB）细胞能产生典型细胞病变效应（cytopathic effect,CPE）,病毒滴度达到10^8.36±0.15 TCID₅₀/m L。细胞培养病毒的超薄切片电镜观察结果显示,细胞质中存在大量直径约为150 nm左右的正六边形病毒粒子,呈晶格排列。细胞培养病毒的人工感染大口黑鲈试验结果显示,7 d内试验鱼死亡率高达100%,其临床症状与自然发病鱼相似。采用大口黑鲈病毒（largemouth bass virus,LMBV）的特异性PCR检测方法对患病鲈组织样品和细胞培养病毒样品进行检测,均能扩增出241 bp的单一目的条带。进一步根据Gen Bank中LMBV主衣壳蛋白（major capsid protein,MCP）基因序列设计特异性引物,均能从上述样品中扩增出1392 bp的MCP基因开放阅读框（open reading frame,ORF）全长。将MCP氨基酸全序列进行比对,结果显示其与Santee-Cooper蛙病毒、孔雀鱼病毒6型及大口黑鲈溃疡综合征病毒的MCP氨基酸序列同源性高达100%。系统进化结果显示,与感染鱼类的虹彩病毒科蛙病毒属病毒,如鳜鱼蛙病毒、Santee-Cooper蛙病毒、孔雀鱼病毒6型和大口黑鲈溃疡综合征病毒等聚成一支。这些结果证明,该分离株为虹彩病毒科蛙病毒属的成员,暂命名为大口黑鲈蛙病毒（largemouth bass ranavirus,LMBRa V）湖北株LMBRa V-HB001。病毒敏感细胞系筛选试验结果表明,病毒LMBRa V-HB001感染鲤上皮瘤细胞（epithelioma papulosum cyprinid,EPC）、草鱼性腺细胞（grass carp ovary,GCO）、大鲵肌肉细胞（giant salamander muscle,GSM）和鲫脑组织细胞（gibel carp brain,Gi CB）均能产生典型CPE,病毒滴度可达10^8.0 TCID₅₀/m L以上。本研究首次在湖北省养殖大口黑鲈体内分离与鉴定了LMBRa V病毒,建立了病毒的细胞培养方法,为进一步研究该病毒的传播、诊断和防控技术提供了重要参考。

关键词： 大口黑鲈 蛙病毒 细胞培养 病毒分离鉴定

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罗非鱼严业技术与发展趋势(中)

肖炜; 祝璟琳; 喻杰; 杨弘; 《科学养鱼 》 2022 北大核心

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拉萨裂腹鱼3种同工酶的电泳分析

张涛; 张林; 甘金华; 何力; 《华北农学报 》 2022 北大核心 CSCD

摘要：为了了解拉萨裂腹鱼的生化遗传特性，丰富拉萨裂腹鱼种质资源研究的内容。借助聚丙烯胺凝胶对拉萨裂腹鱼5种组织（心脏、眼睛晶状体、肌肉、肝脏和血清）中的乳酸脱氢酶（LDH）、5种组织（心脏、眼睛晶状体、肌肉、肝脏和肾脏）苹果酸脱氢酶（MDH）以及肝脏醇脱氢酶（ADH）进行了电泳分析。研究结果表明：所测样本鱼心脏、眼睛晶状体、肌肉、肝脏和血清中的LDH酶带数分别为：6～10条，8～10条，4～7条，0～7条和1～7条，LDH-C基因只在肝脏中表达；心脏、眼睛晶状体、肌肉、肝脏和肾脏中MDH酶带数分别为6～7条，2～6条，5～7条，5条和3～5条；肝脏ADH酶带数为3条。拉萨裂腹鱼的LDH和MDH同工酶系统具有组织特异性和个体差异性。组织特异性主要体现在酶带数目和表达活性程度不同两方面，与各组织执行生理功能密切相关。拉萨裂腹鱼同工酶个体差异性可能是其漫长的进化过程中为了能适应特殊生境的需要。

关键词： 拉萨裂腹鱼 乳酸脱氢酶 苹果酸脱氢酶 醇脱氢酶 组织特异性 个体差异性

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两种增色剂对阿里雌鱼生长及体色调控的研究

姜巨峰; 周勇; 史东杰; 刘肖莲; 刘克明; 李春艳; 韩现芹; 牟希东; 宋红梅; 《西南师范大学学报(自然科学版) 》 2022 北大核心 CSCD

摘要：为探索饲料中添加雄烯二酮和睾酮对阿里雌鱼生长及体色的影响,将810尾初始体质量为5.78±1.05 g的阿里雌鱼随机分为9组,每组3个平行,每个平行30尾鱼,对照组投喂基础饲料,试验组分别投喂含100,200,300,400 mg/kg雄烯二酮(A100,A200,A300,A400组)和100,200,300,400 mg/kg睾酮(T100,T200,T300,T 400组)8个浓度梯度的饲料.观察8周增色时间和4周停药期鱼的生长及体色变化情况.结果显示:不同浓度的雄烯二酮和睾酮对阿里雌鱼的成活率没有影响,均为100%.A200组的阿里雌鱼特定生长率(SGR)最高,为0.39,显著高于T100,T200,T400组和对照组(p<0.05).8周增色后,A300组的阿里雌鱼体色总色差值(△E*ab)、黄蓝度值(b*)与A400,T300组差异无统计学意义(p>0.05),但均小于其他各组(p<0.05);在后4周停药期中,体色呈现先增艳后又缓慢减弱的现象,仍维持在体色较艳的程度.结果表明,饲料中添加雄烯二酮比睾酮更有效地促进了阿里雌鱼的生长和增色,A300,A400组增色后的阿里雌鱼体色能够稳定4周,阿里雌鱼适宜增色剂及添加量为雄烯二酮300 mg/kg.

关键词： 雄烯二酮 睾酮 阿里雌鱼 生长 增色

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基于血液转录组分析的长江江豚雌雄两性免疫适应性

尹登花; 蔺丹清; 严燕; 郭弘艺; 朱孝彦; 张亚; 刘凯; 唐文乔; 《中国水产科学 》 2022 北大核心 CSCD

摘要：为阐明长江江豚两性免疫系统特征及免疫适应性机制，本研究以3头雌性和3头雄性长江江豚（Neophocaena asiaeorientalis）血液为实验样本,经BGISEQ-500测序平台进行mRNA和microRNA测序。结果显示,从6个样本中共获得了15878个unigenes和985个microRNAs, KEGG分析发现有1534个unigenes注释到免疫系统相关类别并显著富集于20个常见免疫通路（P＜0.05）。将两性血液转录组进行比较,鉴定了539个差异表达基因（DEGs）和160个差异表达miRNAs （DEMs）,其中有299个是雌偏好表达基因, 240个是雄偏好表达基因。GO和KEGG富集分析显示,雌性长江江豚中血液基因与免疫反应和能量代谢功能显著相关,而雄性长江江豚中血液基因与免疫反应和细胞生长功能显著相关。此外,通路富集分析还发现FoxO和Hippo两条免疫相关信号通路在雌性长江江豚血液中被激活。基于DEGs和DEMs的联合分析,预测了45对miRNA-mRNA负调控关系,包括13个DEMs和对应靶向关系的37个免疫相关DEGs。研究表明, microRNAs通过调控基因表达参与长江江豚两性免疫系统,且成年雌性长江江豚可能具有更强的免疫力及维持机体内稳态的能力。本研究旨在利用RNA-seq测序技术从基因表达调控水平解析长江江豚两性免疫适应性机制,并为阐释雌雄长江江豚对多样生境的适应能力从免疫角度提供新视角,同时为长江江豚保护提供科学借鉴。

关键词： 长江江豚 免疫适应性 性别 血液转录组

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南北方越冬对皱纹盘鲍生长的影响

卢龙飞; 李长青; 常丽荣; 李加琦; 胡晓丽; 刘力源; 倪甜; 王振华; 《江苏农业科学 》 2022 北大核心

摘要：南北方接续养殖是国内一种广泛应用的鲍越冬养殖模式,对南冬-北夏、北冬-北夏条件下不同龄期(6、18月龄)和品种(系)(选育、野生、杂交)的皱纹盘鲍(Haliotis discus Hannai)的生长情况进行探究.结果表明,在经过6个月的越冬后,南方和北方越冬鲍均显著生长,其中南方越冬鲍(6、18月龄鲍分别为76.01、110.94 mg/d)的生长优势显著优于北方越冬鲍(12.50、42.84 mg/d),但越冬期存活率(6、18月龄鲍分别为90.31%、73.67%)显著低于北方鲍(94.92%、86.43%),龄期对鲍生长影响显著,6月龄鲍在越冬期间的生长优势(壳长和体质量增长率分别为54.65%、239.89%)高于18月龄鲍(9.38%、35.74%).虽然在南方越冬显著提高了鲍的生长速率,但越冬期间及后续度夏期的存活率均极显著低于北方越冬鲍.说明在北方冬季海水温度相对较高的条件下,18月龄鲍在北冬-北夏模式下可获得与南冬-北夏相当的体质量增长量.

关键词： 皱纹盘鲍;越冬模式;品种(系);生长;龄期

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海洋渔业生物种质资源库设计和建设要点初探-以国家海洋渔业生物种质资源库为例

祝令民; 解凌燕; 王跃军; 辛福言; 《水产科技情报 》 2022 北大核心

摘要：海洋渔业生物种质资源库是现代种业提升工程规划中的重要内容,早在2007年就启动了项目前期工作,其他海区分库和淡水渔业生物种质资源库也于近期启动项目申报工作.目前我国仍没有种质库尤其是海洋渔业生物种质资源库的设计、建设标准,国家海洋渔业生物种质资源库的建设可以说是一个在摸索中前进,发现问题和解决问题的历程.文章系统概述了海洋渔业生物种质资源库的保存现状、特点和功能,国家海洋渔业生物种质资源库的设计原则、指标要求,以及在设计和建设中遇到的问题及其解决措施,以期对渔业生物种质资源库的建设起到一定的借鉴作用.

关键词： 海洋渔业生物种质资源 资源库 设计 问题

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中国对虾Gs基因克隆及其在急性低盐胁迫下功能分析

周雨欣; 何玉英; 李健; 魏威; 王琼; 谢拥军; 《水生生物学报 》 2022 北大核心 CSCD

摘要：采用RACE技术对中国对虾cAMP信号通路内鸟嘌呤核苷酸结合蛋白α亚基(Guanine nucleotide-binding protein G(s)subunit alpha)基因进行克隆并对其功能进行分析.将基因命名为FcGs,该基因cDNA全长为1692 bp,编码379个氨基酸.对同源性进行分析显示与凡纳滨对虾同源性为99%,与日本囊对虾同源性为97%.FcGs基因组织表达分析显示,鳃和肝胰腺表达量较高.急性低盐胁迫使FcGs基因整体呈现上调表达.对中国对虾cAMP信号通路内Gs含量及Gs基因上游多巴胺(DA)含量,下游环腺苷酸(cAMP)和蛋白激酶A(PKA)含量及腺苷环化酶(AC)和钠钾ATP酶(Na+-K+-ATPase)活力进行测定,发现急性低盐胁迫后整体均呈上升且变化趋势基本一致.对FcGs基因进行干扰后中国对虾死亡率上升.研究表明,FcGs基因及其所在的cAMP信号通路可以通过调控Na+-K+-ATPase的活力在中国对虾渗透压调节过程中发挥重要作用.

关键词： 低盐胁迫 Gs 基因克隆 组织表达 渗透压调节 中国对虾

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