科研产出
外源生长素影响百合地下茎生鳞茎发生的转录组分析
《南方农业学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：【目的】揭示激素调控百合地下茎生鳞茎发生发育的分子机理，为深入开展生长素相关基因调节百合地下茎生鳞茎发生分子机制研究提供参考依据。【方法】通过0.2和2.0 mmol/L浓度的外源生长素吲哚乙酸（IAA）对百合地下茎部进行处理，以清水处理作为对照（CK），对收获的地下茎生鳞茎的数量和重量进行测定，结合转录组测序分析，揭示不同浓度生长素处理下各激素相关基因的时空表达模式，并利用实时荧光定量PCR对百合侧生器官发生关键基因进行表达水平检测。【结果】2.0 mmol/L浓度IAA处理后的百合植株，在茎生鳞茎总数量、单株茎生鳞茎数量和茎生鳞茎平均克重均低于0.2 mmol/L处理和CK。KEEG富集结果指向植物激素信号转导通路，差异表达基因（DEGs）数字表达谱显示，几乎所有与植物激素相关的基因均受影响，包括生长素、乙烯、脱落酸、油菜素内酯、茉莉酸甲酯、细胞分裂素和赤霉素，其中茉莉酸甲酯相关的DEGs最多，其次为生长素。实时荧光定量PCR检测表明，2.0 mmol/L处理中WOX9、WOX11、KNOX2、CYCD3和CYCD5基因表达水平均显著低于CK（P＜0.05）。【结论】高浓度生长素IAA可有效迟滞百合地下茎生鳞茎的形成和发育。外源生长素处理不仅影响多种植物激素的合成代谢、运输和信号转导，也抑制百合侧生器官发生关键基因的表达，从而影响地下茎生鳞茎的形成和发育。
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黑木耳水提物和粗多糖溶液的流变特性及饮料开发
《福建农业学报 》 2023 CSCD
摘要：【目的】研究黑木耳水提物（Auricularia auricula water extract, AWE）和黑木耳粗多糖（Auricularia auricula crude polysaccharide, ACP）溶液的流变特性，优化饮料配方，为黑木耳饮料的开发提供科技支撑。【方法】观察不同质量浓度和均质压力下AWE和ACP溶液的流变特性；采用单因素和正交试验优化黑木耳饮料配方。【结果】0.3%～1.5%的AWE与ACP溶液都具有明显的剪切稀化特征，表现为假塑性流体，且为非牛顿流体；随着AWE与ACP质量浓度的降低，其流动行为指数增加，稠度系数降低（P ＜0.05）,0.3%～0.6%AWE溶液和0.3%ACP溶液呈现稳定的流体特性。4～12 MPa均质处理显著提高0.6%AWE和ACP溶液的流动行为指数，同时降低稠度系数，均呈现稳定的流体特性；相同均质压力下0.6%AWE比ACP溶液的黏度更低、流动性更佳。8 MPa均质压力处理的0.6%AWE溶液的平均粒径（6.51±0.02）μm和稳定系数（0.926±0.024）达到平衡。单因素和正交试验优化黑木耳饮料配方为：AWE0.6%、冰糖6%以及柠檬酸0.1%；饮料呈浅褐色，具黑木耳特有风味，口感细腻丝滑。【结论】0.3%～1.5%AWE和ACP溶液均为假塑性流体，且为非牛顿流体；4～12 MPa均质提高了0.6%的AWE和ACP溶液流动性，8MPa均质处理0.6%AWE溶液体系的稳定性最佳，从而确定黑木耳饮料加工以0.6%AWE为生产原料，采用8 MPa作为均质压力。黑木耳饮料最佳配方为：AWE 0.6%、冰糖6%以及柠檬酸0.1%。
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基于UPLC-MS/MS和GC-IMS技术分析采前套袋与未套袋油?果实品质差异
《食品科学 》 2023 EI 北大核心 CSCD
摘要：采用超高效液相色谱-串联质谱（ultra-high performance liquid chromatography-tandem mass spectrometry,UPLC-MS/MS）和气相-离子迁移谱（gas chromatography-ion mobility spectrometry,GC-IMS）技术结合多元统计分析方法，分析采前套袋对油?果实代谢产物、代谢途径以及挥发性成分的影响。结果表明，采前套袋后油?果皮和果肉着黄色。基于UPLC-MS/MS技术鉴定到604个油?果实代谢物，采前套袋改变果实代谢特征和代谢途径，筛选出显著差异代谢物58个，上调物质22个，下调物质36个；其中，与滋味相关的糖类和有机酸等物质含量差异不显著，而与滋味相关的氨基酸部分差异显著。基于GC-IMS技术鉴定到油?果实含有醛类14种、酯类5种、醇类4种、酮类3种和其他1种共27个挥发性物质，多数酯类物质在未套袋果实中含量较高，多数醇类物质在套袋果实中含量较高。采前套袋与未套袋油?果实挥发性成分具有不同的指纹图谱。基于中药数据库和已鉴定代谢物查询到199个活性成分，根据筛选标准得到37个关键活性成分，其中，采前套袋果实的槲皮素含量下调。由此说明，采前套袋可提高油?果实外观品质，对果实滋味、香气和功效成分等部分有影响。
关键词： 油? 套袋 超高效液相色谱-串联质谱技术 气相-离子迁移谱技术 品质
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灌溉水源中沙门氏菌的SYBR Green I实时荧光定量PCR检测方法的建立
《福建农业学报 》 2023 CSCD
摘要：【目的】建立基于SYBR Green I嵌合染料法的灌溉水源中沙门氏菌实时荧光定量PCR（Quantitative Real-time PCR, q PCR）检测方法。【方法】以沙门氏菌侵袭蛋白A （inv A）基因为靶基因，设计1对特异性q PCR检测引物，在对q PCR反应体系和反应条件进行优化后，通过特异性实验和灵敏度实验对q PCR方法进行验证，并制作灌溉水源中沙门氏菌q PCR定量标准曲线，最后与国标方法对比检测灌溉水源中沙门氏菌污染来验证该方法的准确性。【结果】经过优化的q PCR检测方法灵敏度检测结果显示最低检测限量为1×10-1 pg·μL-1，特异性检测结果显示具有良好的特异性，干扰菌株对本q PCR检测方法无影响，所制作的q PCR扩增标准曲线在2×10~0～2×10~5 cfu·m L-1有较好的线性关系，相关系数为0.999 6，能对沙门氏菌进行准确的定量分析。该方法在与国标方法对比检测灌溉水源中沙门氏菌污染时具有同等准确性。【结论】本研究建立的基于SYBR Green I嵌合荧光法的实时荧光定量PCR检测方法，可以满足灌溉水源中沙门氏菌的定量检测要求。
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引起种(蛋)鸭输卵管积液综合征的新发病毒-C型禽偏肺病毒
《福建农业学报 》 2023 CSCD
摘要：【目的】明确引起种（蛋）鸭特征性输卵管积液和产蛋下降的新发疫病[俗称种（蛋）鸭输卵管积液综合征]的病原。【方法】对自闽粤赣浙皖桂等地产蛋率较高的部分鸭群表现以输卵管内乳糜性积液、黏膜出血水肿增厚及不同程度产蛋下降为特征的病（死）麻鸭、樱桃谷种鸭和种番鸭中采集的样品（输卵管积液、输卵管黏膜、卵巢和肝脾脏器），开展鸭已知病原核酸监测、病原分离鉴定和开产麻鸭人工感染试验。【结果】细菌分离显示，输卵管积液里未分离到细菌，排除细菌感染引起；经病毒核酸监测，只有C型禽偏肺病毒（Avain metapneumoviurs subgroup C,aMPV/C）阳性，未检测到其他引起禽产蛋异常的病毒；以aMPV/C单一阳性的样品经鸭胚进行病毒分离与传代，发现接种鸭胚未见死亡，但胚体表面稍水肿和出血、肝脏出血；对第5代鸭胚液进行RT-PCR检测，结果显示a MPV/C分离阳性率为72.2%；对获得的4株分离株（JX2126、FJ2228、FJ2375和GD2381株）的基因片段进行测序和序列分析发现，该片段与最早报道的番鸭a MPV/C法国分离株（Muscovy duck/1999/99 178/France）同源性最高，为96.1%，而与A、B、D型禽偏肺病毒（Avain metapneumoviurs subgroup A, B, D,aMPV/A, B, D）分离株的同源性仅分别为67.8%～68.7%、66.1%～66.8%和71.4%，与人偏肺病毒（Human metapneumoviurs,hMPV）分离株的同源性为67.7%～68.3%；遗传进化分析表明，以上4株分离株与a MPV/C处于同一进化分支上，而与其他亚型aMPV和hMPV亲缘关系较远；经开产麻鸭人工感染试验，成功复制出与自然感染病例相同的临床病症，并能回收到病毒。【结论】明确引起种（蛋）鸭输卵管积液综合征的病原为C型禽偏肺病毒。本研究为该病的快速准确诊断和精准防控提供科学依据。
关键词： 种(蛋)鸭 输卵管积液综合征 产蛋下降 输卵管积液 C型禽偏肺病毒 分离与鉴定
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基于HS-SPME-GC-MS分析茶树新品系‘白云0492’白茶香气特征成分
《食品科学 》 2023 EI 北大核心 CSCD
摘要：以茶树新品系‘白云0492’（又名白云特早茶）为供试品种加工白茶，‘福云6号’为对照，采取顶空固相微萃取-气相色谱-质谱联用技术进行香气检测分析，探究其特征香气成分。结果显示，6个白茶茶样中共检测出928个香气成分，其中具有花果香的乙酸壬酯可能是‘白云0492’品种特有的香气成分。相对气味活度值分析结果表明，β-紫罗兰酮、乙酸芳樟酯、芳樟醇、(Z)-癸-2-烯醛、大马士酮、橙花醛、柠檬醛为‘白云0492’与‘福云6号’白茶中的关键香气成分。基于正交偏最小二乘判别分析，‘白云0492’品种中的芳樟醇、苯甲酸甲酯、脱氢芳樟醇、乙酸壬酯、香茅酸、甲酸香叶酯等香气物质含量显著高于‘福云6号’（变量重要性投影>1、P<0.05）。结果表明，芳樟醇和苯甲酸甲酯是‘白云0492’白茶的重要香气成分，参与其毫香和花果香的构成。研究结果有利于全面了解‘白云0492’白茶的香气特征，为个性鲜明的‘白云0492’特色白茶产品研发提供科学依据。
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普城沙雷氏菌ACCC 02146产灵菌红素调控基因的鉴定
《福建农业学报 》 2023 CSCD
摘要：【目的】鉴定影响普城沙雷氏菌ACCC 02146产灵菌红素能力的基因，构建ACCC 02146的转座子突变体文库，为进一步研究普城沙雷氏菌ACCC 02146灵菌红素合成机制奠定基础。【方法】采用平板划线法从菌种保藏中心购买菌株和实验室保藏菌株中获得15株产灵菌红素的菌株。采用16S rRNA基因测序法鉴定各菌株，邻接建树将其分类，并比较不同类别菌株灵菌红素合成基因簇启动子序列差异，观察各菌株产色能力。对16S rDNA序列和灵菌红素合成基因簇启动子序列均有异于其他菌株的普城沙雷氏菌ACCC 02146合成灵菌红素的调控基因展开研究。构建ACCC 02146的转座子突变体文库，筛选出产色能力明显改变的克隆子并鉴定出对应的转座子插入突变基因。【结果】该突变体文库中有74个突变体表现出产灵菌红素能力的变化。其中25个突变体转座子插入发生在pigA、pigB、pigC、pigD和pigH等5个灵菌红素合成簇基因上，49个突变体转座子插入基因为灵菌红素合成基因簇之外的基因。在鉴定到的产色能力改变的突变体中，麦芽糖O-乙酰基转移酶基因突变菌株有6个，二氢乳清酸脱氢酶基因突变菌株有4个，MarR家族转录因子SlyA基因突变体有3个，winged helix家族的双组分转录调控因子RstA基因突变体有3个，H-醌氧化还原酶亚基I基因突变菌株有3个，NADH-醌氧化还原酶G链基因突变菌株有3个，肽基脯氨酰异构酶B基因突变菌株有3个，其他突变基因对应的克隆子数量为1～2个。【结论】在沙雷氏菌中，除了灵菌红素合成簇基因调控灵菌红素合成，推测灵菌红素合成簇外编码相关酶、转录调控因子和一些结构蛋白的基因通过直接或间接途径在不同程度上调控了灵菌红素的合成。
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水稻磷酸核酮糖激酶基因胁迫诱导表达分析与互作蛋白筛选
《农业生物技术学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：磷酸核酮糖激酶(phosphoribulokinase,PRK)是光合反应卡尔文-本森循环中的关键酶,影响植物的生长发育.但在水稻(Oryza sativa)中对PRK在逆境胁迫响应中的功能研究报道较少.本研究开展了OsPRK(GenBank No.LOC4330413)蛋白亚细胞定位、胁迫(干旱,高盐,高温)与激素(脱落酸,茉莉酸,水杨酸)处理后基因的表达分析及互作蛋白筛选,研究OsPRK在水稻逆境胁迫响应中的功能.瞬时表达实验表明,OsPRK定位于水稻原生质体叶绿体基质中.qPCR结果发现,水稻幼苗在干旱胁迫处理0.5与3 h时及高盐、高温处理1与6 h时,OsPRK的转录与表达受抑制.外源脱落酸和茉莉酸处理1 h时,幼苗OsPRK转录水平未受明显影响,但处理4 h后,随处理时间的延长OsPRK的转录水平持续降低;水杨酸处理过程中,OsPRK的转录水平在0~8 h持续急剧下降,其后缓慢下降趋势一直持续至24 h.利用蛋白互作MBP标签融合蛋白沉降(MBP pull-down)技术筛选到了82个与OsPRK存在互作关系的候选蛋白,其中67个候选蛋白为未知功能蛋白,15个为已知功能蛋白,包括糖酵解关键酶甘油醛-3-磷酸脱氢酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)、抗病相关R蛋白(resistance proteins)和WRKY转录因子(WRKY transcription factor).本研究从转录水平明确了OsPRK参与逆境胁迫与激素应答,并鉴定到多个与OsPRK可能互作的调控蛋白,为后续深入解析该基因在逆境胁迫中的生物学功能提供理论依据.
关键词： 水稻 磷酸核酮糖激酶(PRK) 胁迫应答
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九龙江流域丰水期表层沉积物还原性无机硫分布特征及其水库驱动机制
《环境科学学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：还原性无机硫(Reduced inorganic sulfur,RIS)是沉积物硫最活跃的组分,对水生态系统铁、磷以及重金属等元素的地球化学循环具有控制作用,目前氧化还原环境梯度变化明显的筑坝河流沉积物硫分布格局及其机理研究仍很缺乏.结合野外原位采样和室内连续分级提取,在九龙江流域梯级水库作用下,探究表层沉积物RIS赋存形态、含量及其空间分布格局.结果表明:九龙江表层沉积物RIS各组分含量从高到低排序为:黄铁矿硫(Pyrite-S)>酸可挥发性硫化物(AVS)>单质硫(ES),其中以Pyrite-S为主要赋存形态,在RIS中的占比为83%~90%.九龙江流域不同类型水体沉积物RIS含量大小顺序为:水库>支流>干流,其中北溪、西溪表层沉积物RIS分布与水库的空间布局高度匹配,大致呈现水库斑块化热点分布,而南溪沉积物RIS沿水流方向从上游至下游却呈逐渐增加趋势,表明梯级水库的拦截效应增强了 RIS在水库沉积物的累积强度.该结果增强了水库建设运行在流域尺度上对表层沉积物硫生物地化循环的影响认识,对九龙江流域的水环境保护与管理策略具有重要的理论和现实意义.
关键词： 沉积物 还原性无机硫 赋存形态 丰水期 水库 九龙江
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多花黄精种子萌发前后基因表达特征分析
《广西植物 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：多花黄精种子具有综合休眠现象,解析其种子萌发前后基因表达的变化,对探讨种子生理、打破休眠等具有重要作用.该研究基于高通量Illumina HiSeq 2500 测序技术,对萌发过程的 4 个阶段进行转录组测序及生物信息学分析,剖析萌发前后差异基因表达特征.结果表明:(1)通过 de novo组装,分别获得388 231个Transcripts和 178 319 个Unigenes.(2)萌发前后显著性差异表达的Unigenes有 11 817 个,其中上调的有6 405 个,下调的有5 412 个.(3)GO富集分析表明,上调与下调的差异基因均主要富集在生物过程和分子功能中,主要参与代谢过程、催化活性等.(4)KEGG富集分析表明,差异基因主要富集于核糖体、植物激素信号转导、淀粉和蔗糖代谢等通路中;上调的差异基因中富集在核糖体 231 个、植物激素信号转导56 个、淀粉和蔗糖代谢 76 个,下调的差异基因中富集在苯丙烷生物合成 48 个、植物激素信号转导 48 个、淀粉和蔗糖代谢 48 个;40 个差异基因参与了生长素通路中关键酶的合成;淀粉和蔗糖代谢通路中,编码蔗糖磷酸合酶等基因下调,而编码糖原磷酸化酶等基因则上调.该研究结果初步明确了植物激素信号转导与淀粉和蔗糖代谢在多花黄精种子萌发前后起着关键作用,并阐明了这两条通路上参与的关键基因,为多花黄精种子的生理、繁殖及育种等深入研究提供了参考.
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