科研产出
橡胶灵芝菌(Ganoderma pseudoferreum)DNA条形码检测筛选（英文）
《热带作物学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：选用10对DNA条形码标准序列ITS、COI、nrDNA-LSU、nrDNA-SSU和trnL DNA对海南和云南红根病区分离的21个橡胶灵芝菌进行检测。除COI和trnLDNA外,其他8对引物均扩增得到PCR产物,产物大小范围为268～1355bp,种内相似度为98.05%～99.54%。分别将扩增得到的序列与GenBank公布上的Ganoderma属和常见真菌属序列,共77个ITS、74个nrDNA-LSU和74个nrDNA-SSU序列进行系统进化树构建与分析。结果表明:nrDNA-LSU序列和nrDNA-SSU序列种间差异较小,不能准确区分Ganoderma属及其他属;5对ITS序列均能区分Ganoderma属,但仅ITS1/ITS4序列能将Ganoderma属下16个种归入不同分支。ITS1/ITS4序列表现出适宜的种内与种间差异,适宜作为G. pseudoferreum的DNA条形码。
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3种大顶苦瓜种质种子脂溶性成分比较鉴定
《粮食与油脂 》 2018 北大核心
摘要：以3种大顶苦瓜种质为材料,经气相色谱-质谱分析研究种子脂溶性化学成分及相对含量差异。结果表明,不同材料间脂溶性化学成分种类和相对含量存在一定程度的差异。从Y128、Y129和Y135中分别鉴定出22、25、19种化合物,分别占脂溶性总量的93.39%、80.00%、76.51%。1种脂溶性化学成分为Y128中特有。4种脂溶性化学成分为Y129中特有。5种脂溶性化学成分为Y135中特有。其中主要化学成分为杜英甾醇、25,26-二氢杜英甾醇、γ-生育酚和维生素E为苦瓜种质资源评价和产品开发利用提供依据。
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玉米SRO基因家族的鉴定及表达分析
《中国农业科学 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：【目的】SRO(similar to rcd one)是植物所特有的一类小蛋白家族,其在植物的生长发育,及应对非生物胁迫中发挥着重要功能。基于玉米全基因组数据库,鉴定玉米SRO家族基因,分析其序列、基因定位、蛋白结构及其系统进化关系,同时解析Zm SROs在玉米组织表达特异性及其在高盐和干旱胁迫下的表达变化,为阐明SRO基因在玉米生长和逆境响应中的功能研究奠定基础。【方法】利用拟南芥SRO家族基因为探针,在玉米全基因组查找并下载玉米SRO基因序列,并从Maize GDB中获取玉米SRO基因相关信息,包括CDS、氨基酸序列及染色体位置等。通过生物信息学工具(GSDS2.0、Expasy-protparam、SOPMA、Plant-m PLoc、EMBL-EBI、MEME)对获得序列的基因结构、蛋白质分子量、等电点、二级结构、亚细胞定位、保守结构域、保守基序原件等进行预测和分析。同时利用Clustalx(1.83)和MEGA 6.0软件进行同源序列比对并构建系统进化树。运用实时荧光定量PCR技术分析玉米SRO组织表达特异性及其在高盐和干旱胁迫下SRO的表达变化情况。【结果】从玉米全基因组共鉴定6个SRO家族基因,分别命名为Zm SRO1a—Zm SRO1f。Zm SROs分布于第1、4、5和9染色体,包含2—5个内含子。序列分析发现CDS序列长度在1 215—1 791 bp;编码氨基酸数目为404—596 aa;分子量为45.23—66.78 k D;等电点为7.01—9.17。亚细胞定位分析发现Zm SRO1a/Zm SRO1b/Zm SRO1c/Zm SRO1d定位于叶绿体,Zm SRO1e则定位于过氧化氢酶体,Zm SRO1f定位于细胞核。系统进化树分析发现Zm SROs分为3个亚类,Ⅰa亚类包括Zm SRO1a/Zm SRO1b/Zm SRO1c,Ⅰb亚类包括Zm SRO1f,Ⅰc亚类包括Zm SRO1d/Zm SRO1e。保守结构域分析结果显示Zm SRO1a/Zm SRO1b/Zm SRO1c/Zm SRO1d/Zm SRO1e包含PARP和RST结构域,缺少WWE结构域,Zm SRO1f包含WWE和PARP催化中心,RST结构域缺失。Zm SROs蛋白共找到5个保守基序,命名为基序1—5。Zm SRO1a/Zm SRO1b/Zm SRO1c包含所有保守基序,Zm SRO1d/Zm SRO1e缺少保守基序3,Zm SRO1f缺少保守基序5。组织表达分析发现Zm SROs在根系特异性表达。高盐胁迫下,玉米根系中Zm SRO1a/Zm SRO1b/Zm SRO1c/Zm SRO1d/Zm SRO1e在1 h时显著上调表达,地上部中Zm SRO1a/Zm SRO1b/Zm SRO1d/Zm SRO1e均下调表达,而Zm SRO1f在处理6 h显著上调表达。干旱胁迫下,玉米根系Zm SRO1e在1 h显著上调表达,Zm SRO1f在24 h显著上调表达;地上部中Zm SRO1a/Zm SRO1b/Zm SRO1d/Zm SRO1e均下调表达。【结论】玉米SRO家族基因包含6个成员,被划分为3个亚类,6个Zm SROs在玉米根系中特异性表达,且可以不同程度地响应干旱和高盐胁迫。
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茄科植物A622基因的起源与进化
《分子植物育种 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：A622基因在烟草砒啶类生物碱生物合成中起重要作用,其在茄科植物中的起源和进化还未有报道。本研究鉴定得到该基因含有NmrA-like家族结构域,且该结构域几乎覆盖A622基因全长。通过搜索栽培烟草、番茄、辣椒,以及咖啡和拟南芥基因组,得到了92条NmrA-like家族成员。将A622基因与拟南芥基因单独聚类,发现拟南芥基因大体分为两大枝;与A622聚在一起的枝中,含有已鉴定功能的PR基因。通过CLANS聚类,得到包含已知A622基因和拟南芥PR基因的46条基因。采用最大似然法,将此类基因进行进一步聚类,得到一个包含A622基因的亚家族,该亚家族含有1条拟南芥基因、1条咖啡基因、2条烟草基因以及3条番茄基因。本研究为将来进一步研究A622在茄科植物中的功能提供基础;结合对拟南芥基因(AT4G39230)的功能及关键位点鉴定,将能进一步阐明茄科植物A622基因的起源与进化。
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控失尿素与普通尿素配施对水稻产量及氮肥利用效率的影响
《热带作物学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：为探讨控失尿素与普通尿素配施在海南省水稻上的应用效果,通过2016年和2017年两季田间试验,采用随机区组设计,以不施氮肥处理作为对照(CK),设置常规尿素(CU)与控失尿素(CLU)不同配施比例,在等氮量条件下,设100%CU、70%CU+30%CLU、50%CU+50%CLU、30%CU+70%CLU和100%CLU 5个处理,分析水稻叶绿素含量、稻谷产量及其构成因子、氮吸收累积量、氮肥利用效率以及经济效益等指标。结果显示,施氮显著增加稻谷产量,与CK相比,增幅为67.2%～82.0%(2016年)和36.7%～46.7%(2017年)。30%CU+70%CLU的稻谷产量和有效穗均显著高于100%CU处理,产量增幅为8.8%(2016年)和7.3%(2017年),有效穗数增幅为14.2%(2016年)和12.0%(2017年)。随着CLU所占比例的提高,水稻地上部氮吸收累积量、氮肥回收利用率和农学利用率均呈增加趋势。与100%CU处理相比,其余控失尿素处理的氮肥回收利用率增幅为12.3%～18.4%(2016年)和12.7%～17.7%(2017年),氮肥农学利用率增幅为20.8%～21.9%(2016年)和16.8%～23.5%(2017年)。随着CLU所占比例的提高,水稻总产值和相对净收益呈先增加后降低的趋势,30%CU+70%CLU处理达到最大。综上所述,在本试验条件下,30%CU+70%CLU能够获得较高的稻谷产量、氮肥利用效率及经济效益,其可作为该地区氮肥施用的推荐比例。
关键词： 水稻 普通尿素 控失尿素 配施 产量 氮肥利用效率
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辣椒基因组中XTH基因家族的鉴定与表达特征分析
《热带作物学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：为全面了解木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶(xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase,XTH)基因在辣椒基因组中的特征,利用生物信息学方法鉴定出了所有辣椒XTH基因家族成员,并对基因的结构、染色体定位、系统进化关系和保守结构域等进行了预测,同时基于转录组数据集分析了XTH基因在辣椒不同器官、不同发育时期果实中的表达特征。结果表明,辣椒XTH家族包含23个基因成员,不均衡分布在除10号染色体外的其余11条染色体上;23个基因包含1~5个不等的内含子;系统进化分析表明,辣椒XTH蛋白可分为3个亚家族;基因表达特征分析显示,大多数辣椒XTH的表达具有组织特异性,CaXTH2、CaXTH21、CaXTH13和CaXTH23极有可能与辣椒果实的膨大与成熟相关。本研究为深入了解辣椒XTH基因的功能奠定了基础。
关键词： 辣椒 木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶 基因表达 果实发育与成熟
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红掌花色表型分类研究
《北方园艺 》 2018 北大核心
摘要：以64份红掌种质的佛焰苞为试材,采用色差仪法,研究了L*、a*、b*值对红掌花色的影响,以期对64份红掌进行初步的分类,为红掌花色育种提供参考。结果表明:红掌佛焰苞上表面和下表面的L*、a*、b*值分别呈正相关,但上表面变幅大于下表面,因此利用上表面花色代表红掌佛焰苞花色。聚类分析将红掌花色分为7个色系:红色、橙色、粉色、棕色、淡粉色、白色、绿色,并整理了相关参数分布范围。进一步对其分布特点分析,发现颜色变化范围较大,且红色品种居多,而棕色、绿色为较为稀缺品种,但尚无蓝色、纯紫色、纯黄色等品种。
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海南临高辣椒主产区产量差及其限制因子分析
《热带作物学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：目前有关海南辣椒生产现状的研究极少,探索辣椒主产区产量差,同时分析其限制因子,能够为提高海南辣椒栽培水平提供理论基础。本研究对海南省临高县52个农户螺纹椒产量、施肥和管理情况进行调研,分析辣椒产量与各因子之间的关系。结果表明:高产组平均产量达62.64 t/hm~2,与低产组的产量差为46.5 t/hm~2。辣椒产量与复合肥投入基追比呈显著负相关,与复合肥投入量和农药使用次数呈显著正相关。此外,本试验区磷养分的投入过高,造成土壤磷的过量积累。该调查结果表明,调查区域应推广高氮高钾型复合肥,以减少土壤中磷的过量积累。低产农户提高复合肥用量和追肥比例,并加强病虫害防治,可提高产量。
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噻虫嗪在甘蔗和土壤中的残留行为及风险评估
《南方农业学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：【目的】研究噻虫嗪在甘蔗和土壤中的残留及消解动态,并评价噻虫嗪残留对消费者的健康风险和土壤中非靶标生物蚯蚓的环境风险,为噻虫嗪在甘蔗上的安全使用提供科学依据。【方法】分别于2015和2016年在海南和广西开展10%噻虫嗪颗粒剂在甘蔗和土壤中的残留消解试验和最终残留试验,并根据蔗茎和土壤中噻虫嗪及其代谢物噻虫胺的残留量,评估其对人类急慢性膳食暴露风险和对非靶标生物蚯蚓的环境风险。【结果】噻虫嗪在甘蔗植株中的半衰期为8.4～18.2 d,在土壤中的半衰期为17.3～22.4 d;甘蔗蔗梢和蔗茎中噻虫嗪及其代谢物噻虫胺的最终残留量均低于定量限(LOQ)(0.05 mg/kg),但施用高剂量562.5 g a.i/ha后,收获期土壤中噻虫嗪残留量高于LOQ,达0.146～0.153 mg/kg;噻虫嗪和噻虫胺对我国一般人群的估计每日摄入量(EDI)仅为每日允许摄入量(ADI)的0.0039%～0.0049%,估计短期摄入量(ESTI)仅为急性参考剂量(ARfD)的0.17%～0.29%;噻虫嗪对蚯蚓的风险商(RQ)<0.01,噻虫胺对蚯蚓的RQ=0.016。【结论】在甘蔗苗期按照375.0～562.5 g a.i/ha沟施10%噻虫嗪颗粒剂1～2次,甘蔗中噻虫嗪和噻虫胺的最终残留量低于我国和国际食品法典委员会(CAC)的最大残留限量(MRL)标准,且该残留对人类健康的急慢性暴露风险在可接受范围之内;但建议该产品在甘蔗上登记使用时注意其代谢物噻虫胺对土壤非靶标生物蚯蚓的环境风险。
关键词： 噻虫嗪 代谢物噻虫胺 甘蔗 土壤 残留行为 风险评估
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