科研产出
山羊环状RNA circ_0008219 SNPs位点与生产性能的关联分析
《中国畜牧杂志 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：实验旨在分析山羊环状RNA circ_0008219 序列中单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)位点与产羔、生长性状之间的关联性,为山羊分子育种提供新的遗传标记.选取波尔山羊、黑头羊和麻城黑山羊作为实验对象,利用SNaPshot分型技术分析候选SNPs位点的遗传多样性,并对circ_0008219 的SNPs位点与 3 个品种山羊的产羔性状和黑头羊的周岁生长性状进行关联分析.结果表明山羊circ_0008219 中存在 3 个SNPs位点均具有多态性.卡方适应性检测结果表明,g.1082G>T、g.1310A>G在 3 个山羊群体中均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),g.651G>A在波尔山羊和麻城黑山羊群体均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05).黑头羊群体中,g.651G>A位点与山羊周岁体高存在相关;g.1082G>T与周岁体重、周岁体斜长、周岁胸围和管围性状存在相关.关联分析结果显示,g.651G>A位点与黑头羊总体产羔数显著关联,g.1082G>T位点与波尔山羊头胎产羔数极显著关联.连锁不平衡分析表明,在波尔山羊群体中,g.1082G>T和g.1310A>G位点之间处于强连锁平衡状态(D'=1,r2=1);在黑头羊群体中,g.651G>A和g.1310A>G位点之间处于强连锁平衡状态(D'=1,r2=1);在麻城黑山羊群体中,g.651G>A和g.1310A>G位点之间处于强连锁平衡状态(D'=0.917,r2=1).本研究筛选出 3 个SNPs位点即g.651G>A、g.1082G>T和g.1310A>G,可以作为山羊育种的潜在遗传标记,该研究结果为山羊品种培育提供了理论依据.
关键词： circ_0008219 SNPs 山羊 繁殖性能 关联分析
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半纤维素分解菌群HMC的微生物群落结构及功能
《农业工程学报 》 2024 EI 北大核心 CSCD
摘要：为明确半纤维素分解菌群HMC(hemicellulolytic microbial consortium)的微生物群落结构及其在半纤维素降解中的潜在功能；该研究测定了其在降解半纤维素主链木聚糖及玉米芯的典型理化指标，并利用16S rDNA测序技术及生物信息学手段对其微生物群落结构及功能注释进行了宏基因组学分析。结果表明，HMC在7 d内能高效降解木聚糖和玉米芯，降解率达80%，木聚糖降解产生的高值产物包括还原糖、甲酸、乳酸及乙酸，最高浓度分别为1.30、0.50、1.19与1.23 mg/mL,HMC降解玉米芯时可累积挥发性脂肪酸浓度高达3.54 mg/mL。HMC是由厚壁菌门Firmicutes的多个属的微生物组成的复合微生物菌群，宏基因组分析揭示了HMC在木聚糖降解过程中的关键碳水化合物活性酶系；HMC的半纤维素降解酶系完整，包括19个木聚糖分解及下游产物代谢相关的酶；同时涵盖了乙酸、乳酸等半纤维素关键分解产物代谢相关的通路。HMC蕴含半纤维素及玉米芯高值生物转化的潜力，该研究为深入探究半纤维素在生物降解应用中的分子机制提供了重要线索，有助于推动天然半纤维素生物降解技术的发展。
关键词： 半纤维素 微生物群 降解 微生物群落结构 宏基因组学 还原糖 挥发性脂肪酸
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湖北省2个规模化蛋鸡养殖场环境细菌监测分析
《中国家禽 》 2024 北大核心
摘要：为了解蛋鸡养殖场环境中病原菌流行情况，试验采集湖北省不同地区2个规模化蛋鸡养殖场不同位置的空气、水线和饲料样品进行病原菌检测，并采用16S rDNA测序分析样品中的优势病原菌。结果显示：饲料样品中细菌总数符合《GB 13078—2017饲料卫生标准》，而鸡舍风机附近空气及水线中细菌总数均较高；空气中优势病原菌是芽孢杆菌和葡萄球菌，饲料和水线优势菌为芽孢杆菌。结果表明，规模化蛋鸡养殖场饲料中的芽孢杆菌易污染水线和空气，风机附近是细菌污染重点区域，应定期消毒。
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硒都黑猪NT5C1A基因核心启动子区鉴定及转录因子预测
《中国畜牧杂志 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：本研究旨在探究猪胞质5'核苷酸酶1A基因（Cytosolic 5'-Nucleotidase1A,NT5C1A）启动子区序列的结构特性，确定其核心启动子区并分析其关键转录因子结合位点，为探究其表达调控机制提供理论依据。对NT5C1A互作蛋白进行预测，在线生物信息学分析软件预测猪NT5C1A基因核心启动子区，根据预测结果设计7对启动子缺失片段引物，以硒都黑猪血液基因组DNA为模板，通过PCR扩增和Sanger测序方法获得NT5C1A基因5'端7个启动子缺失片段并克隆至pGL3-Basic载体，以双荧光素酶报告基因检测试验对缺失片段进行荧光素酶活性检测，并通过转录因子在线预测软件预测核心启动子区潜在的转录因子。结果表明，NT5C1A基因核心启动子位于转录起始位点-290～+109bp的位置（ATG作为+1），该区域含有MYOD1、MYOG、MYF5和SP1等肌肉发育相关的转录因子结合位点。本试验为研究NT5C1A基因调控猪肌肉发育的分子机制提供了理论依据。
关键词： 硒都黑猪 NT5C1A 核心启动子区 转录因子 生物信息学
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普通小麦Arableu#1白粉病成株抗性遗传解析
《中国农业科学 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：【目的】中国是世界上最重要的小麦生产国和消费国之一，确保小麦产量稳定对我国粮食安全具有重要意义。小麦白粉病是限制小麦产量的重要因素之一。选育抗病品种是控制该病害最经济、有效环保的途径，挖掘新成株抗性基因/位点为选育持久抗病小麦品种提供依据。【方法】由国际玉米小麦改良中心（CIMMYT）培育的普通小麦品系Arableu#1在苗期对白粉病表现为感病，而成株期呈现高水平抗性。为深入解析其抗病遗传机制，利用Arableu#1与高感品系Apav#1杂交，构建一个含有142个家系的F5重组自交系群体，采用基因分型测序（genotyping-by-sequencing,GBS）平台测序，获得4 298个在亲本间具有多态性的分子标记，并进行群体检测，所获基因型用于构建整个群体的遗传连锁图。【结果】结合白粉病连续2年田间表型和基因型数据，使用IciMapping 4.1对田间病害严重度、病程曲线下面积（AUDPC）和病害多年平均严重度（MFDS）等性状进行QTL定位分析，在该群体中定位了4个来自Arableu#1的白粉病成株抗性位点，分别位于染色体1BL、5BL、6BS和7BL上，以及2个来自Apav#1的抗性位点，分别位于染色体2DS和4BL上，可解释白粉病表型变异介于3.1%—28.5%。6个位点聚合时的群体平均病害严重度达到各位点组合中的最低水平，QPm.hzau-1BL、QPm.hzau-4BL、QPm.hzau-5BL和QPm.hzau-7BL 4个位点聚合后的效应仅次于6个位点同时存在。【结论】将2个新位点QPm.hzau-5BL和QPm.hzau-7BL的两翼分子标记开发成KASP标记，经对570份世界各地育成品种或地方品种检测，2个位点单独存在或聚合在一起时均表现出不同程度的白粉病抗性，且这两个位点在我国小麦材料中的分布频率较CIMMYT的小麦种质中低。获得1个可能同时聚合6个白粉病抗性位点家系，其田间白粉病抗性可达近免疫水平。
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单细胞RNA测序在畜禽遗传育种中的研究进展
《畜牧与兽医 》 2024 北大核心
摘要：单细胞RNA测序(single cell RNA sequencing,scRNA-seq)是在单细胞水平上实现高通量测序的技术,可以用来研究特定细胞亚群基因表达的异质性,帮助我们识别未知或稀有的细胞类型,并为进一步的研究奠定基础.scRNA-seq技术的进步使其在肿瘤、临床医学和发育生物学等领域得到了广泛应用,但在畜禽育种中的研究还较少.本文介绍了scRNA-seq一般流程,着重阐述了其在畜禽的生殖分化、毛囊发育和肌肉生成等方面的研究现状以及前景,以期为scRNA-seq在畜禽遗传育种中的研究和应用提供理论依据.
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草地贪夜蛾与东方黏虫的耐寒性及其在长江中下游地区越冬情况比较
《中国植保导刊 》 2024 北大核心
摘要：草地贪夜蛾和东方黏虫均为我国农业重大害虫,两者具有相似的寄主和生态位,存在种间竞争.通过室内低温模拟试验、冬季室外笼罩试验及田间调查,比较了草地贪夜蛾与东方黏虫的耐寒性,以及两者在长江中下游地区越冬情况的差异.研究发现:东方黏虫幼虫在7℃的平均存活时间是草地贪夜蛾的5.7~5.8倍,在0 ℃是草地贪夜蛾的4.2~7.2倍.在7℃,草地贪夜蛾的蛹在28 d内全部死亡,东方黏虫的蛹存活可超过28d;在0℃,草地贪夜蛾的蛹最多存活14 d,东方黏虫的蛹存活可超过14 d.冬季在武汉室外笼罩3个月后,发现有存活的东方黏虫幼虫,未发现存活的草地贪夜蛾.在长江中下游的几个典型区域均发现了田间越冬存活的东方黏虫幼虫、蛹或成虫,而未发现活体草地贪夜蛾.上述结果表明,东方黏虫比草地贪夜蛾更耐寒,在长江中下游地区可以越冬,草地贪夜蛾在该区域无法越冬,这导致翌年春季作物上东方黏虫可能早于草地贪夜蛾出现,使其在种间竞争的初期占据优势.该结论为研究入侵物种(草地贪夜蛾)与本地物种(东方黏虫)的种间竞争提供了依据.
关键词： 草地贪夜蛾 东方黏虫 耐寒性 越冬 长江中下游地区 种间竞争
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饲粮代谢能和粗蛋白水平对产蛋后期双莲鸡生产性能、蛋品质和肝脏脂代谢的影响
《中国家禽 》 2024 北大核心
摘要：试验旨在研究饲粮不同代谢能和粗蛋白水平对产蛋后期双莲鸡配套系生产性能、蛋品质、肝脏脂代谢的影响。试验选取240只健康、体重及产蛋率接近的40周龄双莲鸡产蛋母鸡，随机分为6组，每组4个重复，每个重复10只鸡。试验采取2×3双因素设计，代谢能（ME）设定为11.30和10.88 MJ/kg两个水平，粗蛋白（CP）设定为16.2%、15.2%和14.2%三个水平，预试期2周，正试期12周。结果显示：(1)粗蛋白水平对产蛋率、料蛋比、平均蛋重无显著影响（P>0.05），但11.30 MJ/kg代谢能水平可显著降低51～54周龄双莲鸡产蛋率和平均日产蛋量（P<0.05），并显著增加平均蛋重（P<0.05）。(2)饲粮代谢能和粗蛋白互作极显著影响46周龄鸡蛋蛋白高度和哈氏单位（P<0.01），并显著影响50周龄鸡蛋蛋黄颜色（P<0.05）;10.88 MJ/kg代谢能水平54周龄鸡蛋哈氏单位、蛋黄比例显著高于11.30 MJ/kg代谢能水平（P<0.05），而46、54周龄鸡蛋蛋黄颜色和46、54周龄鸡蛋蛋壳厚度极显著低于11.30 MJ/kg代谢能水平（P<0.01）,50周龄蛋壳厚度显著低于11.30 MJ/kg代谢能水平（P<0.05）;16.2%粗蛋白水平46周龄鸡蛋哈氏单位显著高于14.2%粗蛋白水平（P<0.05），而54周龄鸡蛋蛋黄比例极显著低于15.2%和14.2%粗蛋白水平（P<0.01）。(3)10.88 MJ/kg代谢能水平双莲鸡血清、肝脏甘油三酯水平，肝脏相对重量和腹脂相对重量以及肝脏脂肪酸合成相关基因如SREBP-1c、ACACA、FAS、SCD1表达量均显著低于11.30 MJ/kg代谢能水平（P<0.01）。综合分析，本试验条件下双莲鸡配套系蛋鸡产蛋后期（42～54周龄）代谢能和粗蛋白水平分别以10.88 MJ/kg和16.2%为宜。
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鄂东大别山区野生豆科牧草资源调查与评价
《草业学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为开发利用野生豆科牧草资源，2017-2021年对分布于鄂东大别山区的野生豆科牧草资源现状、属种、植物区系、生活型及饲用价值进行了调查统计与分析。结果表明：鄂东大别山区豆科牧草资源分属于34属77种，以少种属和单种属为主体，占资源总数的91%。资源中包括6个中国特有种，2个中国珍稀濒危种，23个栽培牧草野生种及野生近缘种。区系地理成分以温带和热带为主要分布型，分别占总属种的47%和38%。生活型以多年生草本和灌木为主，占资源总数的70%。资源中饲用品质优良的占79%，其余均在中等以上。
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绿壳蛋鸡群体SLCO1B3基因分型及其蛋壳颜色分析
《中国畜牧杂志 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：本文旨在探究周龄和绿壳基因型对蛋壳颜色的影响。对585只产绿壳蛋母鸡进行绿壳基因分型，结果表明O/O型个体比例为48.5%,O/o型个体比例为51.5%；使用色差仪对实验群体30周龄与40周龄的蛋壳颜色进行测量，分析结果表明：无论是对整体，还是对O/O型与O/o型的蛋壳颜色进行分析，40周龄L值较30周龄均极显著升高，可将L值的极显著升高作为绿壳颜色随产蛋周龄递增的变化规律；在同一产蛋时期，本实验群体O/O型蛋壳颜色a值极显著低于O/o型，感观呈现为蛋壳颜色更深更绿，且不同绿壳基因型的5种亲本组合方式的子代母鸡（即本实验群体）a值在同周龄的组间比较中存在极显著差异，这暗示可将a值作为衡量绿壳颜色深浅程度的重要指标，利用a值可能对后续蛋壳颜色分级的研究及绿壳蛋鸡的选育提供一定的参考借鉴。
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