科研产出
武汉地区油蟠桃病毒种类的小RNA测序鉴定
《园艺学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要:为明确侵染湖北武汉地区油蟠桃的病毒种类,采用小RNA测序技术对采集的5份病害样品进行了鉴定分析。结果表明样品中含有桃相关黄症病毒属病毒(peach-associated luteovirus,PaLV)、桃病毒D(peach virus D,PeVD)和桃潜隐花叶类病毒(peach latent mosaic viroid,PLMVd)。采用RT-PCR技术对测序结果进行了验证,获得的PaLV、PeVD和PLMVd基因序列(GenBank登录号:OP244073、OP244074和OP244075)与GenBank中相应的PaLV分离物T01-2(MK361479)、PeVD分离物T02-1(MK361476)和PLMVd分离物HUEI-Ob166/1-1(MW046337)的核苷酸序列一致性为92.15%~98.59%。进一步利用PaLV、PeVD、PLMVd及其他6种桃病毒特异性引物对109份油蟠桃样品进行RT-PCR检测,仅检测到PLMVd、PaLV和PeVD,检出率依次为33.94%、29.36%和5.50%。PLMVd可能为侵染油蟠桃的优势类病毒。病毒和类病毒复合侵染率为22.93%,高于单一的侵染率,表明复合侵染可能是油蟠桃上病毒、类病毒侵染的主要形式。
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百合光信号转导调控因子LhSPA1基因的克隆和表达分析
《农业生物技术学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要:花青苷是百合(Lilium brownii var. viridulum)花色呈色的关键物质之一,其生物合成易受到多种环境因素的影响。SPA1 (suppressor of phyA-105)转录因子在植物光信号转导调控过程中扮演着重要角色。为了深入理解LhSPA1基因在光诱导东方百合(Lilium oriental hybrid)花青苷调控机制中的功能,本研究以东方百合品种'红马丁'为材料,对经过不同光照处理的百合花蕾中花青苷的含量差异进行比较,并对完全显色期的花蕾花被片进行超高效液相色谱串联质谱(ultra-high performance liquid chromatographytandem mass spectrometry, UPLC-MS/MS)检测;结合前期转录组数据,对LhSPA1基因进行克隆和生物信息学分析;利用qRT-PCR分析不同光照条件下花青苷生物合成相关基因的表达水平。结果表明,'红马丁'花被片中的主要呈色成分为矢车菊素和天竺葵素。遮光处理降低了百合花蕾中花青苷的积累。基因表达分析结果表明,遮光处理导致了花青苷生物合成相关基因的表达下调,但LhSPA1基因表达量显著高于正常光照条件(P<0.05)。LhSPA1基因(GenBank No. PQ499086)编码序列长度为2 931 bp,编码976个氨基酸。进化树分析结果表明,LhSPA1蛋白与单子叶植物玉米(Zea mays)的ZmSPA1蛋白的进化关系较近。序列分析表明,LhSPA1蛋白与其他物种的SPA1蛋白具有相似的保守结构域。亚细胞定位结果表明,LhSPA1蛋白荧光信号位于烟草(Nicotiana tabacum)细胞核中。在百合花被片中瞬时过表达LhSPA1和组成型光形态建成蛋白1 (constitutive photomorphogenic 1, COP1)基因会导致百合花色变浅。综上所述,LhSPA1基因可能在光诱导百合花青苷生物合成过程中发挥重要作用。本研究为解析光信号调控百合花青苷生物合成通路的分子机制提供了参考。
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山羊3BHSD基因多态性及其与繁殖性状的关联分析
《畜牧与兽医 》 2025 北大核心
摘要:旨在探究3β羟基类固醇脱氢酶(3β-hydroxysteroid dehydrogenase, 3BHSD)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)及其与繁殖性状的相关性。以500只黑头山羊母羊为研究对象,采集颈静脉血提取基因组DNA,利用全基因组重测序技术筛选山羊3BHSD基因SNPs位点,分析3BHSD基因的遗传多样性,并与山羊头胎、第二胎、第三胎和平均胎次产羔数,以及羔羊初生重进行关联分析。结果:共筛选到与产羔数相关的SNPs位点5个(g.96842543C>T、g.96846699T>C、g.96846704T>C、g.96847162T>C、g.96848096C>T),与初生重相关的SNPs位点4个(g.96841899C>T、g.96844274A>G、g.96844478G>A、g.96846360T>A),上述全部SNPs位点均符合哈代-温伯格(Hardy-Weinberg)平衡状态(P>0.05);关联分析显示,g.96842543C>T及g.96846704T>C位点与山羊头胎产羔数显著相关,g.96846699T>C位点与二胎产羔数显著相关,g.96847162T>C位点与头胎、三胎及平均胎次产羔数显著相关,g.96848096C>T位点与二胎及平均胎次产羔数显著相关;连锁不平衡结果显示,g.96842543C>T、g.96846704T>C及g.96847162T>C,g.96841899C>T与g.96844478G>A处于紧密连锁不平衡,但组合基因型间与性状关联分析差异不显著。本研究筛选出3BHSD基因中5个SNPs位点与山羊产羔数显著相关,4个SNPs位点与初生重显著相关,上述SNPs位点可作为山羊繁殖性状遗传改良的分子标记。
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体外靶向筛选小鼠精子特异性PRSS37基因最适siRNA
《生物技术 》 2025 北大核心 CSCD
摘要:[目的]细胞水平靶向筛选出小鼠精子特异性PRSS37基因的最适siRNA序列。[方法]构建PRSS37过表达载体pcDNA3.1-Kozak-3×Flag-PRSS37,并将其转染至GC-2细胞,通过Western Blot检测PRSS37的异位表达。基于PRSS37序列设计并合成3对siRNA序列,将PRSS37过表达载体和siRNA共转染于GC-2细胞,实时荧光定量PCR检测siRNA对PRSS37干扰效率,筛选最有效的siRNA。[结果]PRSS37过表达载体在GC-2细胞中成功表达,与对照组相比,实验组中PRSS37蛋白表达显著升高;设计合成的3对siRNA均能有效干扰PRSS37的表达,与未干扰组相比差异显著(P<0.05),其中siRNA-1干扰效率最高,干扰效率约为63%。[结论]成功实现了PRSS37在GC-2细胞中的异位表达,并在细胞水平筛选出小鼠PRSS37最适siRNA序列。
关键词: 丝氨酸蛋白酶37 表达载体 异位表达 siRNA 共转染 干扰效率
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小麦蛋白质二硫键异构酶基因家族的鉴定与表达
《生物技术通报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要:【目的】通过对小麦蛋白质二硫键异构酶PDIL基因家族成员进行鉴定及表达分析,分析其在小麦不同器官和不同发育时期以及响应生物和非生物胁迫中的表达模式,为明确小麦PDIL基因家族功能奠定基础。【方法】以模式植物拟南芥和禾本科作物大麦PDIL基因家族蛋白序列为诱饵,在基因组数据库对小麦PDIL家族基因进行全基因组鉴定,利用生物信息学方法对其基因的理化性质、系统进化、染色体位置及基因结构进行分析,并分析PDILs基因在小麦生长发育、生物及非生物逆境的表达模式。【结果】鉴定得到31个小麦PDIL基因家族成员均为亲水蛋白,其中26个为稳定蛋白;亚细胞定位预测表明,小麦PDIL蛋白主要分布在细胞质和叶绿体中,在内质网和细胞核中也有分布;小麦PDIL基因家族可分为7个进化分支,同一分支基因结构和保守基序相似或相同,非均匀分布在19个染色体上;小麦PDIL基因家族成员含有多种响应逆境胁迫以及与水杨酸(SA)、茉莉酸甲酯(MeJA)、赤霉素(GA)、脱落酸(ABA)和生长素(IAA)等5类植物激素相关的顺式作用元件,部分基因具有与昼夜节律控制以及种子特性调控相关的元件;转录组数据表明,TaPDIL4-1A、TaPDIL4-1B和TaPDIL4-1D在不同生长时期组织都有较高的表达量;转录组分析和RT-PCR结果显示,TaPDIL4-1B在禾谷镰刀菌侵染后相对表达量升高,TaPDIL1-4A在干旱胁迫下表达量提高。【结论】31个小麦PDIL基因家族成员在进化过程中具有保守性,不仅参与小麦品质形成,还广泛参与生物和非生物逆境调控,其中TaPDIL4-1B可能参与小麦赤霉病抗性的调控,TaPDIL1-4A可能参与小麦干旱胁迫的应答。
关键词: 小麦 PDIL基因家族 表达分析 生物胁迫 非生物胁迫
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不同极性溶剂提取对杨树桑黄功能成分及其抗氧化活性的影响
《食品工业科技 》 2025 北大核心 CSCD
摘要:为明确不同极性溶剂提取对杨树桑黄功能成分及生物活性的影响,以杨树桑黄子实体干粉为原料,采用4种不同溶剂(乙醇、丙酮、乙酸乙酯和复配溶剂)提取桑黄多酚类物质,测定其中活性成分、多酚组成及抗氧化活性等多种指标,并对其进行相关性分析。结果表明:丙酮提取物(AE)的得率、总多酚和三萜含量分别为12.91%、37.38%和8.11%,显著高于乙醇提取物(EE)、乙酸乙酯提取物(EAE)和复配溶剂提取物(MSE)(P<0.05);EE的总黄酮含量为14.90%,高于AE、EAE和MSE;而EAE的总甾醇含量为12.61%,高于EE、AE和MSE。桑黄多酚组分及含量测定实验结果发现,AE中原儿茶醛、原儿茶酸、咖啡酸和对香豆酸的含量分别为602.09、90.25、6.24和5.57μg/100 mg,显著高于EE、EAE和MSE(P<0.05),且7种酚酸总含量最高。此外,AE的ABTS+自由基清除率和脂质过氧化抑制能力高于EE、EAE和MSE,而其还原力和蛋白氧化损伤抑制能力显著高于EE、EAE和MSE(P<0.05);EAE的DPPH自由基清除率和β-胡萝卜素-亚油酸氧化抑制能力高于EE、AE和MSE,而其羟基自由基清除率和DNA氧化损伤保护能力显著高于EE、AE和MSE(P<0.05)。相关性分析结果表明,酚类化合物与抗氧化活性之间相关性较强。综上,丙酮溶剂对桑黄多酚的提取率高,其提取物主要多酚化合物含量高,且具有良好的抗氧化能力。本试验结果可为桑黄产品的开发利用提供理论依据。
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不同日龄非洲鸵鸟盲肠微生物多样性分析
《家畜生态学报 》 2025 北大核心
摘要:盲肠是机体消化粗纤维,促进营养物质发酵的主要部位,有着庞大的微生物群落,许多动物的盲肠微生物已被分析研究,而非洲鸵鸟的相关研究还未见报道。因此,本试验采用宏基因组学测序技术对7日龄、30日龄、60日龄和180日龄非洲鸵鸟盲肠中的微生物进行多样性分析。结果显示,非洲鸵鸟盲肠中的微生物群分布于9个菌门,16个菌纲,29个菌目,58个菌科和128个菌属,且随着日龄增加,盲肠中微生物的丰富度和多样性先增高后降低,其中60日龄时微生物最丰富,30日龄时微生物多样性最高。门水平上,7日龄、60日龄和180日龄均以厚壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria)为最优势菌门,而30日龄时的优势菌门为厚壁菌门、柔膜菌门(Tenericutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes);属水平上,各日龄盲肠中的优势菌属均不相同,7日龄时不动杆菌属(Acinetobacter)、大肠埃希氏菌-志贺菌属(Escherichia-Shigella)、阿克曼菌属(Ackermansia)丰度最高,30日龄时厌氧原体属(Anaeroplasma)和拟杆菌属(Bacteroides)丰度最高,不动杆菌属和假单胞菌属(Pseudomonas)分别为60日龄和180日龄时的优势菌属;各日龄盲肠中均存在差异菌群,7日龄、30日龄、60日龄和180日龄时分别有28个、24个、8个和6个差异菌群,随着日龄增大,差异菌群的数量逐渐减少。综上显示,非洲鸵鸟盲肠微生物复杂多样,且随着日龄的增加,微生物组成及优势物种会产生变化,这为进一步研究年龄对肠道微生物的影响以及肠道微生物与机体之间的相互作用提供理论依据。
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青贮桑叶替代全株玉米青贮对肉牛生长性能、屠宰性能、瘤胃发酵参数及肉品质的影响
《饲料研究 》 2025 北大核心
摘要:试验旨在研究青贮桑叶替代全株玉米青贮对肉牛生长性能、屠宰性能、瘤胃发酵参数及肉品质的影响。选择体重(320.00±4.25) kg、(12±1)月龄的西门塔尔牛40头,随机分为4组,每组10个重复,每个重复1头牛。对照组饲喂基础饲粮,Ⅰ组、Ⅱ组、Ⅲ组分别使用15%、30%、45%青贮桑叶替代基础饲粮中的全株玉米青贮。预试期10 d,正式试验期90 d。结果显示:Ⅲ组肉牛平均日增重显著低于对照组和Ⅰ组(P<0.05)。各试验组的平均日采食量均显著低于对照组(P<0.05)。Ⅰ组料重比显著低于对照组和Ⅲ组(P<0.05),且养殖效益最高。各试验组肉骨比均显著高于对照组(P<0.05),Ⅰ组的屠宰率显著高于Ⅱ组和Ⅲ组(P<0.05)。试验组的亮度(L*值)、红度(a*值)显著高于对照组(P<0.05),剪切力和滴水损失显著降低(P<0.05)。与对照组相比,试验组的氨态氮、总挥发性脂肪酸、乙酸的含量及乙丙比均显著增加(P<0.05)。研究表明,使用青贮桑叶替代全株玉米青贮虽然降低了西门塔尔牛的平均日采食量和平均日增重,但能够改善屠宰性能,促进瘤胃发酵,提高肉品质和养殖效益,适宜替代比例为15%。
关键词: 青贮桑叶 肉牛 生长性能 屠宰性能 瘤胃发酵 肉品质
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基于DNA条形码的黄精属植物遗传多样性分析
《种子 》 2025 北大核心 CSCD
摘要:采用DNA条形码技术对43份黄精属种质资源进行鉴定分析,以期为高效鉴别黄精属种质提供参考依据。结果表明,条形码ITS2扩增和测序成功率较低,其他3个条形码(trnH-psbA、matK、rbcL)均扩增成功,且测序成功率均在90%以上;序列秩和检验结果表明,种间变异差异显著,而种内变异差异不显著;系统发育和物种鉴定结果表明,独立条形码鉴定物种数量为1~2个,双组合条形码为3~4个,三组合条形码(rbcL+trnH-psbA+matK)可鉴定物种5个,鉴定支持率在86%以上,分辨率为71.43%。三组合条形码(rbcL+trnH-psbA+matK)鉴定黄精属物种成功率最高,其次为双组合条形码rbcL+matK。
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