科研产出
18个双孢蘑菇核心种质的重测序初步分析
《福建农业学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要:【目的】通过对双孢蘑菇不同类型核心种质的基因组重测序分析,探讨双孢蘑菇不同类型菌株间基因组存在的差异及开发相关分子标记。【方法】对双孢蘑菇国内外杂交菌株、野生菌株、高产型或优质型传统菌株、棕色菌株、不育菌株等共18株核心种质进行基因组重测序,应用不同的生物信息学处理软件,对测序得到的原始reads序列与双孢蘑菇参考基因组H97序列进行比对,同时基于比对结果进行SNP、SV检测,通过检测结果对多态性标记分布进行统计并实现DNA水平差异基因挖掘和差异基因功能注释等。【结果】样品测序共获得21.63 G数据量,Q30平均达到89.10%。样品的reads与参考基因组H97的比对效率平均为82.50%,基因组覆盖度为96.32%,平均深度分别在33X左右。基于测序数据与参考基因组的比对结果,共检测获得约813 768个SNP,53 840个InDel,平均每个个体获得924个SV变异。【结论】国内外菌株的亲缘关系表明As2796系列与U1系列是世界上并列的两大双孢蘑菇杂交品系。


福建省高海拔山区越夏露地番茄栽培技术
《东南园艺 》 2019
摘要:福建省的高山地区地处福建西北部,夏季凉爽,雨量充沛,为越夏栽培番茄提供了良好的环境。笔者根据多年的栽培经验及走访了福建高山地区夏季番茄栽培区,总结了品种选择、育苗、栽培模式及病虫害防治等方面适合福建高山地区越夏露地番茄茄栽培技术,为福建地区番茄种植户和企业提供借鉴意义。


甘薯薯瘟病菌特异性PCR快速检测方法
《江苏师范大学学报(自然科学版) 》 2019
摘要:针对目前甘薯薯瘟病鉴定耗时长,且缺乏特异性标记的问题,首先根据薯瘟病菌Ralstonia solanacearum特异性基因orf428设计了一对特异性分子检测引物,对13株薯瘟病菌、3株甘薯其他病原细菌和12株其他7种寄主青枯菌进行PCR检测,结果显示,只有薯瘟病菌能特异扩增1 641 bp的目标序列,且对菌体DNA最低检出率达到1 pg/μL.其次,通过水煮法快速提取DNA,简化了DNA提取方法;在PCR体系中加入体积分数为1%的二甲基亚砜(DMSO)后,扩增条带更为明亮,优化了PCR检测体系.此技术易于操作、灵敏度高、特异性强,可用于对病残体、发病植株和种苗中的薯瘟病菌检测,以对甘薯薯瘟病进行预测、监测及防治具有重要意义.


蝴蝶兰主要数量性状DUS测试性能研究
《东南园艺 》 2019
摘要:探讨蝴蝶兰数量性状的测试性能,有利于提高测试准确性和测试效率。本研究通过种内稳定性、种间差异性、R型聚类分析以及性状相关性分析,对蝴蝶兰20个主要数量性状的测试性能进行分析。结果表明,蝴蝶兰不同数量性状的种内变异系数在5.07%~22.50%之间,Char4 (花序长度)、Char5 (花序花数量)、Char6 (花序梗长度)等3个性状在种内表现不够稳定。不同数量性状的种间变异系数在8.22%~45.31%之间,Char3 (叶片宽度)、Char7 (花序梗粗度)、Char14 (唇瓣中裂片长度)、Char17 (叶片厚度)、Char18 (合蕊柱长度)、Char19 (合蕊柱粗度)等6个性状的种间区分能力较弱;通过性状的R型聚类分析和相关性分析表明,Char8 (花朵长度)、Char9 (花朵宽度)、Char10 (萼片长度)、Char11 (萼片宽度)、Char12 (花瓣长度)与Char13 (花瓣宽度)均呈极显著相关性,且相关系数均大于0.9。因此,Char17 (叶片厚度)、Char18 (合蕊柱长度)、Char19 (合蕊柱粗度)在蝴蝶兰测试指南中作为选测性状是合理的。Char3 (叶片宽度)、Char7 (花序梗粗度)、Char14(唇瓣中裂片长度)、Char11 (萼片宽度)、Char13 (花瓣宽度)等5个性状可由必测性状调整为选测性状。Char4 (花序长度)、Char5 (花序花数量)、Char6 (花序梗长度)等性状的种内稳定性可能与催花条件有关。


粮食物流助力主销区粮食供需平衡——以福建省为例
《台湾农业探索 》 2019
摘要:【目的/意义】粮食供需平衡是确保粮食安全的基本前提,主销区粮食供给和需求之间的平衡需要靠物流来助力和实现。通过该研究为主销区粮食供需平衡提供物流方面的助力措施。【方法/过程】通过分析粮食物流进行价值创造的时间、空间和增值效应,阐述主销区粮食物流的生产、调入和储备职能,即保障基本供给、实现跨域转移和满足持续消费,以福建省为例剖析了主销区粮食在生产布局、运输过程和储备制度等方面的物流现状。【结果/结论】研究表明,主销区粮食物流存在着生产形势不乐观、运输网络欠顺畅、储备压力不轻松等问题,对此提出了生产上要发掘潜力和稳产增效、运输上要开辟通道和优化网络、储备上要完善设施和有效管控等物流助力措施,以确保主销区粮食供需平衡。


丝状支原体山羊亚种特异性蛋白基因Mmc-3740的克隆表达和免疫原性分析
《福建农业学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要:【目的】构建表达丝状支原体山羊亚种特异性蛋白基因Mmc-3740的重组表达菌,为Mmc-3740蛋白的进一步研究与应用奠定基础。【方法】采用PCR技术从Mmc-47中扩增出该基因,进行克隆、测序,将克隆质粒与pET-28a分别双酶切,回收正确的片段进行连接构建重组表达质粒,转化至表达菌BL21(DE3)中,IPTG诱导表达,产物用SDS-PAGE检测,用镍柱对其纯化后免疫小鼠获得高免血清,并进行Western-blot验证。【结果】成功构建了克隆和表达载体,重组菌表达目的蛋白大小约21 ku。表达产物通过镍柱纯化后可得到单一的目的蛋白条带,Western-blot检测结果显示所表达的目的蛋白有较好的免疫原性。【结论】成功在BL21(DE3)宿主菌内表达了Mmc-3740重组蛋白。


基于转录组测序的铁皮石斛黄酮代谢途径及相关基因解析
《福建农业学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要:【目的】分析铁皮石斛Dendrobium officinale黄酮类化合物的生物合成途径及相关基因,为铁皮石斛黄酮类化合物代谢调控、药用价值的开发研究提供参考。【方法】利用Illumina HiSeq 4000测序平台对铁皮石斛2个生长阶段茎、叶进行高通量转录组测序,对组装获得的unigenes进行功能注释和黄酮类化合物的生物合成相关基因解析。【结果】铁皮石斛黄酮类化合物代谢相关Unigenes 48个,涉及14个酶。5个CHS相关Unigenes具有CHSlike保守结构域,活性位点氨基酸残基(Cys-His-Asn)高度保守,丙二酰辅酶A结合位点和产物结合位点的部分氨基酸残基发生变异。CHI(Unigene0013781)属于类型I查尔酮异构酶,异构化6′-羟基查尔酮为5-羟基黄烷酮。表达分析表明,2个生长时期的茎和叶,CHS(Unigene0008250)、 CHI(Unigene0013781)和F3H的表达量都高于CHS(Unigene0012884)和C3′H。【结论】通过对转录组数据分析,共获得铁皮石斛黄酮类化合物代谢相关Unigenes48个,涉及14个酶;5个CHS相关Unigenes中,2个编码查尔酮合酶,3个编码联苄合酶;CHI(Unigene0013781)属于类型I查尔酮异构酶。

