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基于Smart-seq2探究玻璃化冷冻对猪孤雌激活囊胚基因表达的影响

畜牧兽医学报 2024 北大核心 CSCD

摘要:旨在探究玻璃化冷冻对猪孤雌激活(parthenogenetic activation, PA)囊胚基因表达的影响。本研究以猪PA囊胚为研究对象,根据试验处理分为新鲜组、玻璃化冷冻组Ⅰ和玻璃化冷冻组Ⅱ,随后从每组挑选3枚形态良好的囊胚,利用Smart-seq2单细胞全长转录组测序技术进行转录组测序分析。结果显示,玻璃化冷冻组Ⅰ与新鲜组相比,共鉴定到772个差异表达基因(differential expression genes, DEGs),GO和KEGG富集分析结果显示,这些DEGs与细胞脂质代谢过程、细胞葡萄糖稳态、MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路等相关;玻璃化冷冻组Ⅱ与新鲜组相比,共鉴定到1 613个DEGs,主要与糖异生、代谢途径、氨基酸生物合成等相关;玻璃化冷冻组Ⅱ与玻璃化冷冻组Ⅰ相比,鉴定到822个DEGs,主要与丙酮酸代谢过程、N-聚糖生物合成、细胞衰老等相关。综上,本研究基于Smart-seq2单细胞全长转录组测序技术揭示了玻璃化冷冻对猪PA囊胚脂质代谢、能量代谢、MAPK信号通路等相关基因表达的影响。

关键词: Smart-seq2 玻璃化冷冻 孤雌激活 囊胚

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菌株和栽培地对香菇子实体多糖含量及分子量分布特征的影响

食用菌学报 2024 北大核心 CSCD

摘要:采用苯酚-硫酸法测定栽培于河南省驻马店市的38个香菇(Lentinula edodes)菌株子实体多糖含量,并采用高效分子排阻色谱-多角度激光光散射-示差折光检测器联用法分析子实体多糖的分子量分布,依据出峰时间和出峰数量将样品进行分组,对每组图谱进行组内及组间相似度评价,并比较组内和组间样品多糖含量;随机选择4个菌株,分别栽培于河南省驻马店市和湖北省随州市,比较同一菌株不同栽培地所产香菇子实体的多糖含量和分子量分布特征。结果显示,不同菌株多糖含量为2.35%~7.82%,均值为4.98%,变异系数较大,达28.43%。依据出峰情况可将样品分为6组(A~F),其中P1为共有峰,出峰时间均在22.3~26.0 min,重均分子量为4.259×10~6~1.039×10~7 g·mol-1,各组的P2保留时间有较大差异,重均分子量均大于10~6 g·mol-1,P3只存在于D、E、F组,出峰时间均在30 min后,重均分子量为2.415×10~5~5.235×10~6 g·mol-1。组内样品相似度为0.915~0.997,组间除A组和B组相似度为0.847,其余组均小于0.7,且多糖含量与分子量分布图谱不存在相关性。同一菌株不同栽培地的香菇子实体多糖分子量分布中峰的数量和多糖含量均有差异。研究结果为提取香菇多糖选取优良子实体原料提供参考。

关键词: 不同菌株 香菇 多糖含量 分子量分布

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预印本平台ChinaXiv影响力实证研究与建议

编辑学报 2024 北大核心 CSSCI

摘要:以ChinaXiv 2016—2022年全部论文数据为分析对象,使用Python语言爬取ChinaXiv网站获取基础数据,利用WPS统计分析工具和文献计量方法,分析了平台发文量、点击量、下载量、发文机构分布、学科分布、版本更新分布、开放评议及出版流向。研究显示:ChinaXiv发文量呈非线性增长,论文点击量和下载量都比较高,被评议论文占比较低,且评论数较少;学科资源分布不均衡,合作期刊与平台的融合度低,期刊数量和占比呈动态变化,固定预出版的合作期刊数量相对较少,平台的服务能力有待提升。本文认为ChinaXiv已具有一定的影响力,但尚未达到成熟稳定的发展阶段,并提出相关建议:多措并举,提高平台发文量;奖惩机制,促进学术开放交流;深化改革,探索合作新模式。

关键词: 预印本 影响力 期刊出版 建议

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辣椒CaERF70的表达特征和转录自激活活性分析

浙江农业学报 2024 北大核心 CSCD

摘要:AP2/ERF转录因子家族广泛参与植物生长发育以及逆境应答等生物学过程,对于AP2/ERF转录因子的研究有助于提高作物抗逆性。该研究以辣椒耐盐品种SHA2022119为材料,克隆得到CaERF70,该基因cDNA全长为819 bp,编码272个氨基酸,分子量约为30.59 ku,等电点pI为7.67。生物信息学分析表明,该蛋白带负电荷,属于不稳定蛋白,存在34个潜在发生磷酸化修饰的位点,为非跨膜蛋白且在细胞核中表达。系统发育树结果显示,辣椒CaERF70与番茄、烟草、马铃薯的ERF聚为一类,暗示着CaERF70在茄科进化过程中非常保守。定量PCR结果显示,CaERF70基因受低温诱导、高温抑制表达。原核表达实验表明,CaERF70编码蛋白大小约为30 ku,与预测大小一致。转录激活活性分析表明,CaERF70具有转录激活活性。综合以上结果表明,CaERF70为AP2/ERF2转录因子,属于ERF亚组第Ⅶ亚组成员,具有转录激活活性,高温或者低温胁迫导致CaERF70表达发生显著变化,暗示着CaERF70可能在辣椒应对高温或低温胁迫过程中发挥作用。

关键词: 辣椒 基因克隆 转录活性 原核表达 非生物胁迫

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食用菌及其制品中过氧化麦角甾醇含量测定方法建立及应用

食用菌学报 2024 北大核心 CSCD

摘要:为建立食用菌及其制品中过氧化麦角甾醇(ergosterol peroxide,EP)含量的测定方法,采用超高效液相色谱-串联质谱(ultra-high-performance liquid chromatography-tandem mass spectrometry,UPLCMS/MS)法优化色谱、质谱条件,通过基质效应、加标回收率、检出限和重复性实验考察方法学,最后采用建立的方法测定31种食用菌及其制品中的EP含量。结果表明:采用C18色谱柱,流动相为0.1%甲酸甲醇∶0.1%甲酸水=92∶8(V∶V),采用乙腈为提取溶剂30℃超声提取30 min,定量离子选用m/z 429.0/191.0;E P在5~20 0 0n g·mL-1内线性关系良好,基质效应较弱;鲜品和腌制食用菌制品的EP检出限为0.0 2 0m g·kg-1,干制食用菌制品和即食食用菌制品的EP检出限为0.040mg·kg-1;加标回收率为78.4%~111.5%,符合GB 2763—2021中60%~120%的要求;日内变异系数和日间变异系数分别为0.3%~4.8%和0.4%~2.0%;在鲜品中香菇的EP含量较高。

关键词: 食用菌 过氧化麦角甾醇 超高效液相色谱-串联质谱 含量

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基于网络药理学探究桑黄多酚的体外抗肿瘤作用及其机制

生物技术通报 2024 北大核心 CSCD

摘要:[目的]分离、筛选瓦尼桑黄(Sanghuangporus vaninii)子实体中具有良好抗肿瘤活性的多酚组分,并对其抗肿瘤活性和潜在作用机制进行解析.[方法]采用超声辅助提取法提取乙酸乙酯部位的组分,通过对肝癌细胞HepG-2 的抑制活性筛选出具有良好抗肿瘤作用的多酚组分,基于超高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱(UPLC-Q-TOF-MS)技术鉴定其主要成分,利用网络药理学策略阐释其潜在抗肿瘤作用机制.[结果]分离制备获得了 5 种(SVa-SVe)多酚组分,其中SVe多酚组分表现出独特的抗肿瘤活性,100 μg/mL浓度下对HepG-2 细胞抑制率为 76.54%.SVe可以显著地促进HepG-2 细胞凋亡和诱导其细胞周期阻滞,并呈现剂量依赖性.成分分析显示,SVe主要由 31 种化合物组成,基于网络药理学分析表明,SVe中的osmundacetone、hispolon、phellibaumin A、davallialactone等关键化合物通过与多个靶点蛋白作用(STAT3、mTOR、VEGFA、SRC、ERBB2 和HSP90AA),发挥抗肿瘤活性.[结论]来源于桑黄的多酚提取物SVe通过诱导细胞凋亡和细胞周期阻滞对HepG-2 细胞具有独特的抑制活性,其中的多酚化合物通过多靶点发挥作用.

关键词: 瓦尼桑黄 多酚 肝癌 网络药理学

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食用菌杂交育种中的技术策略(上)

食用菌学报 2024 北大核心 CSCD

摘要:杂交育种是食用菌育种的重要方法,但是杂交育种实践存在诸多不确定性。笔者倡导建立食用菌理性杂交育种体系,并分析实现该体系的9个技术策略,包括育种目标、杂交理念、骨干亲本、杂交路径、杂交体量、杂交代际、品种系谱、品种系列以及种质资源。明确的育种目标是食用菌育种实践的第一要素,准确理解和正确运用杂交育种理念是培育新品种的关键;骨干亲本是杂交育种的核心材料,是理性杂交育种的关键物质要素;合适的杂交体量和合理的杂交组合能够提升获得优良杂交子的概率;杂交代际的合理设计和杂交路径的准确判断体现出育种者对育种目标及育种材料的深刻理解与精准掌控,有助于通过基因重组等路径强化优良农艺性状,有助于减少杂交子遗传不稳定性;品种系谱的传承有序既是大量育种实践的结果,更是理性杂交育种的基石;丰富多样的品种系列是食用菌杂交育种成果的直观体现,也是适应多样栽培环境和满足广泛市场需求的必然产物;丰富多样的种质资源是杂交育种实践的重要物质载体,要重视对其遗传多样性的挖掘。建立理性的食用菌杂交育种体系,不仅能够增强育种实践的确定性,提高育种成果的预见性,还可为评判育种实践的成效、成功、成果提供至关重要的参考依据。

关键词: 杂交育种 育种目标 品种系谱 骨干亲本 杂交代际

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高效液相色谱法测定混合型饲料添加剂中丙酸及丙酸盐含量

粮食与饲料工业 2024 北大核心

摘要:建立了液相色谱仪测定混合型饲料添加剂中丙酸及丙酸盐(以丙酸计)的方法。混合型饲料添加剂经去离子水超声提取10 min,过0.45μm滤膜后经C18液相色谱柱分离,紫外可见检测器在210 nm处定量检测。该方法解决了提取时间、提取溶剂、流动相pH值等关键技术。用该方法测定混合型饲料添加剂时,丙酸的定量限(LOQ)为0.1%。丙酸在混合型饲料添加剂中的含量为0.1%~20.0%时,丙酸的峰面积与质量浓度呈良好的线性关系(R2≥0.999 9),方法回收率为98.7%~102%,相对标准偏差为0.2%~1.2%。该方法操作简单,测定结果准确,可用于混合型饲料添加剂中丙酸及丙酸盐(以丙酸计)测定。

关键词: 高效液相色谱 混合型饲料添加剂 丙酸 丙酸盐

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6个紫花苜蓿品种氨基酸和维生素营养价值比较研究

上海农业学报 2024 北大核心 CSCD

摘要:以‘巨能7’‘SK3010’‘金皇后’‘WL358HQ’‘WL525HQ’‘WL319HQ’6个紫花苜蓿品种为试验材料,通过测定苜蓿叶片的粗蛋白、氨基酸、B族维生素含量,分析必需氨基酸比值(RAA)、氨基酸比值系数(RC)、氨基酸比值系数分(SRC),对紫花苜蓿营养价值进行评价。结果表明:‘WL358HQ’的粗蛋白含量最高,且与其他5个品种存在显著差异;6个品种苜蓿中均含有被测的17种氨基酸,‘金皇后’的必需氨基酸含量最高,各品种药效氨基酸均占总氨基酸含量的60%以上;紫花苜蓿SRC值在57—61,且‘金皇后’SRC值最高;‘金皇后’维生素(FA∕VB9、DHF、5-FTHF、5,10-CHTHF、VB6)含量最高;6个品种紫花苜蓿均符合优质蛋白质的标准且具有很强的药用价值,‘金皇后’苜蓿营养价值最高。本研究可为上海地区紫花苜蓿的引种和资源利用提供科学依据。

关键词: 紫花苜蓿 FAO∕WHO理想蛋白质标准 B族维生素

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暗褐网柄牛肝菌子实体不同生长阶段中小分子碳水化合物变化规律的研究

菌物学报 2024 北大核心 CSCD

摘要:目前关于暗褐网柄牛肝菌营养生理方面的研究较少,未见暗褐网柄牛肝菌子实体不同生长阶段中小分子碳水化合物变化规律相关报道。本研究对暗褐网柄牛肝菌子实体不同生长阶段的子实体中小分子碳水化合物含量变化进行了测定分析。结果显示海藻糖和甘露醇在暗褐网柄牛肝菌子实体中含量较高,生长过程中变化幅度大,其中豌豆期到采收期海藻糖含量增加13.72倍。结果揭示海藻糖和甘露醇在暗褐网柄牛肝菌碳源物质的转运中起到主要作用。在栽培基质添加海藻糖和甘露醇能够起到增产效果,其中海藻糖增产幅度达4.15%。本研究结果对进一步揭示暗褐网柄牛肝菌营养生理规律及改进栽培基质配方具有参考价值。

关键词: 暗褐网柄牛肝菌 海藻糖 甘露醇 栽培 增产

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