科研产出
基于生态通道模型的鲥鯸淀生态系统营养结构和能量流动研究
《中国水产科学 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：利用Ecopath with Ecosim（EWE）模拟生态系统能量通道模型,比较分析了鲥鯸淀生态修复区和对照区的生态系统结构、食物网变化和能量流动特征。结果表明,生态修复区同种鱼类营养级略低于对照区;修复区牧食链与腐食链增加了鲇、鳜以及团头鲂、草鱼,相比对照区更为复杂。生态修复区各营养级之间能量的转换效率（Ⅱ～Ⅱ依次为0.0521、0.0205、0.0144）高于对照区（Ⅱ～Ⅱ依次为0.0406、0.0138、0.00854）,且总能量转换效率（2.5%）也高于后者（1.7%）。生态修复区连接系数（0.22）略低于对照区（0.27）,但系统杂食性指数则相反（0.15>0.14）;生态修复区Finn’s循环指数（0.61）、Finn’s平均路径长度（0.08）低于对照区（分别为1.73、2.20）。两区域生态系统的总体特征表明,生态修复区食物网结构更为复杂,能量传递效率有所提高;但生态系统的营养流经食物链的长度缩短了,物质再循环的比例有所下降。同时,生态修复区存在生产量大于呼吸量的情况,鲥鯸淀区域应该适当放流肉食性、草食性鱼类,定期捕捞滤食性鱼类,增加生态系统的能量流动,促进生态系统的良性发展。
关键词： 鲥鯸淀 生态通道模型 营养结构 能量流动 大水面 生态渔业
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基于COⅠ基因研究钱塘江三角鲂亲本、放流和自然捕捞群体的遗传多样性与遗传分化
《大连海洋大学学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：为研究三角鲂Megalobrama terminalis亲本、放流和自然捕捞群体的遗传多样性现状和群体间的遗传分化,运用PCR产物纯化测序的方法,测定了三角鲂2个亲本群体、3个放流群体和1个自然捕捞群体共计6个群体224尾样品的线粒体细胞色素C氧化酶Ⅰ亚基（cytochrome C oxidase subunitⅠ,COⅠ）基因序列。结果表明:在661 bp序列中共检测到192个变异位点（占核苷酸总数的29.05%）,A、T、C、G的平均含量分别为26.5%、28.0%、29.0%和16.5%,A+T含量（54.5%）高于G+C含量（45.5%）;共检测到31个单倍型,其中,6个为至少2个群体共享的单倍型,hap9和hap2为第一、二优势单倍型,分别占样本总数的48.66%和22.32%,25个为仅1个群体享有的特有单倍型（占总样本数的13.4%）,这与基于单倍型的网络结构图得出的hap9为最原始单倍型的结果一致;6个群体的单倍型多样性（Hd）为0.710～0.848（平均值0.705）,核苷酸多样性（Pi）为0.003 07～0.008 40（平均值0.005 78）,其中,景山亲本群体遗传多样性最高,余杭放流群体遗传多样性最低;群体间遗传分化系数(Fst)为-0.009 34～0.193 55（平均值0.099 09）,基因流（Nm）>1;分子方差分析（AMOVA）显示,群体内遗传变异为90.09%,群体间遗传变异为9.91%,6个群体间的Nei’s遗传距离为0.003～0.009。研究表明,钱塘江三角鲂群体遗传多样性较高,群体间基因交流较多,部分群体间存在中等遗传分化,自然捕捞与养殖群体间不存在显著的遗传分化。
关键词： 三角鲂 钱塘江 COⅠ基因 群体 遗传分化 遗传多样性
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多纹钱蝶鱼胚胎发育及胚后发育观察
《中国水产科学 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：为建立多纹钱蝶鱼（Selenotocamultifasciata）人工繁育技术,为其生产性育苗工艺和管理技术的建立提供科学依据,采用人工养殖的多纹钱蝶鱼经人工催产获得受精卵,对胚胎及胚后发育阶段进行了连续观察、拍照和测量。结果显示,水温（27.0±1.0）℃,盐度32条件下,多纹钱蝶鱼从受精卵发育,经18 h 20 min出膜,受精后3 h进入囊胚期, 4.5 h进入原肠期, 8 h进入胚体形成期, 8.5 h进入器官形成期,器官形成顺序为视囊期、尾泡形成期、肌节期、脑泡期、耳囊期、尾芽期、尾鳍期、晶体形成期、耳石形成期, 16.5 h出现心跳, 17.5 h出现肌肉效应, 18.5 h完成出膜。多纹钱蝶鱼胚后发育分为仔鱼期、稚鱼期和幼鱼期,初孵仔鱼全长1.350～1.655 mm;水温26℃下,出膜后2 d卵黄囊完全消失;出膜后3 d仔鱼开口,口裂0.265～0.280 mm;出膜后15 d,鱼体体色加深,进入稚鱼期;19 d,胸鳍发育完全; 23 d,背鳍发育完全; 29 d,尾鳍、臀鳍发育完全; 33 d,鱼身上鳞片基本长出,身体不再透明,发育至幼鱼期,此时全长15.625～15.647 mm,体长12.013～12.234 mm,体重0.045～0.059 g,心跳150～159次/min。
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一株新型大口黑鲈双RNA病毒巢式RT-PCR检测方法的建立及应用
《水产学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：为有效预防大口黑鲈双RNA病毒（largemouth bass birnavirus, LBBV）,实验针对LBBV保守基因VP1设计特异性引物,构建重组质粒pMD-LBBV-VP1,通过优化PCR反应条件,提高检测方法的灵敏度和特异性,建立了大口黑鲈双RNA病毒的巢式RTPCR检测方法,并采用该方法对实验室2017—2020年收集的304株样本进行检测。结果显示,巢氏引物F1/R1、F2/R2最佳工作浓度均为4×10-12 mol,最佳退火温度分别为64.1℃和61.5℃,当巢氏RT-PCR扩增35个循环时,可以检测质粒最低浓度为4.15个/μL拷贝数,最低模拟样品浓度为102 PFU/mL,与第1轮PCR相比,灵敏度均提高了10 000倍,同时检测9种不同病毒,仅LBBV出现明亮特异性条带,在304个样品中,第1轮PCR检出阳性样品14株,检出率为4.60%,巢式RT-PCR检出阳性样品28株,检出率为9.21%;本实验建立的巢式RT-PCR检测方法灵敏度高且特异性好,可用于LBBV的早期检测及防控。
关键词： 大口黑鲈 双RNA病毒 巢式RT-PCR 检测方法
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锦鲤microRNA-137系统进化、靶基因验证及表达分析
《水产学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：为了探究microRNA-137（miR-137）与锦鲤体色形成的关系,实验对已报道的14种鱼类miR-137前体序列（precursor miR-137, pre-miR-137）进行比对,利用最大似然估计法（Maximum Likelihood Estimate, MLE）构建系统进化树,同时荧光定量PCR （quantitative realtime PCR, qRT-PCR）分析其在体色发生阶段和不同组织中的相对表达水平,并预测其靶基因,随后对靶基因进行GO和KEGG分析,最后通过荧光素酶实验验证miR-137-3p与靶基因的靶向关系,并分析miR-137-3p与靶基因mRNA的表达变化。结果显示,锦鲤与鲤的pre-miR-137序列相似度最高,且pre-miR-137序列在所有鱼类中具有较高的保守性。对miR-137靶基因进行GO和KEGG分析,多个靶基因富集在色素沉积、色素细胞分化等信号通路。定量结果显示,锦鲤出膜后11 d（day post hatching, dph） miR-137-3p表达量达到最高,随后显著降低;miR-137-3p在锦鲤不同组织中均有表达,在眼和肌肉中表达量较高,在皮肤和鳍条等色素细胞存在的组织中也有较高表达,且白色组织表达量显著高于红色组织。荧光素酶实验结果显示,miR-137-3p可结合在mitfa 3′-UTR上并抑制其表达,但对sprb并无显著抑制作用;miR-137-3p与mitfa和sprb在不同发育阶段存在显著负相关,但在组织中不存在相关性。本研究发现,miR-137在鱼类进化过程中高度保守,与锦鲤体色形成具有一定的相关性,且可靶向调控mitfa参与体色的形成,以上结果为进一步探讨miR-137在锦鲤体色形成中的作用提供基础数据。
关键词： 锦鲤 miRNA-137 进化 表达 靶基因 体色
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大菱鲆体重和体尺性状联合GWAS分析
《渔业科学进展 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：为了揭示大菱鲆（Scophthalmus maximus）体重和体尺性状的分子遗传机制,探寻用于改良目标性状的分子标记及候选基因,本研究以大菱鲆育种群体为研究对象,分别测量其体重、体长、体宽和尾柄宽性状的表型值,利用简化基因组测序技术（2b-RAD）获得相应基因型数据,进行全基因组关联研究（Genome-wide association study, GWAS）,筛选与大菱鲆体重和体尺性状显著关联的数量性状核苷酸（Quantitative trait nucleotides, QTNs）遗传位点。结果显示,以多性状线性混合模型（mv LMM）对体重–体长和体长–体宽–尾柄宽2个性状组合进行多性状GWAS分析,分别检测到9个和2个一因多效QTNs;以单一性状线性混合模型（LMM）对各个性状进行GWAS分析,在体重性状中检测到4个与之显著关联的QTNs,在体长和体宽性状中各检测到1个QTN,而在尾柄宽性状中则没有检测到显著的遗传位点。比较2种模型的结果,发现mvLMM相较于LMM能够检测到更多QTNs,且检测到的QTNs为更具生物学意义的一因多效QTNs。本研究首次利用mvLMM和LMM对大菱鲆体重和体尺性状进行联合GWAS分析,共筛选到17个显著的QTNs,其中,有4个QTNs被重复检测到。以这些检测到的QTNs为探针,在大菱鲆全基因组上找到了距离其最近的12个候选基因,它们可能是影响大菱鲆体重和体尺性状的重要候选标记和功能基因,本研究为大菱鲆体重和体尺性状的分子标记辅助选育提供了理论素材和参考。
关键词： 大菱鲆 体重和体尺性状 全基因组关联分析 多性状线性混合模型
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腌制方式对卵形鲳鲹理化指标及其挥发性风味成分的影响
《水产学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：为了探究干腌、湿腌、超声波辅助腌制对卵形鲳鲹的理化特性及挥发性风味成分的影响,实验对腌制加工后鱼肉的基本营养成分、盐含量、pH、硫代巴比妥酸（TBA）值、脂肪酸组成及挥发性风味成分等指标进行测定分析。结果显示,在腌制加工后,卵形鲳鲹粗蛋白和粗脂肪含量升高、而水分含量下降,其中干腌、湿腌、超声波辅助腌制鱼肉中水分含量分别为53.71%±0.97%、61.45%±0.72%和59.29%±1.41%。与卵形鲳鲹原料相比,干腌、超声波辅助腌制、湿腌鱼肉中盐含量增加,依次为（3.29±0.15）、（2.64±0.02）和（2.15±0.11） g/100 g,而在腌制加工后鱼肉的pH值下降。在腌制加工后,卵形鲳鲹的脂质发生氧化反应,TBA值增加,干腌、湿腌、超声波辅助腌制鱼肉的TBA值分别为（0.80±0.07）、（0.55±0.09）和（0.73±0.08） mg MDA/kg,饱和脂肪酸和单不饱和脂肪酸含量增加,而多不饱和脂肪酸含量减少。冻藏保鲜、干腌、湿腌、超声波辅助腌制鱼肉中分别检测出54、56、62和57种挥发性风味物质,主要为醛类、醇类和酮类,对风味形成有重要贡献作用。研究表明,卵形鲳鲹经3种不同腌制方式加工后,干腌鱼肉水分含量最低,而盐含量和TBA值最高;超声波辅助腌制鱼肉的挥发性风味物质中醛类、醇类相对含量最高,而pH值最低。本研究可为腌制加工及生产工艺优化提供理论参考。
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基于卷积神经网络的微藻种类识别
《上海海洋大学学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：对微藻的光学图像进行采样,并结合国内外专家对微藻鉴定的经验知识,制作了微藻图像数据集,并进行数据增强处理。借助深度学习的原理和方法,构建基于卷积神经网络结构的深度学习模型（AlexNet）,对模型进行训练,并利用5折交叉验证方法确保模型的稳定性。结果表明,模型的训练精度为97.86%±1.63%,测试精度为85.86%±0.80%,达到了预期效果。利用AlexNet模型训练得到的参数,对预留的280个样本图像进行实际测试,7个藻种的平均精确度、平均召回率和调和平均数分别为83.3%,84.4%和83.3%,表明深度学习方法是鉴定微藻的一种有效方法。
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长牡蛎食物组成的高通量测序分析
《渔业科学进展 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：为了更加细致地甄别滤食性贝类的食物组成,于2019年8月,以北方规模化典型养殖海湾——桑沟湾养殖的长牡蛎(Crassostrea gigas)为研究对象,运用Illumina高通量测序技术对长牡蛎的胃含物及所处养殖水体中的真核生物进行分析研究.结果显示,扩增18S rDNA V4区平均得到111,359个有效序列短片段,在97%相似性水平上划分OTUs(operational taxonomic units),聚类后得到239个类别.其中,长牡蛎胃含物中的真核生物分属于34个门,绿藻门(Chlorophyta)、甲藻门(Pyrrophyta)、链形植物(Streptophyta)、硅藻门(Bacillariophyta)和原生动物(Protozoa)等为主要类群.所处养殖水体中的真核生物分属于37个门,绿藻门、脊索动物门(Chordata)、节肢动物门(Arthropoda)、甲藻门和硅藻门等为主要类群.结果表明,浮游植物是长牡蛎的主要食物来源,链型植物和原生动物也有一定的贡献,分别占总食物贡献量的10.43%和4.11%.研究结果为深入认识滤食性贝类的摄食生态学及其在养殖生态系统物质循环和能量流动中发挥的作用提供了数据支撑.
关键词： 胃含物;18S rDNA;高通量测序;长牡蛎;桑沟湾
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广东海洋渔业资源可捕量评估
《海洋渔业 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：为探明广东省海洋渔业资源现状及其对实现渔业可持续发展的重要意义,基于广东省1961—2018年海洋渔业统计产量数据,利用一种包含协变量的剩余产量模型(a surplus-production model incorporating covariates,ASPIC)和Catch-MSY模型对广东海洋渔业资源总可捕量、5个重要经济类群的最大可持续产量(maximum sustainable yield,MSY)以及可捕量进行了评估.结果显示,ASPIC与Catch-MSY模型的评估结果相近,广东海洋渔业资源MSY约为164×104 t,1996—2006年处于过度捕捞状态,当前产量低于MSY.Schaefer与Fox模型评估的MSY相差不大,且B/BMSY与F/FMSY的历史变化趋势较为一致,但是评估的渔业现状差异较大,Schaefer模型评估结果表明当前渔业状态较差(B/BMSY<1且F/FMSY>1),而Fox模型表明当前渔业状态良好(B/BMSY>1且F/FMSY<1).综合两个模型结果显示,带鱼类MSY为14.62×104~15.08×104 t,日本鲭(Scomber japonicus)MSY为3.82×104~6.78×104 t,鲳类MSY为5.77×104~6.21×104 t,鲷类MSY为4.16×104~4.54×104 t,蓝圆鲹(Decapterus maruadsi)MSY为17.68×104~19.84×104 t.5个经济类群中日本鲭和蓝圆鲹处于过度捕捞后的衰退状态,而带鱼类、鲳类和鲷类在近年来遭受过度捕捞.研究结果可为广东海洋渔业限额捕捞提供理论依据.
关键词： 广东;海洋渔业资源;ASPIC;Catch-MSY模型;可捕量;过度捕捞
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