科研产出
优质黄果百香果新品种雅蜜的选育
《果树学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要:雅蜜是从黄金百香果自交后代中选育的优质鲜食百香果新品种。该品种果实近圆形,果大,平均单果质量95.79 g;成熟时果皮黄色,表面有星状白色果点;果肉黄色至橙黄色,多汁,风味酸甜,香气浓郁,不易脱囊,可食率50.87%。可溶性固形物含量(w,后同)18.50%,总糖含量12.7 g·100 g-1,总酸含量16.97 g·kg-1,维生素C含量14.1 mg·100 g-1,氨基酸总量18.0 g·kg-1。该品种果实生长期60~100 d,在福建种植区果实收获时间集中在7月中下旬至9月上旬和10月上旬至11月中下旬;植株生长势强,易成花,自交亲和,每666.7 m2平均产量1 240.0 kg,丰产稳产。较抗炭疽病和病毒病,较耐高温。适应范围广,适宜于在福建、广西、云南等黄果百香果产区种植。
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茄子组蛋白基因家族全基因组鉴定及其低温胁迫下的表达分析
《农业生物技术学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要:组蛋白(Histone)是染色质的重要组成部分,在植物生长发育、响应逆境胁迫等方面发挥重要作用.为了探究Histone在低温响应中的特性,本研究通过生物信息学方法对茄子(Solanum melongena)Histone基因家族成员进行全基因组鉴定和分析,并挖掘其转录组数据,分析了2个不同抗性茄子(品系epl008与eplck)叶片在低温胁迫下Histones的表达模式.结果表明,茄子基因组中共鉴定出40个SmHistones基因,分布在9条染色体上,SmHistone基因家族成员被分成5个亚组(H1,H2A,H2B,H3和H4),同一组中的成员具有相似的理化特性、基因/蛋白质结构和保守基序.种内共线性分析发现,6对SmHistones基因存在共线性关系.启动子分析发现,SmHistone家族基因启动子含有大量低温响应元件、干旱响应元件等非生物胁迫响应元件.转录组和qRT-PCR分析发现,低温胁迫下26个Smhistones基因呈现差异表达,耐低温茄子品系epl008显著上调表达.茄子epl008中SmHistone3对低温胁迫响应诱导表达显著,揭示其可能与抗寒代谢响应密切相关.本研究为培育耐低温的茄子品种奠定了理论基础.
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黄精转录组SSR分子标记开发及种质遗传多样性分析
《中国农学通报 》 2024 CSCD
摘要:为丰富可用于黄精属鉴定的SSR分子标记,开发可用于黄精属(Polygonatum sp.)种质资源鉴定与遗传多样性分析的简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)分子标记,为药材黄精正品和伪品的鉴定及遗传多样性分析提供基础.通过对3种黄精属植物进行转录组测序,从60836967个Unigenes鉴定出19630个包含1~6个碱基重复类型的SSR位点,设计和筛选获得了 9对SSR有效性引物,并对来源于5个省份共计31份种质资源进行鉴定与遗传多样性分析.9对SSR引物不仅能够将长梗黄精与其他3种药材黄精划分开,还能够较好地区分不同基源黄精(滇黄精、黄精、多花黄精),并且31份资源遗传相似系数范围为0.0769~0.75.此外,构建了 31份黄精属种质资源的DNA指纹图谱数据库,开发了相对应的指纹图谱.本研究结果为黄精属种质资源的分类鉴定、遗传多样性分析和品种选育提供了可用的分子标记以及参考依据.
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大球盖菇液体菌种繁育工艺研究
《福建农业学报 》 2024 CSCD
摘要:【目的】优化大球盖菇液体菌种培养基,探究液体培养过程中的生长规律,确立液体菌种繁育栽培种工艺参数。【方法】以大球盖菇8号为试验菌株,以菌丝体生物量为评价指标,采用单因素和正交试验L9(34)优化液体菌种培养基。测定液体菌种菌丝体生物量,还原糖和氨基氮含量,羧甲基纤维素酶、淀粉酶、酸性蛋白酶、漆酶胞外酶酶活生理生化指标,确立优化配方的液体菌种最优培养时间。以平均满袋时间为指标,确立液体菌种扩繁栽培种接种量、培养基配方颗粒度和碳氮比。【结果】优化得到大球盖菇液体菌种最优配方为葡萄糖20 g·L-1、小麦粉30 g·L-1、酵母粉0.75 g·L-1、磷酸二氢钾1.00 g·L-1、硫酸镁0.50 g·L-1、起始p H 5。培养第8天时,大球盖菇菌丝体生物量最大,为1.66 g·hm L-1;液体培养过程中还原糖含量由12.23 mg·m L-1降至1.38 mg·m L-1,氨基氮含量由0.09mg·m L-1降至0.06 mg·m L-1;羧甲基纤维素酶和淀粉酶酶活在第4天最高,酶活分别为6.49、5.16 U,酸性蛋白酶酶活在第2天最高,酶活为1.80 U,漆酶酶活在第6天最大,酶活为1.63 U。液体菌种扩繁栽培种生产工艺参数:接种量为15 m L,菌包培养基配方颗粒度的粗细木屑比为7∶3,碳氮比为50∶1。【结论】大球盖菇液体菌种活性与上述指标具有一定的相关性,结合发酵液生理生化指标,判定第7天的液体菌种活力最高。利用大球盖菇液体菌种扩繁栽培种,平均满袋时间为23.7 d,缩短生长周期2.7 d。本研究建立配套的制种工艺,为大球盖菇栽培种工厂化生产技术奠定基础。
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猪流行性腹泻病毒荧光RT-RAA检测方法的建立及初步应用
《福建农业学报 》 2024 CSCD
摘要:【目的】建立一种快捷、灵敏、简便检测猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)的RT-RAA检测方法,以提高猪流行性腹泻病毒临床检测效率。【方法】针对PEDV S基因片段保守区设计引物和探针,构建标准质粒PEDV-S,通过特异性、敏感性、重复性测定及条件优化,建立检测PEDV重组酶介导链置换核酸扩增荧光法(RT-RAA)。【结果】在42℃恒温作用20 min的条件下,建立的检测方法对检测猪传染性胃肠炎病毒(porcine transmissible gastroenteritis virus,TGEV)、猪瘟病毒(classical swine fever virus,CSFV)、伪狂犬病病毒(porcine pseudorabies virus,PRV)、猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)和猪轮状病毒(porcine rotavirus,PoRV)等猪源病毒均为阴性,猪流行性腹泻病毒(PEDV)为阳性;最低检出限为4.43×10~2拷贝·μL-1的标准质粒;重复性结果显示,相同浓度标准质粒的差异性很小;利用建立的RT-RAA方法检测40份猪病毒样本,阳性率为7.5%(3/40),与实时荧光定量PCR检测结果相同。【结论】本研究建立的PEDV RT-RAA检测方法具有快速简便、耗时短、特异性高、灵敏度强和重复性好等特点,适用于对PEDV的快速诊断。
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低甲烷排放转基因水稻对土壤微生物群落的影响
《生态学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要:低甲烷排放转基因水稻是实现水稻低碳生产的理想材料.土壤微生物驱动了稻田甲烷的产生,低甲烷排放转基因水稻土壤微生物群落组成的变化不仅影响稻田甲烷排放,也关系到土壤微生态系统的稳定性.通过对细菌16S rRNA基因、真菌ITS基因的高通量测序及mcrA、nifH、amoA和nirS等功能基因的荧光定量PCR,分析了低甲烷排放转基因水稻(86R27-3)与野生型水稻(MH86)土壤微生物群落间的差异.结果显示:稻田土壤细菌群落的α-多样性指数在86R27-3与MH86间无明显差异,且仅在水稻分蘖期86R27-3的土壤真菌群落多样性指数Shannon、Simpson及均匀度指数Pielou_e显著高于MH86(P<0.05);β-多样性分析表明土壤细菌或真菌群落组成在86R27-3与MH86间均没有显著差异;但在水稻齐穗期:86R27-3 土壤的放线菌门(Actinobacteria)、罗泽真菌门(Rozellomycota)的相对丰度显著高于MH86(P<0.05),而酸杆菌门(Acidibacteria)、子囊菌门(Ascomycota)的相对丰度显著低于MH86(P<0.05);土壤微生物群落功能预测显示,86R27-3 土壤氮、硫和锰代谢细菌功能群丰度显著低于MH86(P<0.05),如分蘖期的土壤硝酸盐还原、硝酸盐呼吸、硫代硫酸盐呼吸及硫呼吸,齐穗期和成熟期的好氧亚硝酸盐氧化及成熟期的锰氧化等;与MH86相比,86R27-3的土壤真菌功能群丰度有减有增,如在水稻不同生育期内的其未定义腐生物银耳目、嗜热囊菌科、镰刀菌属及韦斯特氏菌功能群丰度显著降低(P<0.05),而其分蘖期的动物内共生体腐生生物毕赤酵母属和未定义腐生物马勃科功能群丰度显著提高(P<0.05).定量PCR分析表明86R27-3 土壤中的产甲烷细菌mcrA基因丰度显著低于MH86(P<0.05),同时,土壤固氮菌nifH基因、氨氧化细菌amoA基因及反硝化细菌nirS基因的丰度在86R27-3土壤中也显著降低(P<0.05).综上所述,低甲烷排放转基因水稻(86R27-3)对土壤细菌或真菌的群落组成没有影响,但可引起主要细菌或真菌种类的相对丰度及某些细菌或真菌功能群丰度发生变化,并显著降低了稻田土壤微生物功能基因丰度.
关键词: 低甲烷排放转基因水稻 微生物群落 功能基因 高通量测序
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小菜蛾UDP-N-乙酰氨基葡萄糖焦磷酸化酶基因的克隆、表达及功能研究
《生物安全学报(中英文) 》 2024 CSCD
摘要:【目的】克隆小菜蛾几丁质合成酶基因Px UAP并阐明其功能。【方法】基于小菜蛾基因组信息,利用RT-PCR克隆小菜蛾Px UAP基因的c DNA序列,并应用荧光定量PCR和RNA干扰技术分析该基因的表达模式及功能。【结果】Px UAP (Gen Bank登录号:OR659549)开放阅读框长度为1467 bp,预测编码488个氨基酸,蛋白分子质量为54.985 ku,理论等电点为6.12;与金凤蝶UAP (KPJ20218.1)同源蛋白亲缘关系较近,氨基酸同源性为80.33%。发育表达谱结果表明,Px UAP在小菜蛾各个发育阶段均有表达,在雄成虫期的表达量最高;组织表达谱结果表明,Px UAP在雌成虫足和翅膀的表达量最高。RNAi结果表明,与注射ds GFP对照组相比,注射ds Px UAP显著降低了靶标基因和几丁质合成酶Px CHSA基因的表达量,且Px CHSB基因在24和48 h的表达量也显著下降;注射ds Px UAP的小菜蛾大部分无法化蛹,蛹壳出现皱缩等畸形现象,并在注射后168 h全部死亡。【结论】Px UAP是小菜蛾几丁质合成酶通路中的关键调控基因,对小菜蛾生长发育起至关重要的作用。
关键词: 小菜蛾 RNA干扰 几丁质 UDP-N-乙酰氨基葡萄糖焦磷酸化酶 表达谱
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红曲糟抗热肽的制备及其对酿酒酵母热激氧化耐受性的影响
《食品科学 》 2024 EI 北大核心 CSCD
摘要:制备红曲糟抗热肽,研究其对酿酒酵母抵御热激氧化行为的影响.以酿酒酵母热激存活率为指标,筛选蛋白酶,通过抗热肽得率优化酶解条件,对抗热肽进行质谱和抗氧化能力分析,通过磷酸戊糖通路基因表达、胞内辅酶、谷胱甘肽(glutathione,GSH)以及活性氧自由基(reactive oxygen species,ROS)含量分析,从抗氧化角度探索抗热肽对酿酒酵母的热保护作用.结果表明,红曲糟抗热肽最佳酶解工艺为:红曲糟蛋白和水固液比1∶10(m/m)、复合蛋白酶酶解、温度50 ℃、时间3h、加酶量3 000 U/g、pH 8.5,该条件下抗热肽得率62.44%,酿酒酵母热激存活率73.97%,较纯水组提高了22.76%.序列鉴定表明,丰度前20的肽段中16条肽段的疏水氨基酸占比50%以上.抗热肽1,1-二苯基-2-三硝基苯肼自由基半数清除量为4.53 mg/mL,2,2'-联氮双(3-乙基苯并噻唑啉-6-磺酸)阳离子自由基半数清除量为1.82 mg/mL,具有抗氧化活性.同时,抗热肽通过上调磷酸戊糖途径的基因表达量,提升NADH激酶活性,促进还原型辅酶Ⅱ的转化,使GSH含量提高4.74倍,胞内ROS水平与热激前酿酒酵母基本保持一致,从而有效提高了酿酒酵母抵御热激氧化胁迫的能力.
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双孢蘑菇As2796菌株气生与贴生菌丝遗传差异的转录组分析
《福建农业学报 》 2024 CSCD
摘要:【目的】挖掘双孢蘑菌落形态变化可能涉及的重要基因,为双孢蘑菇种质资源评价、新品种选育提供科学依据。【方法】以双孢蘑菇主栽品种As2796为试验菌株,收集同一平板上生长的贴生与气生菌丝,提取样品的RNA进行转录组测序分析。【结果】通过转录组分析,A601(As2796气生组)与A602(As2796贴生组)共鉴定出965个差异表达基因(DEGs)。GO富集分析结果表明,在真菌细胞壁组成方面有疏水蛋白相关的DEGs富集,其中AGABI2DRAFT_13655、AGABI2DRAFT_136569、AGABI2DRAFT_193057属于ABH3蛋白基因家族,在气生菌丝的表达水平显著高于贴生菌丝,可能与气生菌丝的产生有关。研究还发现了疏水表面结合蛋白A(HsbA)相关基因AGABI2DRAFT_194662在气生菌丝中FPKM表达水平为0,在贴生菌丝中为10.24。通过对DEGs进一步分析,富集到8个可能与脂酶同工酶相关的DEGs,气生菌丝中这些基因的表达水平显著高于贴生菌丝。SNP/InDel分析结果表明,As2796气生组SNP数为110 601,贴生组SNP数为111 188,单核苷酸变异中,C:G>T:A的变异次数较多,共筛选出2 374个共同InDel。【结论】成功获得双孢蘑菇不同形态菌丝的转录组数据,并从中挖掘出潜在的相关基因和SNP位点,为双孢蘑菇相关分子标记开发及辅助育种提供参考。
关键词: 双孢蘑菇 As2796 贴生菌丝 气生菌丝 转录组测序 差异表达基因
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福建丘陵山区县域农业生产力评价及空间特征分析-基于熵权TOPSIS模型的实证研究
《中国农业大学学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要:为科学测度县域农业生产力发展水平,优化农业产业结构布局。以福建省74个丘陵山区县为例,基于农业生产功能和农业价值功能视角,构建了包含28个指标的县域农业生产力综合评价指标体系。指标体系包括生产资源与条件、生产水平与能力、农业结构、产值和市场竞争力等5个方面。首先运用熵权法确定各指标的综合权重、功能指标权重和特征指标权重,然后利用TOPSIS方法对74个县域的农业综合生产力水平、生产功能指标水平和特征指标水平进行评价,并在评价的基础上应用ARCGIS分析县域空间分布特征。结果表明:1)28个指标权重中,8个指标的权重<0.01,18个指标的权重0.01~0.1,2个指标的权重>0.1,总体权重贡献相对比较合理;在熵值方面,大部分的熵值都比较高,26个指标的熵值超过0.9以上,这说明指标信息量比较小,不确定性相对较大。2)在农业综合生产力水平测度方面,优势县域数量闽南>闽东北>闽西北,表明生产能力等因素在生产力发展中的作用不断提升。3)在功能指标水平测度方面,农业生产功能比较优势县域数量闽南板块和闽西北板块要比闽东北板块多,表明资源禀赋方面西北部分要比东南部分具有优势,但闽南在生产能力方面具有优势;农业价值功能比较优势县域数量闽东北板块最多,闽南板块最少,表明闽西北的产品数量要比闽南和闽东北多。因此,发挥资源优势、打造特色品牌、加强科技投入、完善产业发展政策和加大财政扶持等要素是优化生产力布局的重要措施。
关键词: 农业生产力 熵权TOPSIS模型 丘陵山区 县域 空间优化
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