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鳗源嗜水气单胞菌主要粘附素基因克隆表达及产物粘附功能分析

中国人兽共患病学报 2011 北大核心 CSCD

摘要:目的对致病性嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)ZN1的主要粘附素基因(major adhesin gene,Mah)进行克隆表达及产物粘附功能分析。方法在GenBank上对PCR产物进行序列分析和同源性序列比对。将Mah重组到pET-32a表达质粒并转化E.coliDE3(BL21),采用ELISA和Western-blot对表达产物进行分析。结果 DNA序列分析表明PCR产物包含一个1 074bp的完整阅读框架,编码357个氨基酸,N-端22个氨基酸残基构成疏水信号肽。与已知的嗜水气单胞菌主要粘附素基因同源率为70%。ELISA和Western-blot分析表明表达产物能被鼠抗ZN1主要外膜蛋白血清特异性识别。同时,表达产物及其免疫血清能够竞争性抑制和阻断ZN1菌对EPC细胞的粘附作用。结论 Mah是嗜水气单胞菌的主要粘附因子;基因表达的融合蛋白Mah-TrxA具有天然粘附素的粘附活性。

关键词: 嗜水气单胞菌 主要粘附素 粘附 克隆表达

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闽江水域水质时空分布探索性研究

农业系统科学与综合研究 2011 CSCD

摘要:依据2008-2009年11个采样点8个水质指标数据,运用主成分分析和聚类分析,对闽江水质时空分布进行探索性研究。通过统计分析将8个水质指标概括为2个主成分,在空间尺度上分为2组,重污染区和轻污染区,在时间尺度上分为2组,枯水期和丰水期。结果表明闽江上游污染较为严重,中游一直到下游污染程度呈下降趋势。经过福州市区后,由于汇入了大量的生活和生产污水造成污染,使闽江水质急剧下降。同时,闽江水质受该地区的降雨量影响较大,它亦随着水温的变化呈季节性变化,冬季的水质最差。

关键词: 闽江 水质 时空分布 主成分分析 聚类分析

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基于RAPD标记的福建省稻曲病菌遗传多样性分析

农业生物技术学报 2011 北大核心 CSCD

摘要:为了解福建省稻曲病菌群体的遗传多样性和遗传组成,应用随机扩增多态性RAPD(randomamplified polymorphic DNA)技术分析了来自福建省不同水稻种植区的102个稻曲病菌(Ustilaginoidea virens)的遗传多样性。从100条随机引物中筛选出10条扩增带清晰、重复性好的引物进行稻曲病菌多态性扩增,共扩增出157条带,多态性条带比率为82.17%,遗传距离变化范围为0.02~0.67。遗传多样性分析表明,福建省稻曲病菌具有丰富的遗传多样性,相对于其它地区而言,福建闽西地区分离的菌株遗传多样性水平最高PPB=76.43,H=0.2212,I=0.3383),晚稻分离的菌株群体遗传多样性(PPB=91.08,H=0.2402,I=0.3655)高于早稻群体(PPB=63.06,H=0.1892,I=0.2870)。聚类分析显示,在遗传距离0.349水平上,供试的所有菌株可被划分成7个遗传聚类组(R1~R7),聚类组R1为优势聚类组,包含有80个菌株,其内又存有一些亚组。这些菌株的聚类与菌株的地理来源及水稻品种无明显相关性。但是在遗传距离0.330水平上,来自宁化的10个菌株可被明显划分成早稻群体和晚稻群体。初步分析认为菌株的地理来源、水稻品种及其生长季节是影响福建省稻曲病菌遗传多样性的主要因素,在稻曲病菌的遗传变异以及该病的发生和流行中可能起重要的作用。

关键词: 水稻 稻曲病 稻曲病菌 RAPD 遗传多样性

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中国水仙花色相关基因的克隆与分析

南方农业学报 2011 CSCD

摘要:【目的】克隆并初步分析与中国水仙花色发育相关的八氢番茄红素合成酶(PSY)、八氢番茄红素脱氢酶(PDS)和番茄红素β-环化酶(LycB)等3个酶基因序列及结构,了解其花色形成的分子机制,为进一步研究中国水仙类胡萝卜素代谢基因工程奠定基础。【方法】以中国水仙花瓣的mRNA为模板,采用RT-PCR技术扩增PSY、PDS和LycB等3个关键酶基因的保守序列,并进行序列结构分析。【结果】分离得到的中国水仙PSY、PDS和LycB的保守序列长度分别为343、500和486bp,分别编码112、166、161个氨基酸。基因比对结果表明,推导氨基酸序列与已知其他不同植物均具有较高同源性,分别为76.5%~96.1%、69.8%~98.3%和77.3%~95.5%,且包含PSY、PDS和LycB酶的相关功能结构域,初步证明为目标基因,不同物种间的PSY、PDS和LycB基因具有相当高的保守性。编码蛋白预测结果发现,PSY、PDS和LycB虽然有部分疏水区域,但是不存在明显的跨膜结构域。【结论】研究结果为进一步了解中国水仙花色相关酶基因的调控功能及花瓣着色机理奠定分子基础。

关键词: 中国水仙 花色发育 PSY PDS LycB 类胡萝卜素

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清香型乌龙茶品质形成过程中儿茶素类和嘌呤碱指纹图谱变化规律

茶叶科学 2011 北大核心 CSCD

摘要:分别以铁观音、黄棪、金观音和黄观音品种春茶新梢为供试材料,对其新梢生育及清香型乌龙茶制作过程中的儿茶素类和嘌呤碱进行高效液相色谱检测分析,结果表明该方法的稳定性、精密度和重现性等符合茶样儿茶素类和嘌呤碱指纹图谱构建要求。运用指纹图谱数据处理软件ChemPattern 2.0专业版对所获得的指纹图谱数据进行相似度分析、聚类分析和主成分分析均可获得较为一致的模式识别结果。在茶树新梢生育过程中,各茶样指纹图谱存在较大差异,且能与清香型乌龙茶在制品(Work in process,WIP)指纹图谱相区分;采用聚类分析法(欧氏距离-近邻法),尤其是主成分分析法(Log变换数据预处理),可实现清香型乌龙茶在制品的品种鉴别。各茶树品种在新梢生育过程中以EGC含量变化最为明显,其次为EGCG和咖啡碱;在清香型乌龙茶制作过程中则以EGCG变化较为明显,其次为EGC。儿茶素类和嘌呤碱在新梢生育过程中含量及组成的动态变化较在清香型乌龙茶制作工艺中的变化更为明显。

关键词: 乌龙茶 指纹图谱 儿茶素 嘌呤碱

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水稻植株及其内生微生物磷脂脂肪酸生物标记异质性

热带作物学报 2011 CSCD

摘要:采用改良磷脂脂肪酸法分析水稻植物自身磷脂脂肪酸和其内生微生物磷脂脂肪酸生物标记异质性。结果表明,水稻植株和其内生微生物共有磷脂脂肪酸有直链磷脂脂肪酸20∶0、12∶0、16∶0、18∶0和支链磷脂脂肪酸如18∶3ω6с(6,9,12)、19∶0 CYCLOω8с、15∶1ω6с等,且在水稻中含量均低于30μg/g,在内生微生物中的含量高于30μg/g。水稻内生微生物独有磷脂脂肪酸主要为支链磷脂脂肪酸,共有22种如i20∶0、20∶1ω9с、12∶0 3OH等,含量差异很大,为0.91~11 481.25μg/g。对水稻内生微生物独有磷脂脂肪酸对应分析CA得到,遗传距离近的水稻品种其对应距离也近,CA载荷图显示内生微生物磷脂脂肪酸对应距离小于姨2的为多元分布,即该磷脂脂肪酸分布在多个水稻品种中;大于姨2的为单一分布,即仅在特定的水稻品种中分布,表明水稻内生微生物磷脂脂肪酸分布与水稻品种遗传有关。

关键词: 水稻 组培苗 内生微生物 磷脂脂肪酸 异质性

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Zn营养在果树生理代谢中的作用研究进展

果树学报 2011 北大核心 CSCD

摘要:锌(Zn)是果树生长所必需的微量元素,也是果树体内多种酶的辅助因子,与果树的光合、呼吸以及碳氮代谢等过程有关。本文总结了近几年来国内外果树Zn营养的研究成果,概述了Zn元素在果树组织器官中的存在形式、运输方式,根系Zn营养调节树体的Zn平衡,Zn含量自中、细生长根和骨干根到地上枝梢、叶片间处于顺浓度梯度,Zn作为叶绿体的组成成分影响光合作用,缺Zn导致植株体内根、茎、叶等器官生长发育受到抑制,叶面喷施Zn肥可以促进花粉萌发,有利于花粉管伸长,增加受精作用,提高坐果率,促进光合产物积累,果实膨大,改善果实风味。另外,还分析了Zn与其他元素的关系,描述了Zn对基因表达直接影响和Zn营养基因型的差异,提出了果树Zn营养研究展望。

关键词: 果树 Zn 生理 代谢

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不同施肥种类对土壤及脐橙中的重金属含量的影响

浙江农业学报 2011 北大核心 CSCD

摘要:为明确施用不同种类肥料后土壤及脐橙中的重金属含量的变化,特对种植年份为1997年和2002年的施用有机肥、化肥、沼肥后土壤及脐橙中的重金属Cr,Cu,Pb,Zn,As,Cd进行检测及相关性分析。结果表明:施用肥料后,有机肥区2002年的As,1997年的Cu和Pb,沼肥区2002年的Pb的含量高于对照;脐橙果实中只有重金属As和Cu存在显著差异(P<0.05),其中As的含量为有机肥区>化肥区>沼肥区,Cu含量为化肥区>有机肥=沼肥区;种植年份为1997年和2002年的土壤及脐橙中重金属的含量无显著差异;各施肥区土壤及脐橙中的重金属的含量均未超标。相关性分析显示,土壤—脐橙中Cu和Zn的含量在一定浓度范围内呈正相关,R2>0.9;As,Cr,Pb,Cd的含量未呈现规律性变化,R2<0.7。

关键词: 重金属 土壤 脐橙 相关性

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枇杷种质资源数量分类研究

园艺学报 2011 北大核心 CSCD

摘要:对国家果树种质福州枇杷圃的199份枇杷[Eriobotrya japonica(Thunb.)Lindl.]种质资源,应用数量分类学中的Q型聚类分析方法进行分类,并对86个性状进行R型聚类分析和主成分分析。Q型聚类分析将199份种质资源在L=87.31水平分为栽培品种和野生资源两大类,在L=34.92水平分为5个组群,组群内来源地相同的种质资源多聚为小组,显示出较近的亲缘关系;R型聚类分析结果将86个性状明显聚为3组,多数性状表现两两相关或关系密切;主成分分析表明,86个性状可简化为28个主因子,其累积贡献率达74.7%,根据28个因子载荷量,选出影响力比较大的性状58个。

关键词: 枇杷 种质资源 数量分类 聚类分析 主成分分析

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杨桃细菌性斑点病菌的ITS序列分析及PCR检测

农业生物技术学报 2011 北大核心 CSCD

摘要:由丁香假单胞菌(Pseudomonas syringaepv.averrhoi)引起的杨桃(Averrhoa carambola)细菌性斑点病是杨桃生产上的重要病害。本研究利用细菌16S~23SrDNA间的内源转录间隔区(internaltranscribedspacer,ITS)序列通用引物L1(5'-AGTCGTAACAACGTAGCCGT-3')和L2(5'-GTGCCAAGGCATCCACC-3')扩增参试菌株的基因组DNA;并对其PCR产物进行克隆测序,经多重比对分析后设计出杨桃细菌性斑点病菌的特异性引物PsaveF(5'-CTTATCGACGACTCAGCTGCG-3')和PsaveR(5'-TCATGCGTTGATCGTCAGGATC-3')。此引物可以从杨桃细菌性斑点病菌基因组DNA中扩增出373bp的特异性片段,而其余参试的细菌无扩增条带,该引物检测的灵敏度可达10pg,且可从自然发病的杨桃组织中扩增出特异性条带。表明该方法可以应用于杨桃细菌性斑点病的快速、灵敏、可靠的检测。此外,本研究对多种病原细菌的ITS序列进行比对分析,发现该病菌与核果树细菌性溃疡病菌Pseudomonas syringae pv.morsprunorum是近源种。该检测技术对杨桃细菌性斑点病害的控制有一定的实用意义。

关键词: 杨桃细菌性斑点病菌 ITS分析 分类 PCR检测

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